Caracterização da comunidade bacteriana endofítica de citros por isolamento, PCR específico e DGGE Characterization of the endophytic bacterial community from citrus by isolation, specific PCR and DGGE

• Main Authors: Paulo Teixeira Lacava, Fernando Dini Andreote, Welington Luiz Araújo, João Lúcio Azevedo
• Format: Article
• Language: English
• Published: Embrapa Informação Tecnológica 2006-04-01
• Series: Pesquisa Agropecuária Brasileira
• Subjects: Citrus sinensis; Xylella fastidiosa; Methylobacterium; bactérias endofíticas; endophytic bacteria
• Online Access: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2006000400013

O objetivo deste trabalho foi caracterizar a comunidade bacteriana endofítica de plantas assintomáticas (escapes) e afetadas pela clorose variegada dos citros (CVC) por meio de isolamento em meio de cultura, técnica de gradiente desnaturante em gel de eletroforese (DGGE) e detecção de Methylobacterium mesophilicum e Xyllela fastidiosa por meio de PCR específico, para estudar esta comunidade e sua relação com a ocorrência da CVC. A análise da comunidade bacteriana via DGGE permitiu a detecção de X. fastidiosa, bem como Klebsiella sp. e Acinetobacter sp. como endófitos de citros. Foram observados também Curtobacterium sp., Pseudomonas sp., Enterobacter sp. e Bacillus spp. Utilizando primers específicos, Methylobacterium mesophilicum e X. fastidiosa também foram observadas, reforçando hipóteses de que estas bactérias podem estar interagindo no interior da planta hospedeira.<br>The aim of this work was to characterize endophytic bacterial community of assintomatic (escape) and Citrus Variegated Chlorosis (CVC)-affected citrus plants using isolation in culture medium, denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) technique and Methylobacterium mesophilicum as well as Xylella fastidiosa specific PCR, allowing to assess this community and its interactions with CVC. The study of bacterial community by DGGE analysis allowed the detection of X. fastidiosa, as well as Klebsiella sp. e Acinetobacter sp., which were not detected previously. Curtobacterium sp., Pseudomonas sp., Enterobacter sp. and Bacillus spp. were also observed as endophyte in citrus plants. Using specific primers Methylobacterium mesophilicum and X. fastidiosa were observed, reinforcing that these bacteria could interact inside the host plant.