Genome bioinformatic analysis of nonsynonymous SNPs
<p>Abstract</p> <p>Background</p> <p>Genome-wide association studies of common diseases for common, low penetrance causal variants are underway. A proportion of these will alter protein sequences, the most common of which is the non-synonymous single nucleotide polymorp...
| الحاوية / القاعدة: | BMC Bioinformatics |
|---|---|
| المؤلفون الرئيسيون: | Todd John A, Smink Luc J, Cheng Tammy, Priego Eva-Maria, Worth Catherine L, Burke David F, Blundell Tom L |
| التنسيق: | مقال |
| اللغة: | الإنجليزية |
| منشور في: |
BMC
2007-08-01
|
| الوصول للمادة أونلاين: | http://www.biomedcentral.com/1471-2105/8/301 |
مواد مشابهة
Scrutinizing Deleterious Nonsynonymous SNPs and Their Effect on Human POLD1 Gene
حسب: Md. Nazmul Islam Bappy, وآخرون
منشور في: (2022-01-01)
حسب: Md. Nazmul Islam Bappy, وآخرون
منشور في: (2022-01-01)
Computational prediction of deleterious nonsynonymous SNPs in the CTNS gene: implications for cystinosis
حسب: Leila Adda Neggaz, وآخرون
منشور في: (2025-05-01)
حسب: Leila Adda Neggaz, وآخرون
منشور في: (2025-05-01)
Insilico prediction and functional analysis of nonsynonymous SNPs in human CTLA4 gene
حسب: Muhammad Irfan, وآخرون
منشور في: (2022-11-01)
حسب: Muhammad Irfan, وآخرون
منشور في: (2022-11-01)
A comprehensive in silico analysis of the deleterious nonsynonymous SNPs of human FOXP2 protein.
حسب: Mahmuda Akter, وآخرون
منشور في: (2022-01-01)
حسب: Mahmuda Akter, وآخرون
منشور في: (2022-01-01)
Dynamic insights into the effects of nonsynonymous polymorphisms (nsSNPs) on loss of TREM2 function
حسب: Raju Dash, وآخرون
منشور في: (2022-06-01)
حسب: Raju Dash, وآخرون
منشور في: (2022-06-01)
Comprehensive in silico characterization of nonsynonymous SNPs in the human ezrin (EZR) gene and their role in disease pathogenesis
حسب: Sadia Akter, وآخرون
منشور في: (2025-06-01)
حسب: Sadia Akter, وآخرون
منشور في: (2025-06-01)
A comprehensive in silico analysis of structural and functional impacts of natural nonsynonymous SNPs in the ALDH2_HUMAN gene
حسب: Mehr Ali Mahmood Janlou
منشور في: (2025-01-01)
حسب: Mehr Ali Mahmood Janlou
منشور في: (2025-01-01)
Constraining models of dominance for nonsynonymous mutations in the human genome.
حسب: Christopher C Kyriazis, وآخرون
منشور في: (2024-09-01)
حسب: Christopher C Kyriazis, وآخرون
منشور في: (2024-09-01)
First Report of Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) of the Leporine Shadow of Prion Protein Gene (<i>SPRN</i>) and Absence of Nonsynonymous SNPs in the Open Reading Frame (ORF) in Rabbits
حسب: Sameeullah Memon, وآخرون
منشور في: (2024-06-01)
حسب: Sameeullah Memon, وآخرون
منشور في: (2024-06-01)
Genic constraint against nonsynonymous variation across the mouse genome
حسب: George Powell, وآخرون
منشور في: (2023-09-01)
حسب: George Powell, وآخرون
منشور في: (2023-09-01)
Prediction and assessment of deleterious and disease causing nonsynonymous single nucleotide polymorphisms (nsSNPs) in human FOXP4 gene: An in-silico study
حسب: Md. Mostafa Kamal, وآخرون
منشور في: (2024-06-01)
حسب: Md. Mostafa Kamal, وآخرون
منشور في: (2024-06-01)
In Silico Identification and Functional Impact of Deleterious Nonsynonymous Single-Nucleotide Polymorphisms (nsSNPs) in Type 2 Diabetes–Associated Genes in South Asian Populations
حسب: Md. Hafizur Rahman, وآخرون
منشور في: (2024-01-01)
حسب: Md. Hafizur Rahman, وآخرون
منشور في: (2024-01-01)
A Bioinformatics Pipeline to Identify a Subset of SNPs for Genomics-Assisted Potato Breeding
حسب: Catja Selga, وآخرون
منشور في: (2020-12-01)
حسب: Catja Selga, وآخرون
منشور في: (2020-12-01)
Investigation of the impact of nonsynonymous mutations on thyroid peroxidase dimer.
