Pausing guides RNA folding to populate transiently stable RNA structures for riboswitch-based transcription regulation
In bacteria, the regulation of gene expression by cis-acting transcriptional riboswitches located in the 5'-untranslated regions of messenger RNA requires the temporal synchronization of RNA synthesis and ligand binding-dependent conformational refolding. Ligand binding to the aptamer domain of...
| الحاوية / القاعدة: | eLife |
|---|---|
| المؤلفون الرئيسيون: | Hannah Steinert, Florian Sochor, Anna Wacker, Janina Buck, Christina Helmling, Fabian Hiller, Sara Keyhani, Jonas Noeske, Steffen Grimm, Martin M Rudolph, Heiko Keller, Rachel Anne Mooney, Robert Landick, Beatrix Suess, Boris Fürtig, Jens Wöhnert, Harald Schwalbe |
| التنسيق: | مقال |
| اللغة: | الإنجليزية |
| منشور في: |
eLife Sciences Publications Ltd
2017-05-01
|
| الموضوعات: | |
| الوصول للمادة أونلاين: | https://elifesciences.org/articles/21297 |
مواد مشابهة
Tapping the potential of synthetic riboswitches: reviewing the versatility of the tetracycline aptamer
حسب: Daniel Kelvin, وآخرون
منشور في: (2023-12-01)
حسب: Daniel Kelvin, وآخرون
منشور في: (2023-12-01)
Life times of metastable states guide regulatory signaling in transcriptional riboswitches
حسب: Christina Helmling, وآخرون
منشور في: (2018-03-01)
حسب: Christina Helmling, وآخرون
منشور في: (2018-03-01)
Using RNA Sequence and Structure for the Prediction of Riboswitch Aptamer: A Comprehensive Review of Available Software and Tools
حسب: Deborah Antunes, وآخرون
منشور في: (2018-01-01)
حسب: Deborah Antunes, وآخرون
منشور في: (2018-01-01)
Non-Conserved Residues in Clostridium acetobutylicum tRNAAla Contribute to tRNA Tuning for Efficient Antitermination of the alaS T Box Riboswitch
حسب: Liang-Chun Liu, وآخرون
منشور في: (2015-09-01)
حسب: Liang-Chun Liu, وآخرون
منشور في: (2015-09-01)
Bacterial riboswitches and RNA thermometers: Nature and contributions to pathogenesis
حسب: Jameel M. Abduljalil
منشور في: (2018-06-01)
حسب: Jameel M. Abduljalil
منشور في: (2018-06-01)
Ligand response of guanidine-IV riboswitch at single-molecule level
حسب: Lingzhi Gao, وآخرون
منشور في: (2024-12-01)
حسب: Lingzhi Gao, وآخرون
منشور في: (2024-12-01)
A Riboswitch-Driven Era of New Antibacterials
حسب: Nikoleta Giarimoglou, وآخرون
منشور في: (2022-09-01)
حسب: Nikoleta Giarimoglou, وآخرون
منشور في: (2022-09-01)
Co-Transcriptional Folding and Regulation Mechanisms of Riboswitches
حسب: Sha Gong, وآخرون
منشور في: (2017-07-01)
حسب: Sha Gong, وآخرون
منشور في: (2017-07-01)
tRNA Fusion to Streamline RNA Structure Determination: Case Studies in Probing Aminoacyl-tRNA Sensing Mechanisms by the T-Box Riboswitch
حسب: Jason C. Grigg, وآخرون
منشور في: (2022-05-01)
حسب: Jason C. Grigg, وآخرون
منشور في: (2022-05-01)
TaRTLEt: Transcriptionally-active Riboswitch Tracer Leveraging Edge deTection
حسب: Sachit Kshatriya, وآخرون
منشور في: (2025-05-01)
حسب: Sachit Kshatriya, وآخرون
منشور في: (2025-05-01)
<i>Bifidobacterium bifidum</i> SAM-VI Riboswitch Conformation Change Requires Peripheral Helix Formation
حسب: Wenwen Xiao, وآخرون
منشور في: (2024-06-01)
حسب: Wenwen Xiao, وآخرون
منشور في: (2024-06-01)
A Glycine Riboswitch in Streptococcus pyogenes Controls Expression of a Sodium:Alanine Symporter Family Protein Gene
حسب: Afsaneh Khani, وآخرون
