Non-biological synthetic spike-in controls and the AMPtk software pipeline improve mycobiome data

High-throughput amplicon sequencing (HTAS) of conserved DNA regions is a powerful technique to characterize microbial communities. Recently, spike-in mock communities have been used to measure accuracy of sequencing platforms and data analysis pipelines. To assess the ability of sequencing platforms...

وصف كامل

التفاصيل البيبلوغرافية
الحاوية / القاعدة:PeerJ
المؤلفون الرئيسيون: Jonathan M. Palmer, Michelle A. Jusino, Mark T. Banik, Daniel L. Lindner
التنسيق: مقال
اللغة:الإنجليزية
منشور في: PeerJ Inc. 2018-05-01
الموضوعات:
Mycobiome
Synthetic spike-in control
Amplicon toolkit
Fungi
Metabarcoding
High-throughput amplicon sequencing
الوصول للمادة أونلاين:https://peerj.com/articles/4925.pdf

الانترنت

https://peerj.com/articles/4925.pdf

مواد مشابهة