Machine learning model of the catalytic efficiency and substrate specificity of acyl-ACP thioesterase variants generated from natural and in vitro directed evolution
Modulating the catalytic activity of acyl-ACP thioesterase (TE) is an important biotechnological target for effectively increasing flux and diversifying products of the fatty acid biosynthesis pathway. In this study, a directed evolution approach was developed to improve the fatty acid titer and fat...
| الحاوية / القاعدة: | Frontiers in Bioengineering and Biotechnology |
|---|---|
| المؤلفون الرئيسيون: | Fuyuan Jing, Keting Chen, Marna D. Yandeau-Nelson, Basil J. Nikolau |
| التنسيق: | مقال |
| اللغة: | الإنجليزية |
| منشور في: |
Frontiers Media S.A.
2024-04-01
|
| الموضوعات: | |
| الوصول للمادة أونلاين: | https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fbioe.2024.1379121/full |
مواد مشابهة
The identification and expression analysis of walnut Acyl-ACP thioesterases
حسب: Hui Wang, وآخرون
منشور في: (2024-07-01)
حسب: Hui Wang, وآخرون
منشور في: (2024-07-01)
Determinants of substrate specificity in a catalytically diverse family of acyl-ACP thioesterases from plants
حسب: Rebecca S. Kalinger, وآخرون
منشور في: (2023-01-01)
حسب: Rebecca S. Kalinger, وآخرون
منشور في: (2023-01-01)
Characterization of the acyl-ACP thioesterases from Koelreuteria paniculata reveals a new type of FatB thioesterase
حسب: R. Martins-Noguerol, وآخرون
منشور في: (2020-10-01)
حسب: R. Martins-Noguerol, وآخرون
منشور في: (2020-10-01)
Synthesis and biological profile of 2,3-dihydro[1,3]thiazolo[4,5-b]pyridines, a novel class of acyl-ACP thioesterase inhibitors
حسب: Jens Frackenpohl, وآخرون
منشور في: (2024-03-01)
حسب: Jens Frackenpohl, وآخرون
منشور في: (2024-03-01)
A robust and efficient method for the extraction of plant extracellular surface lipids as applied to the analysis of silks and seedling leaves of maize.
حسب: Derek M Loneman, وآخرون
منشور في: (2017-01-01)
حسب: Derek M Loneman, وآخرون
منشور في: (2017-01-01)
New Insights Into Sunflower (Helianthus annuus L.) FatA and FatB Thioesterases, Their Regulation, Structure and Distribution
حسب: Jose A. Aznar-Moreno, وآخرون
منشور في: (2018-10-01)
حسب: Jose A. Aznar-Moreno, وآخرون
منشور في: (2018-10-01)
Genetic and environmental variation impact the cuticular hydrocarbon metabolome on the stigmatic surfaces of maize
حسب: Tesia Dennison, وآخرون
منشور في: (2019-10-01)
حسب: Tesia Dennison, وآخرون
منشور في: (2019-10-01)
EnZymClass: Substrate specificity prediction tool of plant acyl-ACP thioesterases based on ensemble learning
حسب: Deepro Banerjee, وآخرون
منشور في: (2022-01-01)
حسب: Deepro Banerjee, وآخرون
منشور في: (2022-01-01)
Kinetic, Structural, and Mutational Analysis of Acyl-CoA Carboxylase From Thermobifida fusca YX
حسب: Kiran-Kumar Shivaiah, وآخرون
منشور في: (2021-01-01)
حسب: Kiran-Kumar Shivaiah, وآخرون
منشور في: (2021-01-01)
Evolutionary divergence and functions of the human acyl-CoA thioesterase gene (<it>ACOT</it>) family
حسب: Brocker Chad, وآخرون
منشور في: (2010-08-01)
حسب: Brocker Chad, وآخرون
منشور في: (2010-08-01)
Acyl-Coa Thioesterases: A Rheostat That Controls Activated Fatty Acids Modulates Dengue Virus Serotype 2 Replication
حسب: Laura A. St Clair, وآخرون
منشور في: (2022-01-01)
حسب: Laura A. St Clair, وآخرون
منشور في: (2022-01-01)
The impact of the GLOSSY2 and GLOSSY2-LIKE BAHD-proteins in affecting the product profile of the maize fatty acid elongase
حسب: Liza Esther Alexander, وآخرون
منشور في: (2024-07-01)