منشور في: (2018-02-01)
حسب: Afsaneh Khani, وآخرون
منشور في: (2018-02-01)
Genetic dissection of regulation by a repressing and novel activating corrinoid riboswitch enables engineering of synthetic riboswitches
حسب: Rebecca R. Procknow, وآخرون
منشور في: (2023-10-01)
حسب: Rebecca R. Procknow, وآخرون
منشور في: (2023-10-01)
Riboswitches, from cognition to transformation
حسب: Jingdong Xu, وآخرون
منشور في: (2023-09-01)
حسب: Jingdong Xu, وآخرون
منشور في: (2023-09-01)
Applying the brakes to transcription: regulation of gene expression by RNA polymerase pausing
حسب: Oshadhi T. Jayasinghe, وآخرون
منشور في: (2025-07-01)
حسب: Oshadhi T. Jayasinghe, وآخرون
منشور في: (2025-07-01)
Development of conditional-siRNA programmable riboswitch for targeting adverse cardiac remodeling
حسب: Priyanka Gokulnath, وآخرون
منشور في: (2025-09-01)
حسب: Priyanka Gokulnath, وآخرون
منشور في: (2025-09-01)
Aptamers, Riboswitches, and Ribozymes in <i>S. cerevisiae</i> Synthetic Biology
حسب: Huanhuan Ge, وآخرون
منشور في: (2021-03-01)
حسب: Huanhuan Ge, وآخرون
منشور في: (2021-03-01)
Fluorescent riboswitch-controlled biosensors for the genome scale analysis of metabolic pathways
حسب: A. Michaud, وآخرون
منشور في: (2024-05-01)
حسب: A. Michaud, وآخرون
منشور في: (2024-05-01)
Novel TPP-riboswitch activators bypass metabolic enzyme dependency
حسب: Günter eMayer, وآخرون
منشور في: (2014-07-01)
حسب: Günter eMayer, وآخرون
منشور في: (2014-07-01)
Riboswitches as Drug Targets for Antibiotics
حسب: Vipul Panchal, وآخرون
منشور في: (2021-01-01)
حسب: Vipul Panchal, وآخرون
منشور في: (2021-01-01)
Use of an on/off tetracycline riboswitch to control protein production in Komagataella phaffii
حسب: Igor Patrick Vasconcelos Vieira, وآخرون
منشور في: (2023-11-01)
حسب: Igor Patrick Vasconcelos Vieira, وآخرون
منشور في: (2023-11-01)
Toeholder: a software for automated design and in silico validation of toehold riboswitches
حسب: Angel F. Cisneros, وآخرون
منشور في: (2023-06-01)
حسب: Angel F. Cisneros, وآخرون
منشور في: (2023-06-01)
Development and validation of a generic methyltransferase enzymatic assay based on an SAH riboswitch
حسب: Ha Pham, وآخرون
منشور في: (2024-06-01)
حسب: Ha Pham, وآخرون
منشور في: (2024-06-01)
Riboswitches for Controlled Expression of Therapeutic Transgenes Delivered by Adeno-Associated Viral Vectors
حسب: Zachary J. Tickner, وآخرون
منشور في: (2021-06-01)
حسب: Zachary J. Tickner, وآخرون
منشور في: (2021-06-01)
Fluoride-Controlled Riboswitch-Based Dampening of Gene Expression for Cloning Potent Promoters
حسب: Vesta Korniakova, وآخرون
منشور في: (2022-01-01)
حسب: Vesta Korniakova, وآخرون
منشور في: (2022-01-01)
Observation of SAM-VI Riboswitch Dynamics Using Single-Molecule FRET
حسب: Yanyan Xue, وآخرون
منشور في: (2025-06-01)
حسب: Yanyan Xue, وآخرون
منشور في: (2025-06-01)
A DnaA‐dependent riboswitch for transcription attenuation of the his operon
حسب: Yuan Yao, وآخرون
منشور في: (2023-06-01)
حسب: Yuan Yao, وآخرون
منشور في: (2023-06-01)
Allosteric mechanism of the V. vulnificus adenine riboswitch resolved by four-dimensional chemical mapping
حسب: Siqi Tian, وآخرون
منشور في: (2018-02-01)
حسب: Siqi Tian, وآخرون
منشور في: (2018-02-01)
Signal amplification and optimization of riboswitch-based hybrid inputs by modular and titratable toehold switches
حسب: Yunhee Hwang, وآخرون