حسب: Mst Noorjahan Begum, وآخرون
منشور في: (2023-01-01)
حسب: Mst Noorjahan Begum, وآخرون
منشور في: (2023-01-01)
Prediction of Deleterious Nonsynonymous Single-Nucleotide Polymorphism for Human Diseases
حسب: Jiaxin Wu, وآخرون
منشور في: (2013-01-01)
حسب: Jiaxin Wu, وآخرون
منشور في: (2013-01-01)
BIOINFORMATICS EVALUATION OF CRISP2 GENE SNPs AND THEIR IMPACTS ON PROTEIN
حسب: Zaid A. Hussein, وآخرون
منشور في: (2023-04-01)
حسب: Zaid A. Hussein, وآخرون
منشور في: (2023-04-01)
Integrating multiple genomic data to predict disease-causing nonsynonymous single nucleotide variants in exome sequencing studies.
حسب: Jiaxin Wu, وآخرون
منشور في: (2014-03-01)
حسب: Jiaxin Wu, وآخرون
منشور في: (2014-03-01)
Genetic Mapping of Millions of SNPs in Safflower (Carthamus tinctorius L.) via Whole-Genome Resequencing
حسب: John E. Bowers, وآخرون
منشور في: (2016-07-01)
حسب: John E. Bowers, وآخرون
منشور في: (2016-07-01)
Mycobacterial genomics and structural bioinformatics: opportunities and challenges in drug discovery
حسب: Vaishali P. Waman, وآخرون
منشور في: (2019-01-01)
حسب: Vaishali P. Waman, وآخرون
منشور في: (2019-01-01)
Insights on monkeypox disease and its recent outbreak with evidence of nonsynonymous missense mutation
حسب: Shaza M Elhusseiny, وآخرون
منشور في: (2023-08-01)
حسب: Shaza M Elhusseiny, وآخرون
منشور في: (2023-08-01)
Genome-wide interaction analysis between mitochondrial SNPs and nuclear SNPs on osteoporosis
حسب: Ya-Qian Hu, وآخرون
منشور في: (2016-10-01)
حسب: Ya-Qian Hu, وآخرون
منشور في: (2016-10-01)
SNPs occur in regions with less genomic sequence conservation.
حسب: John C Castle
منشور في: (2011-01-01)
حسب: John C Castle
منشور في: (2011-01-01)
Complete mitochondrial genome sequence of three Tetrahymena species reveals mutation hot spots and accelerated nonsynonymous substitutions in Ymf genes.
حسب: Mike M Moradian, وآخرون
منشور في: (2007-01-01)
حسب: Mike M Moradian, وآخرون
منشور في: (2007-01-01)
A systematic review of nonsynonymous single nucleotide polymorphisms in the renin–angiotensin–aldosterone system
حسب: Tomasz Rechciński, وآخرون
منشور في: (2022-12-01)
حسب: Tomasz Rechciński, وآخرون
منشور في: (2022-12-01)
Investigation of Outbreak-Specific Nonsynonymous Mutations on Ebolavirus GP in the Context of Known Immune Reactivity
حسب: Kerrie Vaughan, وآخرون
منشور في: (2018-01-01)
حسب: Kerrie Vaughan, وآخرون
منشور في: (2018-01-01)
Evolutionary dependency of cancer mutations in gene pairs inferred by nonsynonymous-synonymous mutation ratios
حسب: Dong-Jin Han, وآخرون
منشور في: (2024-08-01)
حسب: Dong-Jin Han, وآخرون
منشور في: (2024-08-01)
A genome-wide investigation of SNPs and CNVs in schizophrenia.
