Produksi Pigmen dan Identifikasi Kapang Penghasilnya Menggunakan Pendekatan DNA Barcoding

Kapang endofit laut diketahui sebagai sumber berbagai senyawa bioaktif yang berguna bagi kesehatan. Penelitian yang telah dilakukan sebelumnya membuktikan bahwa kapang endofit isolat RS3 asal tanaman pesisir <em>Hydnophytum formicarum</em> asal Sorong menghasilkan pigmen hitam dengan pot...

Full description

Bibliographic Details
Main Authors: Mada Triandala Sibero, Kustiariyah Tarman, Ocky Karna Radjasa, Agus Sabdono, Agus Trianto, Tiara Ulfa Bachtiarini
Format: Article
Language:English
Published: Bogor Agricultural University 2018-04-01
Series:Jurnal Pengolahan Hasil Perikanan Indonesia
Subjects:
Online Access:http://journal.ipb.ac.id/index.php/jphpi/article/view/21454
id doaj-b242625b993842a4863a46677cd769f8
record_format Article
spelling doaj-b242625b993842a4863a46677cd769f82020-11-25T02:20:52ZengBogor Agricultural UniversityJurnal Pengolahan Hasil Perikanan Indonesia2303-21112354-886X2018-04-012119910810.17844/jphpi.v21i1.2145414056Produksi Pigmen dan Identifikasi Kapang Penghasilnya Menggunakan Pendekatan DNA BarcodingMada Triandala Sibero0Kustiariyah Tarman1Ocky Karna Radjasa2Agus Sabdono3Agus Trianto4Tiara Ulfa Bachtiarini5Manajemen Sumberdaya Pantai, Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan, Universitas DiponegoroDepartemen Teknologi Hasil Perairan, Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan, Institut Pertanian Bogor Divisi Bioteknologi Kelautan, Pusat Kajian Sumberdaya Pesisir dan Lautan, Institut Pertanian BogorLaboratorium Bioteknologi Laut Tropis, Gedung Laboratorium Kelautan dan Oseanografi Lt. 2, Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan, Universitas Diponegoro, Kampus Tembalang Departemen Ilmu Kelautan, Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan, Universitas DiponegoroLaboratorium Bioteknologi Laut Tropis, Gedung Laboratorium Kelautan dan Oseanografi Lt. 2, Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan, Universitas Diponegoro, Kampus Tembalang Departemen Ilmu Kelautan, Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan, Universitas DiponegoroLaboratorium Bioteknologi Laut Tropis, Gedung Laboratorium Kelautan dan Oseanografi Lt. 2, Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan, Universitas Diponegoro, Kampus Tembalang Departemen Ilmu Kelautan, Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan, Universitas Diponegoro 6 Laboratorium Bahan Alam Laut, Gedung UPT Laboratorium Terpadu, Universitas Diponegoro,Laboratorium Bioteknologi Laut Tropis, Gedung Laboratorium Kelautan dan Oseanografi Lt. 2, Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan, Universitas Diponegoro, Kampus Tembalang Departemen Ilmu Kelautan, Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan, Universitas DiponegoroKapang endofit laut diketahui sebagai sumber berbagai senyawa bioaktif yang berguna bagi kesehatan. Penelitian yang telah dilakukan sebelumnya membuktikan bahwa kapang endofit isolat RS3 asal tanaman pesisir <em>Hydnophytum formicarum</em> asal Sorong menghasilkan pigmen hitam dengan potensi sebagai fotoprotektor namun pada penelitian tersebut tidak memiliki data mengenai produksi pigmen serta identifikasi kapang penghasilnya. Penelitian ini bertujuan untuk menentukan produksi pigmen hitam asal kapang RS3 dan identifikasi kapang RS3 melalui pendekatan DNA barcoding. Kapang RS3 dikultivasi selama 30 hari menggunakan sistem statis dan sistem shaking. DNA barcoding pada identifikasi kapang<br />RS3 menggunakan primer universal ITS1 dan ITS4 untuk mengamplifikasi wilayah <em>internal transcribed space</em>r (ITS) yang menjadi conserve region pada kingdom fungi. Hasil penelitian menunjukkan bahwa kapang RS3 yang dikultivasi menggunakan sistem shaking mulai memproduksi pigmen pada hari-6 dan mencapai produksi tertinggi pada hari ke-18 (2,42±0,03 mg/L) sedangkan pada kultivasi sistem statis rendemen pigmen terbesar dihasilkan pada hari ke-30 (2,88±0,21 mg/L). Berdasarkan hasil analsis ITS rDNA diketahui bahwa kapang endofit RS3 memiliki 99% kemiripan dengan Annulohypoxylon stygium. Kapang ini telah didaftarkan di GeneBank denga nomer akses  MG605083.1.<br /><br />http://journal.ipb.ac.id/index.php/jphpi/article/view/21454Annulohypoxylon, DNA barcoding, endofit, pigmen.