حسب: Liza Esther Alexander, وآخرون
منشور في: (2024-07-01)
Cellular and Molecular Responses of Dunaliella tertiolecta by Expression of a Plant Medium Chain Length Fatty Acid Specific Acyl-ACP Thioesterase
حسب: Huixin Lin, وآخرون
منشور في: (2018-04-01)
حسب: Huixin Lin, وآخرون
منشور في: (2018-04-01)
Stepwise metabolic engineering of Escherichia coli to produce triacylglycerol rich in medium-chain fatty acids
حسب: Lin Xu, وآخرون
منشور في: (2018-06-01)
حسب: Lin Xu, وآخرون
منشور في: (2018-06-01)
Homologous Overexpression of Acyl-CoA Thioesterase 8 Enhanced Free Fatty Acid Accumulation in Oleaginous Fungus <i>Mucor circinelloides</i> WJ11
حسب: Feifei Xin, وآخرون
منشور في: (2023-06-01)
حسب: Feifei Xin, وآخرون
منشور في: (2023-06-01)
Attenuating ABHD17 Isoforms Augments the S-acylation and Function of NOD2 and a Subset of Crohn’s Disease-associated NOD2 VariantsSummary
حسب: Charneal L. Dixon, وآخرون
منشور في: (2025-01-01)
حسب: Charneal L. Dixon, وآخرون
منشور في: (2025-01-01)
A strategy to enhance and modify fatty acid synthesis in Corynebacterium glutamicum and Escherichia coli: overexpression of acyl-CoA thioesterases
حسب: Jin Liu, وآخرون
منشور في: (2023-09-01)
حسب: Jin Liu, وآخرون
منشور في: (2023-09-01)
Rescue of aberrant huntingtin palmitoylation ameliorates mutant huntingtin-induced toxicity
حسب: Fanny L. Lemarié, وآخرون
منشور في: (2021-10-01)
حسب: Fanny L. Lemarié, وآخرون
منشور في: (2021-10-01)
High-throughput screening identifies small molecule inhibitors of thioesterase superfamily member 1: Implications for the management of non-alcoholic fatty liver disease
حسب: Christopher S. Krumm, وآخرون
منشور في: (2023-12-01)
حسب: Christopher S. Krumm, وآخرون
منشور في: (2023-12-01)
Chemoenzymatic synthesis of macrocyclic peptides and polyketides via thioesterase-catalyzed macrocyclization
حسب: Senze Qiao, وآخرون
منشور في: (2024-04-01)
حسب: Senze Qiao, وآخرون
منشور في: (2024-04-01)
Modulation of plant acetyl-CoA synthetase activity by post-translational lysine acetylation
حسب: Naazneen Sofeo, وآخرون
منشور في: (2023-03-01)
حسب: Naazneen Sofeo, وآخرون
منشور في: (2023-03-01)
Unexpected contribution of the Fak system and the thioesterase TesE to the growth and membrane physiology of Enterococcus faecalis
حسب: R. D. Johnston, وآخرون
منشور في: (2025-07-01)
حسب: R. D. Johnston, وآخرون
منشور في: (2025-07-01)
SIRT6 regulates Ras-related protein R-Ras2 by lysine defatty-acylation
حسب: Xiaoyu Zhang, وآخرون
منشور في: (2017-04-01)
حسب: Xiaoyu Zhang, وآخرون
منشور في: (2017-04-01)
Status Epilepticus Induces Changes in the Expression and Localization of Endogenous Palmitoyl-Protein Thioesterase 1
حسب: J. Suopanki, وآخرون
منشور في: (2002-08-01)
حسب: J. Suopanki, وآخرون
منشور في: (2002-08-01)
The Effects of Carbon Source and Growth Temperature on the Fatty Acid Profiles of Thermobifida fusca
حسب: Dirk C. Winkelman, وآخرون
منشور في: (2022-06-01)
حسب: Dirk C. Winkelman, وآخرون
منشور في: (2022-06-01)
Engineering thioesterase as a driving force for novel itaconate production via its degradation scheme
حسب: Ryan S. Wang, وآخرون
منشور في: (2024-12-01)
حسب: Ryan S. Wang, وآخرون
منشور في: (2024-12-01)
Structural insights into PKS13 Thioesterase inhibitors targeting Mycobacterium tuberculosis for drug-resistant tuberculosis therapy: Identification, stability assessment, and pharmacophore modeling
حسب: Zia Ur Rehman, وآخرون
منشور في: (2025-07-01)
حسب: Zia Ur Rehman, وآخرون
منشور في: (2025-07-01)
