Evaluation of the Limit of Detection of Bacteria by Tandem Mass Spectrometry Proteotyping and Phylopeptidomics
Shotgun proteomics has proven to be an attractive alternative for identifying a pathogen and characterizing the antimicrobial resistance genes it produces. Because of its performance, proteotyping of microorganisms by tandem mass spectrometry is expected to become an essential tool in modern healthc...
| الحاوية / القاعدة: | Microorganisms |
|---|---|
| المؤلفون الرئيسيون: | Charlotte Mappa, Béatrice Alpha-Bazin, Olivier Pible, Jean Armengaud |
| التنسيق: | مقال |
| اللغة: | الإنجليزية |
| منشور في: |
MDPI AG
2023-04-01
|
| الموضوعات: | |
| الوصول للمادة أونلاين: | https://www.mdpi.com/2076-2607/11/5/1170 |
مواد مشابهة
Evaluation of Sample Preparation Methods for Fast Proteotyping of Microorganisms by Tandem Mass Spectrometry
حسب: Karim Hayoun, وآخرون
منشور في: (2019-09-01)
حسب: Karim Hayoun, وآخرون
منشور في: (2019-09-01)
Proteotyping Environmental Microorganisms by Phylopeptidomics: Case Study Screening Water from a Radioactive Material Storage Pool
حسب: Karim Hayoun, وآخرون
منشور في: (2020-10-01)
حسب: Karim Hayoun, وآخرون
منشور في: (2020-10-01)
Identification and Characterization of Marine Microorganisms by Tandem Mass Spectrometry Proteotyping
حسب: Clément Lozano, وآخرون
منشور في: (2022-03-01)
حسب: Clément Lozano, وآخرون
منشور في: (2022-03-01)
Quick and wide-range taxonomical repertoire establishment of the cystic fibrosis lung microbiota by tandem mass spectrometry on sputum samples
حسب: Pauline Hardouin, وآخرون
منشور في: (2022-10-01)
حسب: Pauline Hardouin, وآخرون
منشور في: (2022-10-01)
The astounding exhaustiveness and speed of the Astral mass analyzer for highly complex samples is a quantum leap in the functional analysis of microbiomes
حسب: Thibaut Dumas, وآخرون
منشور في: (2024-03-01)
حسب: Thibaut Dumas, وآخرون
منشور في: (2024-03-01)
Deep proteomic dataset of human liver samples obtained by two-dimensional sample fractionation coupled with tandem mass spectrometry
حسب: Nikita E. Vavilov, وآخرون
منشور في: (2022-06-01)
حسب: Nikita E. Vavilov, وآخرون
منشور في: (2022-06-01)
Proteotyping of Clostridioides difficile as Alternate Typing Method to Ribotyping Is Able to Distinguish the Ribotypes RT027 and RT176 From Other Ribotypes
حسب: Matthias F. Emele, وآخرون
منشور في: (2019-09-01)
حسب: Matthias F. Emele, وآخرون
منشور في: (2019-09-01)
Proteotyping of <i>Campylobacter jejuni</i> by MALDI-TOF MS and Strain Solution Version 2 Software
حسب: Teruyo Ojima-Kato, وآخرون
منشور في: (2023-01-01)
حسب: Teruyo Ojima-Kato, وآخرون
منشور في: (2023-01-01)
<i>Bacillus cereus</i> Decreases NHE and CLO Exotoxin Synthesis to Maintain Appropriate Proteome Dynamics During Growth at Low Temperature
حسب: Catherine Duport, وآخرون
منشور في: (2020-10-01)
حسب: Catherine Duport, وآخرون
منشور في: (2020-10-01)
Is It Possible to Find Needles in a Haystack? Meta-Analysis of 1000+ MS/MS Files Provided by the Russian Proteomic Consortium for Mining Missing Proteins
حسب: Ekaterina Poverennaya, وآخرون
منشور في: (2020-05-01)
حسب: Ekaterina Poverennaya, وآخرون
منشور في: (2020-05-01)
Direct Meta-Analyses Reveal Unexpected Microbial Life in the Highly Radioactive Water of an Operating Nuclear Reactor Core
حسب: Pauline C. M. Petit, وآخرون
منشور في: (2020-11-01)
حسب: Pauline C. M. Petit, وآخرون
منشور في: (2020-11-01)
Fast Proteome Identification and Quantification from Data-Dependent Acquisition–Tandem Mass Spectrometry (DDA MS/MS) Using Free Software Tools
حسب: Jesse G. Meyer
منشور في: (2019-01-01)
حسب: Jesse G. Meyer
منشور في: (2019-01-01)