حسب: Anna C Need, وآخرون
منشور في: (2009-02-01)
حسب: Anna C Need, وآخرون
منشور في: (2009-02-01)
Sorted gene genealogies and species-specific nonsynonymous substitutions point to putative postmating prezygotic isolation genes in Allonemobius crickets
حسب: Suegene Noh, وآخرون
منشور في: (2016-02-01)
حسب: Suegene Noh, وآخرون
منشور في: (2016-02-01)
Bioinformatic identification of Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) in keratin-associated protein genes in alpacas (Vicugna pacos)
حسب: Deyanira Figueroa, وآخرون
منشور في: (2024-03-01)
حسب: Deyanira Figueroa, وآخرون
منشور في: (2024-03-01)
Characterization of gene expression profiles of esophageal cancer patients with different nonsynonymous tumor mutation burden
حسب: Jiawei Li, وآخرون
منشور في: (2020-08-01)
حسب: Jiawei Li, وآخرون
منشور في: (2020-08-01)
Slow and fast evolving endosymbiont lineages: positive correlation between the rates of synonymous and nonsynonymous substitution
حسب: Francisco J Silva, وآخرون
منشور في: (2015-11-01)
حسب: Francisco J Silva, وآخرون
منشور في: (2015-11-01)
Genotyping of SNPs in a Polyploid Genome by Pyrosequencing™
حسب: Andreas M. Rickert, وآخرون
منشور في: (2002-03-01)
حسب: Andreas M. Rickert, وآخرون
منشور في: (2002-03-01)
Prioritizing gut microbial SNPs linked to immunotherapy outcomes in NSCLC patients by integrative bioinformatics analysis
حسب: Muhammad Faheem Raziq, وآخرون
منشور في: (2025-03-01)
حسب: Muhammad Faheem Raziq, وآخرون
منشور في: (2025-03-01)
Detection of Nonsynonymous Single Variants in Human HLA-DRB1 Exon 2 Associated with Renal Transplant Rejection
حسب: Mohamed M. Hassan, وآخرون
منشور في: (2023-06-01)
حسب: Mohamed M. Hassan, وآخرون
منشور في: (2023-06-01)
Simultaneous analysis of all SNPs in genome-wide and re-sequencing association studies.
حسب: Clive J Hoggart, وآخرون
منشور في: (2008-07-01)
حسب: Clive J Hoggart, وآخرون
منشور في: (2008-07-01)
SARS-CoV-2 and ORF3a: Nonsynonymous Mutations, Functional Domains, and Viral Pathogenesis
حسب: Elio Issa, وآخرون
منشور في: (2020-06-01)
حسب: Elio Issa, وآخرون
منشور في: (2020-06-01)
A COI Nonsynonymous Mutation as Diagnostic Tool for Intraspecific Discrimination in the European Anchovy Engraulis encrasicolus (Linnaeus).
حسب: Anna Maria Pappalardo, وآخرون
منشور في: (2015-01-01)
حسب: Anna Maria Pappalardo, وآخرون
منشور في: (2015-01-01)
A nonsynonymous snp in a receptor protein kinase gene is associated with seed size variation in watermelon
حسب: Yu Guo, وآخرون
منشور في: (2026-05-01)
حسب: Yu Guo, وآخرون
منشور في: (2026-05-01)
Functional analysis of novel SNPs and mutations in human and mouse genomes
حسب: Tsai Ming-Fang, وآخرون
منشور في: (2008-12-01)
حسب: Tsai Ming-Fang, وآخرون
منشور في: (2008-12-01)
Genome-wide association study SNPs in the human genome diversity project populations: does selection affect unlinked SNPs with shared trait associations?
حسب: Amanda M Casto, وآخرون
منشور في: (2011-01-01)
حسب: Amanda M Casto, وآخرون
منشور في: (2011-01-01)
مواد مشابهة
-
Scrutinizing Deleterious Nonsynonymous SNPs and Their Effect on Human POLD1 Gene
حسب: Md. Nazmul Islam Bappy, وآخرون
منشور في: (2022-01-01) -
Computational prediction of deleterious nonsynonymous SNPs in the CTNS gene: implications for cystinosis
حسب: Leila Adda Neggaz, وآخرون
منشور في: (2025-05-01) -
Insilico prediction and functional analysis of nonsynonymous SNPs in human CTLA4 gene
حسب: Muhammad Irfan, وآخرون
منشور في: (2022-11-01) -
A comprehensive in silico analysis of the deleterious nonsynonymous SNPs of human FOXP2 protein.
حسب: Mahmuda Akter, وآخرون
منشور في: (2022-01-01) -
Dynamic insights into the effects of nonsynonymous polymorphisms (nsSNPs) on loss of TREM2 function
حسب: Raju Dash, وآخرون
منشور في: (2022-06-01)