collection DOAJ
language English
format Article
sources DOAJ
author Mada Triandala Sibero
Kustiariyah Tarman
Ocky Karna Radjasa
Agus Sabdono
Agus Trianto
Tiara Ulfa Bachtiarini
spellingShingle Mada Triandala Sibero
Kustiariyah Tarman
Ocky Karna Radjasa
Agus Sabdono
Agus Trianto
Tiara Ulfa Bachtiarini
Produksi Pigmen dan Identifikasi Kapang Penghasilnya Menggunakan Pendekatan DNA Barcoding
Jurnal Pengolahan Hasil Perikanan Indonesia
Annulohypoxylon, DNA barcoding, endofit, pigmen.
author_facet Mada Triandala Sibero
Kustiariyah Tarman
Ocky Karna Radjasa
Agus Sabdono
Agus Trianto
Tiara Ulfa Bachtiarini
author_sort Mada Triandala Sibero
title Produksi Pigmen dan Identifikasi Kapang Penghasilnya Menggunakan Pendekatan DNA Barcoding
title_short Produksi Pigmen dan Identifikasi Kapang Penghasilnya Menggunakan Pendekatan DNA Barcoding
title_full Produksi Pigmen dan Identifikasi Kapang Penghasilnya Menggunakan Pendekatan DNA Barcoding
title_fullStr Produksi Pigmen dan Identifikasi Kapang Penghasilnya Menggunakan Pendekatan DNA Barcoding
title_full_unstemmed Produksi Pigmen dan Identifikasi Kapang Penghasilnya Menggunakan Pendekatan DNA Barcoding
title_sort produksi pigmen dan identifikasi kapang penghasilnya menggunakan pendekatan dna barcoding
publisher Bogor Agricultural University
series Jurnal Pengolahan Hasil Perikanan Indonesia
issn 2303-2111
2354-886X
publishDate 2018-04-01
description Kapang endofit laut diketahui sebagai sumber berbagai senyawa bioaktif yang berguna bagi kesehatan. Penelitian yang telah dilakukan sebelumnya membuktikan bahwa kapang endofit isolat RS3 asal tanaman pesisir <em>Hydnophytum formicarum</em> asal Sorong menghasilkan pigmen hitam dengan potensi sebagai fotoprotektor namun pada penelitian tersebut tidak memiliki data mengenai produksi pigmen serta identifikasi kapang penghasilnya. Penelitian ini bertujuan untuk menentukan produksi pigmen hitam asal kapang RS3 dan identifikasi kapang RS3 melalui pendekatan DNA barcoding. Kapang RS3 dikultivasi selama 30 hari menggunakan sistem statis dan sistem shaking. DNA barcoding pada identifikasi kapang<br />RS3 menggunakan primer universal ITS1 dan ITS4 untuk mengamplifikasi wilayah <em>internal transcribed space</em>r (ITS) yang menjadi conserve region pada kingdom fungi. Hasil penelitian menunjukkan bahwa kapang RS3 yang dikultivasi menggunakan sistem shaking mulai memproduksi pigmen pada hari-6 dan mencapai produksi tertinggi pada hari ke-18 (2,42±0,03 mg/L) sedangkan pada kultivasi sistem statis rendemen pigmen terbesar dihasilkan pada hari ke-30 (2,88±0,21 mg/L). Berdasarkan hasil analsis ITS rDNA diketahui bahwa kapang endofit RS3 memiliki 99% kemiripan dengan Annulohypoxylon stygium. Kapang ini telah didaftarkan di GeneBank denga nomer akses  MG605083.1.<br /><br />
topic Annulohypoxylon, DNA barcoding, endofit, pigmen.
url http://journal.ipb.ac.id/index.php/jphpi/article/view/21454
work_keys_str_mv AT madatriandalasibero produksipigmendanidentifikasikapangpenghasilnyamenggunakanpendekatandnabarcoding
AT kustiariyahtarman produksipigmendanidentifikasikapangpenghasilnyamenggunakanpendekatandnabarcoding
AT ockykarnaradjasa produksipigmendanidentifikasikapangpenghasilnyamenggunakanpendekatandnabarcoding
AT agussabdono produksipigmendanidentifikasikapangpenghasilnyamenggunakanpendekatandnabarcoding
AT agustrianto produksipigmendanidentifikasikapangpenghasilnyamenggunakanpendekatandnabarcoding
AT tiaraulfabachtiarini produksipigmendanidentifikasikapangpenghasilnyamenggunakanpendekatandnabarcoding
_version_ 1724869291878121472