منشور في: (2021-03-01)
حسب: Yunhee Hwang, وآخرون
منشور في: (2021-03-01)
Adopting a Theophylline-Responsive Riboswitch for Flexible Regulation and Understanding of Glycogen Metabolism in Synechococcus elongatus PCC7942
حسب: Xintong Chi, وآخرون
منشور في: (2019-03-01)
حسب: Xintong Chi, وآخرون
منشور في: (2019-03-01)
From lab reagent to metabolite: the riboswitch ligand guanidine as a relevant compound in bacterial physiology
حسب: Payton Bowman, وآخرون
منشور في: (2025-06-01)
حسب: Payton Bowman, وآخرون
منشور في: (2025-06-01)
Systematic Comparison and Rational Design of Theophylline Riboswitches for Effective Gene Repression
حسب: Xun Wang, وآخرون
منشور في: (2023-02-01)
حسب: Xun Wang, وآخرون
منشور في: (2023-02-01)
Optimized riboswitch-regulated AAV vector for VEGF-B gene therapy
حسب: Reetta A. E. Eriksson, وآخرون
منشور في: (2022-12-01)
حسب: Reetta A. E. Eriksson, وآخرون
منشور في: (2022-12-01)
Classification of seed members of five riboswitch families as short sequences based on the features extracted by Block Location-Based Feature Extraction (BLBFE) method
حسب: Faegheh Golabi, وآخرون
منشور في: (2021-03-01)
حسب: Faegheh Golabi, وآخرون
منشور في: (2021-03-01)
Riboswitch-controlled IL-12 gene therapy reduces hepatocellular cancer in mice
حسب: Matthias J. Düchs, وآخرون
منشور في: (2024-03-01)
حسب: Matthias J. Düchs, وآخرون
منشور في: (2024-03-01)
Riboflow: Using Deep Learning to Classify Riboswitches With ∼99% Accuracy
حسب: Keshav Aditya R. Premkumar, وآخرون
منشور في: (2020-07-01)
حسب: Keshav Aditya R. Premkumar, وآخرون
منشور في: (2020-07-01)
Exploration of SAM-I riboswitch inhibitors: In-Silico discovery of ligands to a new target employing multistage CADD approaches
حسب: Nada Elkholy, وآخرون
منشور في: (2024-06-01)
حسب: Nada Elkholy, وآخرون
منشور في: (2024-06-01)
A variant of guanidine-IV riboswitches exhibits evidence of a distinct ligand specificity
حسب: Felina Lenkeit, وآخرون
منشور في: (2023-12-01)
حسب: Felina Lenkeit, وآخرون
منشور في: (2023-12-01)
High Affinity Binding of N2-Modified Guanine Derivatives Significantly Disrupts the Ligand Binding Pocket of the Guanine Riboswitch
حسب: Michal M. Matyjasik, وآخرون
منشور في: (2020-05-01)
حسب: Michal M. Matyjasik, وآخرون
منشور في: (2020-05-01)
Bioinformatics and Genomic Analyses of the Suitability of Eight Riboswitches for Antibacterial Drug Targets
حسب: Nikolet Pavlova, وآخرون
منشور في: (2022-08-01)
حسب: Nikolet Pavlova, وآخرون
منشور في: (2022-08-01)
مواد مشابهة
-
Tapping the potential of synthetic riboswitches: reviewing the versatility of the tetracycline aptamer
حسب: Daniel Kelvin, وآخرون
منشور في: (2023-12-01) -
Life times of metastable states guide regulatory signaling in transcriptional riboswitches
حسب: Christina Helmling, وآخرون
منشور في: (2018-03-01) -
Using RNA Sequence and Structure for the Prediction of Riboswitch Aptamer: A Comprehensive Review of Available Software and Tools
حسب: Deborah Antunes, وآخرون
منشور في: (2018-01-01) -
Non-Conserved Residues in Clostridium acetobutylicum tRNAAla Contribute to tRNA Tuning for Efficient Antitermination of the alaS T Box Riboswitch
حسب: Liang-Chun Liu, وآخرون
منشور في: (2015-09-01) -
Bacterial riboswitches and RNA thermometers: Nature and contributions to pathogenesis
حسب: Jameel M. Abduljalil
منشور في: (2018-06-01)