Time dynamics of the Bacillus cereus exoproteome are shaped by cellular oxidation
حسب: Jean-Paul eMadeira, وآخرون
منشور في: (2015-04-01)
حسب: Jean-Paul eMadeira, وآخرون
منشور في: (2015-04-01)
In-Depth Analysis of Exoproteomes from Marine Bacteria by Shotgun Liquid Chromatography-Tandem Mass Spectrometry: the Ruegeria pomeroyi DSS-3 Case-Study
حسب: Jean Armengaud, وآخرون
منشور في: (2010-07-01)
حسب: Jean Armengaud, وآخرون
منشور في: (2010-07-01)
Standard flow liquid chromatography for shotgun proteomics in bioenergy research
حسب: Susana M. González Fernández-Niño, وآخرون
منشور في: (2015-04-01)
حسب: Susana M. González Fernández-Niño, وآخرون
منشور في: (2015-04-01)
Mutation of the Surface Layer Protein SlpB Has Pleiotropic Effects in the Probiotic Propionibacterium freudenreichii CIRM-BIA 129
حسب: Fillipe L. R. do Carmo, وآخرون
منشور في: (2018-08-01)
حسب: Fillipe L. R. do Carmo, وآخرون
منشور في: (2018-08-01)
Species-Specific Discrimination of Insect Meals for Aquafeeds by Direct Comparison of Tandem Mass Spectra
حسب: Ikram Belghit, وآخرون
منشور في: (2019-05-01)
حسب: Ikram Belghit, وآخرون
منشور في: (2019-05-01)
Progressive search in tandem mass spectrometry
حسب: Yoonsung Joh, وآخرون
منشور في: (2023-03-01)
حسب: Yoonsung Joh, وآخرون
منشور في: (2023-03-01)
Proteomic Shotgun and Targeted Mass Spectrometric Datasets of Cerebrospinal Fluid (Liquor) Derived from Patients with Vestibular Schwannoma
حسب: Svetlana Novikova, وآخرون
منشور في: (2023-04-01)
حسب: Svetlana Novikova, وآخرون
منشور في: (2023-04-01)
Preliminary Insights of Brazilian Snake Venom Metalloproteomics
حسب: Bruna Cavecci-Mendonça, وآخرون
منشور في: (2023-11-01)
حسب: Bruna Cavecci-Mendonça, وآخرون
منشور في: (2023-11-01)
Serum proteomics reveals a tolerant immune phenotype across multiple pathogen taxa in wild vampire bats
حسب: Amanda Vicente-Santos, وآخرون
منشور في: (2023-12-01)
حسب: Amanda Vicente-Santos, وآخرون
منشور في: (2023-12-01)
Shotgun Proteomics as a Powerful Tool for the Study of the Proteomes of Plants, Their Pathogens, and Plant–Pathogen Interactions
حسب: Sadegh Balotf, وآخرون
منشور في: (2022-01-01)
حسب: Sadegh Balotf, وآخرون
منشور في: (2022-01-01)
Mass Spectrometry Based Lipidomics: An Overview of Technological Platforms
حسب: Harald C. Köfeler, وآخرون
منشور في: (2012-01-01)
حسب: Harald C. Köfeler, وآخرون
منشور في: (2012-01-01)
A DISTRIBUTED ALGORITHM FOR PROTEIN IDENTIFICATION FROM TANDEM MASS SPECTROMETRY DATA
حسب: Katarzyna ORZECHOWSKA, وآخرون
منشور في: (2022-06-01)
حسب: Katarzyna ORZECHOWSKA, وآخرون
منشور في: (2022-06-01)
Accurate Quantification of Lipid Species by Electrospray Ionization Mass Spectrometry — Meets a Key Challenge in Lipidomics
حسب: Kui Yang, وآخرون
منشور في: (2011-11-01)
حسب: Kui Yang, وآخرون
منشور في: (2011-11-01)
Protocol for dual metabolomics and proteomics using nanoflow liquid chromatography-tandem mass spectrometry
حسب: Weiwei Lin, وآخرون
منشور في: (2025-06-01)
حسب: Weiwei Lin, وآخرون
منشور في: (2025-06-01)
A Bioconductor workflow for processing, evaluating, and interpreting expression proteomics data [version 1; peer review: 2 approved]
حسب: Lisa M. Breckels, وآخرون
منشور في: (2023-10-01)
حسب: Lisa M. Breckels, وآخرون
منشور في: (2023-10-01)
A Bioconductor workflow for processing, evaluating, and interpreting expression proteomics data [version 2; peer review: 3 approved]
حسب: Lisa M. Breckels, وآخرون
منشور في: (2024-09-01)
حسب: Lisa M. Breckels, وآخرون
منشور في: (2024-09-01)
Characterization of Foodborne Strains of Staphylococcus aureus by Shotgun Proteomics: Functional Networks, Virulence Factors and Species-Specific Peptide Biomarkers
