Analiza genskega zapisa acidocinov LF221 A in B seva Lactobacillus gasseri LF221

• Published in: Acta Agriculturae Slovenica
• Main Authors: Andreja ČANŽEK MAJHENIČ, Irena ROGELJ
• Format: Article
• Language: English
• Published: University of Ljubljana Press (Založba Univerze v Ljubljani) 2003-12-01
• Subjects: mikrobiologija; mlečnokislinske bakterije; lactobacillus gasseri lf221; bakteriocini; acidocin lf221 a; acidocin lf221 b; molekularna genetika; genski zapis
• Online Access: https://journals.uni-lj.si/aas/article/view/15274

Z metodami molekularne biologije smo pripravili odseka DNA seva LF221 z zapisom za acidocin LF221 A oziroma acidocin LF221B. Na 0,9 kb dolgem odseku BamHI/HindIII, ki ima zapis za acidocin LF221 A, smo ugotovili prisotnost dveh bralnih okvirjev (ORF) ter del tretjega. Za OrfA2 se je izkazalo, da nosi zapis za strukturni gen za acidocin LF221 A (Acd221A), medtem ko OrfA3 nosi zapis za peptid, dolg 90 aminokislinskih ostankov, ki ima zelo verjetno vlogo proteina imunosti (Aci221A). OrfA1, za katerega je trenutno znanih 37 aminokislin, pa je najverjetneje komplementarni peptid (Acd221α) acidocina LF221 A. Z analizo 1,8 kb dolgega odseka EcoRI/HindIII (ima zapis za acidocin LF221 B) smo potrdili prisotnost štirih zaključenih ORF in enega nepopolnega. OrfB3, OrfB4 in OrfB5, ki nosijo zapis za komplementarni peptid (Acd221β) acidocina LF221 B, aktivni peptid (Acd221B) acidocina LF221 B oziroma protein imunosti (Aci221B), se nahajajo na istem operonu. Iz rezultatov analiz genskega zapisa acidocinov in sosednjih genov smo zaključili, da gre za dva različna, dvo-peptidna bakteriocina seva LF221.