PANDA: Processing in Magnetic Random-Access Memory-Accelerated de Bruijn Graph-Based DNA Assembly

In this work, we present an efficient Processing in MRAM-Accelerated De Bruijn Graph-based DNA Assembly platform, named PANDA, based on an optimized and hardware-friendly genome assembly algorithm. PANDA is able to assemble large-scale DNA sequence datasets from all-pair overlaps. We first design a...

وصف كامل

التفاصيل البيبلوغرافية
الحاوية / القاعدة:Journal of Low Power Electronics and Applications
المؤلفون الرئيسيون: Shaahin Angizi, Naima Ahmed Fahmi, Deniz Najafi, Wei Zhang, Deliang Fan
التنسيق: مقال
اللغة:الإنجليزية
منشور في: MDPI AG 2024-02-01
الموضوعات:
الوصول للمادة أونلاين:https://www.mdpi.com/2079-9268/14/1/9