ДНК-идентификация сортов и видов козлятника (Galega) с применением SRAP-маркеров и рестрикционного анализа спейсера trnH–psbA

• Published in: Письма в Вавиловский журнал генетики и селекции
• Main Authors: КлименкоИ.А., Антонов А.А., Шамустакимова А.О., Золотарев В.Н.
• Format: Article
• Language: English
• Published: Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук» 2024-10-01
• Subjects: козлятник восточный; galega orientalis lam; генетическое разнообразие; srap-маркеры; днк-полиморфизм; генетический паспорт; днк-баркодирование; рестрикционный анализ
• Online Access: https://pismavavilov.ru/wp-content/uploads/2024/10/003-PVJ_Klimenko_10_3.pdf
• ISSN: 2686-8482

Козлятник широко используется в качестве лекарственного растения и на корм скоту, в биологическом земледе- лии и для получения биогаза. К настоящему времени в России создано 18 высокопродуктивных сортов козлятника восточно- го (Galega orientalis Lam.). Активная селекционная работа продолжается, однако отсутствуют надежные методы определения сортовой и видовой принадлежности. Цель наших исследований состояла в изучении потенциала SRAP-маркеров и метода рестрикционного анализа спейсера trnH–psbA для ДНК-идентификации сортов и видов рода Galega. Исследования по оценке меж- и внутрисортового генетического полиморфизма проведены на выборке из российских сортов козлятника восточного, включенных в Госреестр селекционных достижений Российской Федерации. С использованием восьми комбинаций SRAP- праймеров получены 283 фрагмента амплифицированной ДНК, из которых 105 (37.1 %) оказались полиморфными. Эффектив- ное число аллелей в среднем равнялось 1.37, показатель информационного содержания (PIC) – 0.787; средние значения ин- дексов генетического разнообразия по Нею (He) и Шеннона (I) составили соответственно 0.25 и 0.41. Кластеризация образцов методом главных координат разделила их на три группы в зависимости от происхождения и хозяйственного назначения при возделывании в различных регионах. Для сортов Вест и Юбиляр, выделившихся уникальными, сортоспецифичными амплико- нами, разработаны ДНК-паспорта. При амплификации с использованием практически всех комбинаций SRAP-праймеров вы- явлены существенные отличия в ДНК-профиле сорта Еля-Ты в сравнении с другими изучаемыми образцами. Для уточнения видовой принадлежности данного сорта был применен метод рестрикционного анализа ДНК-баркода trnH–psbA. Результаты исследования показали, что SRAP-маркеры можно успешно использовать для оценки генетического разнообразия и сортовой ДНК-идентификации козлятника восточного. Метод рестрикционного анализа спейсеров хлоропластной ДНК является эффек- тивным подходом для различения видов в составе рода Galega.