Produksi Pigmen dan Identifikasi Kapang Penghasilnya Menggunakan Pendekatan DNA Barcoding
Kapang endofit laut diketahui sebagai sumber berbagai senyawa bioaktif yang berguna bagi kesehatan. Penelitian yang telah dilakukan sebelumnya membuktikan bahwa kapang endofit isolat RS3 asal tanaman pesisir <em>Hydnophytum formicarum</em> asal Sorong menghasilkan pigmen hitam dengan pot...
Main Authors: | , , , , , |
---|---|
Format: | Article |
Language: | English |
Published: |
Bogor Agricultural University
2018-04-01
|
Series: | Jurnal Pengolahan Hasil Perikanan Indonesia |
Subjects: | |
Online Access: | http://journal.ipb.ac.id/index.php/jphpi/article/view/21454 |
id |
doaj-b242625b993842a4863a46677cd769f8 |
---|---|
record_format |
Article |
spelling |
doaj-b242625b993842a4863a46677cd769f82020-11-25T02:20:52ZengBogor Agricultural UniversityJurnal Pengolahan Hasil Perikanan Indonesia2303-21112354-886X2018-04-012119910810.17844/jphpi.v21i1.2145414056Produksi Pigmen dan Identifikasi Kapang Penghasilnya Menggunakan Pendekatan DNA BarcodingMada Triandala Sibero0Kustiariyah Tarman1Ocky Karna Radjasa2Agus Sabdono3Agus Trianto4Tiara Ulfa Bachtiarini5Manajemen Sumberdaya Pantai, Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan, Universitas DiponegoroDepartemen Teknologi Hasil Perairan, Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan, Institut Pertanian Bogor Divisi Bioteknologi Kelautan, Pusat Kajian Sumberdaya Pesisir dan Lautan, Institut Pertanian BogorLaboratorium Bioteknologi Laut Tropis, Gedung Laboratorium Kelautan dan Oseanografi Lt. 2, Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan, Universitas Diponegoro, Kampus Tembalang Departemen Ilmu Kelautan, Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan, Universitas DiponegoroLaboratorium Bioteknologi Laut Tropis, Gedung Laboratorium Kelautan dan Oseanografi Lt. 2, Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan, Universitas Diponegoro, Kampus Tembalang Departemen Ilmu Kelautan, Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan, Universitas DiponegoroLaboratorium Bioteknologi Laut Tropis, Gedung Laboratorium Kelautan dan Oseanografi Lt. 2, Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan, Universitas Diponegoro, Kampus Tembalang Departemen Ilmu Kelautan, Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan, Universitas Diponegoro 6 Laboratorium Bahan Alam Laut, Gedung UPT Laboratorium Terpadu, Universitas Diponegoro,Laboratorium Bioteknologi Laut Tropis, Gedung Laboratorium Kelautan dan Oseanografi Lt. 2, Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan, Universitas Diponegoro, Kampus Tembalang Departemen Ilmu Kelautan, Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan, Universitas DiponegoroKapang endofit laut diketahui sebagai sumber berbagai senyawa bioaktif yang berguna bagi kesehatan. Penelitian yang telah dilakukan sebelumnya membuktikan bahwa kapang endofit isolat RS3 asal tanaman pesisir <em>Hydnophytum formicarum</em> asal Sorong menghasilkan pigmen hitam dengan potensi sebagai fotoprotektor namun pada penelitian tersebut tidak memiliki data mengenai produksi pigmen serta identifikasi kapang penghasilnya. Penelitian ini bertujuan untuk menentukan produksi pigmen hitam asal kapang RS3 dan identifikasi kapang RS3 melalui pendekatan DNA barcoding. Kapang RS3 dikultivasi selama 30 hari menggunakan sistem statis dan sistem shaking. DNA barcoding pada identifikasi kapang<br />RS3 menggunakan primer universal ITS1 dan ITS4 untuk mengamplifikasi wilayah <em>internal transcribed space</em>r (ITS) yang menjadi conserve region pada kingdom fungi. Hasil penelitian menunjukkan bahwa kapang RS3 yang dikultivasi menggunakan sistem shaking mulai memproduksi pigmen pada hari-6 dan mencapai produksi tertinggi pada hari ke-18 (2,42±0,03 mg/L) sedangkan pada kultivasi sistem statis rendemen pigmen terbesar dihasilkan pada hari ke-30 (2,88±0,21 mg/L). Berdasarkan hasil analsis ITS rDNA diketahui bahwa kapang endofit RS3 memiliki 99% kemiripan dengan Annulohypoxylon stygium. Kapang ini telah didaftarkan di GeneBank denga nomer akses MG605083.1.<br /><br />http://journal.ipb.ac.id/index.php/jphpi/article/view/21454Annulohypoxylon, DNA barcoding, endofit, pigmen. |
