NSDPY: A python package to download DNA sequences from NCBI

Downloading large batches of DNA sequences can be useful to create custom databases containing for example sequences of a particular genomic region or a group of organisms. These sequences can be found on NCBI databases and accessed via a web browser (GUI) or directly via NCBI API. While the GUI is...

وصف كامل

التفاصيل البيبلوغرافية
الحاوية / القاعدة:	SoftwareX
المؤلفون الرئيسيون:	Raphaël Hebert, Emese Meglécz
التنسيق:	مقال
اللغة:	الإنجليزية
منشور في:	Elsevier 2022-06-01
الموضوعات:	NCBI Batch download CDS Python PyPI Taxonomy
الوصول للمادة أونلاين:	http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S235271102200036X

مواد مشابهة

Python Programming in PyPI for Translational Medicine
حسب: Yoshiyasu Takefuji
منشور في: (2021-11-01)

Set Operations in Python for Translational Medicine
حسب: Yoshiyasu Takefuji
منشور في: (2022-04-01)

SCORECOVID: A Python Package Index for scoring the individual policies against COVID-19
حسب: Yoshiyasu Takefuji
منشور في: (2021-11-01)

Downloading Web Pages with Python
حسب: William J. Turkel, وآخرون
منشور في: (2012-07-01)

Downloading Multiple Records Using Query Strings
حسب: Adam Crymble
منشور في: (2012-11-01)

CDSupdate: A meta-interface for ERA5 download request, management and storage
حسب: Andreia N.S. Hisi, وآخرون
منشور في: (2024-12-01)

Design and application of automatic calibration data download software for early warning network
حسب: Rongshuai He, وآخرون
منشور في: (2025-04-01)

“Plutchik”: artificial intelligence chatbot for searching NCBI databases
حسب: Shannon Bohle
منشور في: (2018-10-01)

PyOPAsolver: A python based tool for ordinal priority approach operations and normalization
حسب: Abdesadik Bendarag, وآخرون
منشور في: (2022-12-01)

Practical Evaluation of Multi-Source Coded Downloads
حسب: Patrik J. Braun, وآخرون
منشور في: (2019-01-01)

PCSIM: a parallel simulation environment for neural circuits fully integrated with Python
حسب: Dejan Pecevski, وآخرون
منشور في: (2009-05-01)

2D Simplified Wildfire Spreading Model in Python: From NumPy to CuPy
حسب: Daniel San Martin, وآخرون
منشور في: (2023-05-01)

A Cooperative Downloading Method for VANET Using Distributed Fountain Code
حسب: Jianhang Liu, وآخرون
منشور في: (2016-10-01)

Python approach for using homotopy perturbation method to investigate heat transfer problems
حسب: Payam Jalili, وآخرون
منشور في: (2024-02-01)

Download… Une courte histoire de la dématérialisation des jeux vidéo
حسب: Alexis Blanchet
منشور في: (2012-08-01)

PyChelator: a Python-based Colab and web application for metal chelator calculations
حسب: Emrulla Spahiu, وآخرون
منشور في: (2024-07-01)

Determinants of Downloads as Demand for Hybrid Journals
حسب: Sumiko Asai
منشور في: (2024-08-01)

Establishing a novel modeling tool: a python-based interface for a neuromorphic hardware system
حسب: Daniel Brüderle, وآخرون
منشور في: (2009-06-01)

Downloaded Worksheets: A Learning Activity to Enhance Mathematical Level
حسب: Elmer C. Zarate, وآخرون
منشور في: (2022-03-01)

Legal Protection for Film Copyright Holders Against Illegal Downloading and Streaming Activities on the Internet
حسب: Muhammad Anugrah
منشور في: (2023-10-01)

GTdownloader: A Python Package to Download, Visualize, and Export Georeferenced Tweets From the Twitter API
حسب: Juan Acosta-Sequeda, وآخرون
منشور في: (2023-06-01)

PyVisVue3D3: Python visualization from hierarchy tree to call graph
حسب: Chunfang Li, وآخرون
منشور في: (2024-05-01)

OpenSeesPyView: Python programming-based visualization and post-processing tool for OpenSeesPy
حسب: Junjun Guo, وآخرون
منشور في: (2023-02-01)

Journal Download Factor: A Composite Indicator of Dissemination, Impact, Knowledge and Information
حسب: YU Liping
منشور في: (2023-11-01)

Every Track You Take: Analysing the Dynamics of Song and Genre Reception Through Music Downloading
حسب: Dan Tidhar, وآخرون
منشور في: (2014-06-01)

Range Space and Similarity Transformation Using Symbolic Mathematics in Python
حسب: Chainarong Wisassakwichai, وآخرون
منشور في: (2024-01-01)

opseestools: A Python library to streamline OpenSeesPy workflows
حسب: Orlando Arroyo, وآخرون
منشور في: (2024-09-01)

Repressão, adaptação, reinvenção: o download de música como lazer e negócio na internet (2006-2013)
حسب: Juliana de Alencar Viana, وآخرون
منشور في: (2018-04-01)

Cooperative content downloading scheme based on D2D multicast communications
حسب: Lianxin YANG, وآخرون
منشور في: (2020-11-01)

Research on video streaming media cooperative downloading in vehicular ad hoc network
حسب: Liang CHEN, وآخرون
منشور في: (2019-01-01)

Research on video streaming media cooperative downloading in vehicular ad hoc network
حسب: Liang CHEN, وآخرون
منشور في: (2019-01-01)

Cooperative content downloading scheme based on D2D multicast communications
حسب: Lianxin YANG, وآخرون
منشور في: (2020-11-01)

Non-intermittent cooperative downloading approach for VANET
حسب: Yong XIE, وآخرون
منشور في: (2016-01-01)

Non-intermittent cooperative downloading approach for VANET
حسب: Yong XIE, وآخرون
منشور في: (2016-01-01)

Corrigendum: Reconstruction and Simulation of a Scaffold Model of the Cerebellar Network
حسب: Stefano Casali, وآخرون
منشور في: (2019-07-01)

opstool: A Python library for OpenSeesPy analysis automation, streamlined pre- and post-processing, and enhanced data visualization
حسب: Yexiang Yan, وآخرون
منشور في: (2025-05-01)

Making an executable paper with the Python in Heliophysics Community to foster open science and improve reproducibility
حسب: Shawn Polson, وآخرون
منشور في: (2023-03-01)

Using AnnoTree to Get More Assignments, Faster, in DIAMOND+MEGAN Microbiome Analysis
حسب: Anupam Gautam, وآخرون
منشور في: (2022-02-01)

A Cooperative Routing Scheme Using Inter-Satellite Links to Assist Data Downloading for LEO Satellite Networks
حسب: Zijian Yang, وآخرون
منشور في: (2022-10-01)

Purification and Characterization of Recombinant Levansucrase From Bacillus lichniformans MJ8
حسب: Mustafa Omar, وآخرون
منشور في: (2023-07-01)