Suppressing lipid biosynthesis in Mycobacterium tuberculosis through polyketide synthase 13 thioesterase inhibition: Insights from computational analysis
حسب: Maha M. Alawi, وآخرون
منشور في: (2025-09-01)
حسب: Maha M. Alawi, وآخرون
منشور في: (2025-09-01)
Identification of a potentially functional MKS2/ALT homolog gene in the genome of the cultivated potato Solanum tuberosum
حسب: Huong Thi Diem Tran, وآخرون
منشور في: (2025-02-01)
حسب: Huong Thi Diem Tran, وآخرون
منشور في: (2025-02-01)
The Interactome of Palmitoyl-Protein Thioesterase 1 (PPT1) Affects Neuronal Morphology and Function
حسب: Tamar Sapir, وآخرون
منشور في: (2019-03-01)
حسب: Tamar Sapir, وآخرون
منشور في: (2019-03-01)
Functional characterization of thioesterase superfamily member 1/Acyl-CoA thioesterase 11: implications for metabolic regulation[S]
حسب: Shuxin Han, وآخرون
منشور في: (2012-12-01)
حسب: Shuxin Han, وآخرون
منشور في: (2012-12-01)
Structural insights into acyl-ACP selective recognition by the Aeromonas hydrophila AHL synthase AhyI
حسب: Lei Jin, وآخرون
منشور في: (2021-06-01)
حسب: Lei Jin, وآخرون
منشور في: (2021-06-01)
Roles of the MYB94/FUSED LEAVES1 (ZmFDL1) and GLOSSY2 (ZmGL2) genes in cuticle biosynthesis and potential impacts on Fusarium verticillioides growth on maize silks
حسب: Giulia Castorina, وآخرون
منشور في: (2023-07-01)
حسب: Giulia Castorina, وآخرون
منشور في: (2023-07-01)
Protein palmitoylation: an emerging regulator of inflammatory signaling and diseases
حسب: Rong Chen, وآخرون
منشور في: (2025-09-01)
حسب: Rong Chen, وآخرون
منشور في: (2025-09-01)
Enhancing Formal Methods Integration with ACP2Petri
حسب: Slavomír Šimoňák, وآخرون
منشور في: (2016-12-01)
حسب: Slavomír Šimoňák, وآخرون
منشور في: (2016-12-01)
Campylobacter jejuni resistance to human milk involves the acyl carrier protein AcpP
حسب: Bibi Zhou, وآخرون
منشور في: (2025-04-01)
حسب: Bibi Zhou, وآخرون
منشور في: (2025-04-01)
Installation of LYRM proteins in early eukaryotes to regulate the metabolic capacity of the emerging mitochondrion
حسب: Vít Dohnálek, وآخرون
منشور في: (2024-05-01)
حسب: Vít Dohnálek, وآخرون
منشور في: (2024-05-01)
TAP Sampling for Asian Citrus Psyllid (ACP) Field Sheet
حسب: Phil Stansly, وآخرون
منشور في: (2016-02-01)
حسب: Phil Stansly, وآخرون
منشور في: (2016-02-01)
Palmitoyl Protein Thioesterase 1 Is Essential for Myogenic Autophagy of C2C12 Skeletal Myoblast
حسب: Hyeong Rok Yun, وآخرون
منشور في: (2020-10-01)
حسب: Hyeong Rok Yun, وآخرون
منشور في: (2020-10-01)
Acyl-1,4-Dihydropyridines: Universal Acylation Reagents for Organic Synthesis
حسب: Karthikeyan Manoharan, وآخرون
منشور في: (2024-08-01)
حسب: Karthikeyan Manoharan, وآخرون
منشور في: (2024-08-01)
مواد مشابهة
-
The identification and expression analysis of walnut Acyl-ACP thioesterases
حسب: Hui Wang, وآخرون
منشور في: (2024-07-01) -
Determinants of substrate specificity in a catalytically diverse family of acyl-ACP thioesterases from plants
حسب: Rebecca S. Kalinger, وآخرون
منشور في: (2023-01-01) -
Characterization of the acyl-ACP thioesterases from Koelreuteria paniculata reveals a new type of FatB thioesterase
حسب: R. Martins-Noguerol, وآخرون
منشور في: (2020-10-01) -
Synthesis and biological profile of 2,3-dihydro[1,3]thiazolo[4,5-b]pyridines, a novel class of acyl-ACP thioesterase inhibitors
حسب: Jens Frackenpohl, وآخرون
منشور في: (2024-03-01) -
A robust and efficient method for the extraction of plant extracellular surface lipids as applied to the analysis of silks and seedling leaves of maize.
حسب: Derek M Loneman, وآخرون
منشور في: (2017-01-01)