collection |
DOAJ |
language |
English |
format |
Article |
sources |
DOAJ |
author |
Mada Triandala Sibero Kustiariyah Tarman Ocky Karna Radjasa Agus Sabdono Agus Trianto Tiara Ulfa Bachtiarini |
spellingShingle |
Mada Triandala Sibero Kustiariyah Tarman Ocky Karna Radjasa Agus Sabdono Agus Trianto Tiara Ulfa Bachtiarini Produksi Pigmen dan Identifikasi Kapang Penghasilnya Menggunakan Pendekatan DNA Barcoding Jurnal Pengolahan Hasil Perikanan Indonesia Annulohypoxylon, DNA barcoding, endofit, pigmen. |
author_facet |
Mada Triandala Sibero Kustiariyah Tarman Ocky Karna Radjasa Agus Sabdono Agus Trianto Tiara Ulfa Bachtiarini |
author_sort |
Mada Triandala Sibero |
title |
Produksi Pigmen dan Identifikasi Kapang Penghasilnya Menggunakan Pendekatan DNA Barcoding |
title_short |
Produksi Pigmen dan Identifikasi Kapang Penghasilnya Menggunakan Pendekatan DNA Barcoding |
title_full |
Produksi Pigmen dan Identifikasi Kapang Penghasilnya Menggunakan Pendekatan DNA Barcoding |
title_fullStr |
Produksi Pigmen dan Identifikasi Kapang Penghasilnya Menggunakan Pendekatan DNA Barcoding |
title_full_unstemmed |
Produksi Pigmen dan Identifikasi Kapang Penghasilnya Menggunakan Pendekatan DNA Barcoding |
title_sort |
produksi pigmen dan identifikasi kapang penghasilnya menggunakan pendekatan dna barcoding |
publisher |
Bogor Agricultural University |
series |
Jurnal Pengolahan Hasil Perikanan Indonesia |
issn |
2303-2111 2354-886X |
publishDate |
2018-04-01 |
description |
Kapang endofit laut diketahui sebagai sumber berbagai senyawa bioaktif yang berguna bagi kesehatan. Penelitian yang telah dilakukan sebelumnya membuktikan bahwa kapang endofit isolat RS3 asal tanaman pesisir <em>Hydnophytum formicarum</em> asal Sorong menghasilkan pigmen hitam dengan potensi sebagai fotoprotektor namun pada penelitian tersebut tidak memiliki data mengenai produksi pigmen serta identifikasi kapang penghasilnya. Penelitian ini bertujuan untuk menentukan produksi pigmen hitam asal kapang RS3 dan identifikasi kapang RS3 melalui pendekatan DNA barcoding. Kapang RS3 dikultivasi selama 30 hari menggunakan sistem statis dan sistem shaking. DNA barcoding pada identifikasi kapang<br />RS3 menggunakan primer universal ITS1 dan ITS4 untuk mengamplifikasi wilayah <em>internal transcribed space</em>r (ITS) yang menjadi conserve region pada kingdom fungi. Hasil penelitian menunjukkan bahwa kapang RS3 yang dikultivasi menggunakan sistem shaking mulai memproduksi pigmen pada hari-6 dan mencapai produksi tertinggi pada hari ke-18 (2,42±0,03 mg/L) sedangkan pada kultivasi sistem statis rendemen pigmen terbesar dihasilkan pada hari ke-30 (2,88±0,21 mg/L). Berdasarkan hasil analsis ITS rDNA diketahui bahwa kapang endofit RS3 memiliki 99% kemiripan dengan Annulohypoxylon stygium. Kapang ini telah didaftarkan di GeneBank denga nomer akses MG605083.1.<br /><br /> |
topic |
Annulohypoxylon, DNA barcoding, endofit, pigmen. |
url |
http://journal.ipb.ac.id/index.php/jphpi/article/view/21454 |
work_keys_str_mv |
AT madatriandalasibero produksipigmendanidentifikasikapangpenghasilnyamenggunakanpendekatandnabarcoding AT kustiariyahtarman produksipigmendanidentifikasikapangpenghasilnyamenggunakanpendekatandnabarcoding AT ockykarnaradjasa produksipigmendanidentifikasikapangpenghasilnyamenggunakanpendekatandnabarcoding AT agussabdono produksipigmendanidentifikasikapangpenghasilnyamenggunakanpendekatandnabarcoding AT agustrianto produksipigmendanidentifikasikapangpenghasilnyamenggunakanpendekatandnabarcoding AT tiaraulfabachtiarini produksipigmendanidentifikasikapangpenghasilnyamenggunakanpendekatandnabarcoding |
_version_ |
1724869291878121472 |