حسب: Mónica Carrera, وآخرون
منشور في: (2017-12-01)
حسب: Mónica Carrera, وآخرون
منشور في: (2017-12-01)
Shotgun proteomics to characterize wastewater proteins
حسب: Ester Sánchez-Jiménez, وآخرون
منشور في: (2023-12-01)
حسب: Ester Sánchez-Jiménez, وآخرون
منشور في: (2023-12-01)
Post-translational Protein Acetylation: An Elegant Mechanism for Bacteria to Dynamically Regulate Metabolic Functions
حسب: David G. Christensen, وآخرون
منشور في: (2019-07-01)
حسب: David G. Christensen, وآخرون
منشور في: (2019-07-01)
Applications of Tandem Mass Spectrometry (MS/MS) in Protein Analysis for Biomedical Research
حسب: Anca-Narcisa Neagu, وآخرون
منشور في: (2022-04-01)
حسب: Anca-Narcisa Neagu, وآخرون
منشور في: (2022-04-01)
Responses of carbapenemase-producing and non-producing carbapenem-resistant Pseudomonas aeruginosa strains to meropenem revealed by quantitative tandem mass spectrometry proteomics
حسب: Francisco Salvà-Serra, وآخرون
منشور في: (2023-02-01)
حسب: Francisco Salvà-Serra, وآخرون
منشور في: (2023-02-01)
Membrane Modulation of Super-Secreting “midiBacillus” Expressing the Major Staphylococcus aureus Antigen – A Mass-Spectrometry-Based Absolute Quantification Approach
حسب: Minia Antelo-Varela, وآخرون
منشور في: (2020-02-01)
حسب: Minia Antelo-Varela, وآخرون
منشور في: (2020-02-01)
Proteotypic Differences of Follicular-Patterned Thyroid Neoplasms
حسب: Dongdong Huang, وآخرون
منشور في: (2022-07-01)
حسب: Dongdong Huang, وآخرون
منشور في: (2022-07-01)
High-resolution differentiation and identification of the clinically relevant pathogens Haemophilus influenzae and Haemophilus aegyptius: combined whole-cell MALDI-TOF MS and nano-LC-MS/MS proteotyping for defining protein biomarkers
حسب: Hamideh Hamidi, وآخرون
منشور في: (2026-05-01)
حسب: Hamideh Hamidi, وآخرون
منشور في: (2026-05-01)
Proteomic Analysis of Ginseng (<i>Panax ginseng</i> C. A. Meyer) Fluid Proteins under Salt Stress
حسب: Ju-Young Jung, وآخرون
منشور في: (2022-08-01)
حسب: Ju-Young Jung, وآخرون
منشور في: (2022-08-01)
Proteome changes of porcine follicular fluid during follicle development
حسب: Victor M. Paes, وآخرون
منشور في: (2019-12-01)
حسب: Victor M. Paes, وآخرون
منشور في: (2019-12-01)
Assessing proteolytic events in bioinformatic reanalysis of public secretome data from melanoma cell lines
حسب: Murilo Salardani, وآخرون
منشور في: (2022-07-01)
حسب: Murilo Salardani, وآخرون
منشور في: (2022-07-01)
Synthesis and Matrix Properties of α-Cyano-5-phenyl-2,4-pentadienic Acid (CPPA) for Intact Proteins Analysis by Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization Mass Spectrometry
حسب: Antonio Monopoli, وآخرون
منشور في: (2020-12-01)
حسب: Antonio Monopoli, وآخرون
منشور في: (2020-12-01)
مواد مشابهة
-
Evaluation of Sample Preparation Methods for Fast Proteotyping of Microorganisms by Tandem Mass Spectrometry
حسب: Karim Hayoun, وآخرون
منشور في: (2019-09-01) -
Proteotyping Environmental Microorganisms by Phylopeptidomics: Case Study Screening Water from a Radioactive Material Storage Pool
حسب: Karim Hayoun, وآخرون
منشور في: (2020-10-01) -
Identification and Characterization of Marine Microorganisms by Tandem Mass Spectrometry Proteotyping
حسب: Clément Lozano, وآخرون
منشور في: (2022-03-01) -
Quick and wide-range taxonomical repertoire establishment of the cystic fibrosis lung microbiota by tandem mass spectrometry on sputum samples
حسب: Pauline Hardouin, وآخرون
منشور في: (2022-10-01) -
The astounding exhaustiveness and speed of the Astral mass analyzer for highly complex samples is a quantum leap in the functional analysis of microbiomes
حسب: Thibaut Dumas, وآخرون
منشور في: (2024-03-01)
