Endogamia e limite de seleção em populações selecionadas obtidas por simulação Inbreeding and selection limit in selected population obtained by simulation

• Main Authors: Fernanda Cristina Breda, Ricardo Frederico Euclydes, Carmen Silva Pereira, Robledo de Almeida Torres, Paulo Luiz Souza Carneiro, José Lindenberg Rocha Sarmento, Rodolpho de Almeida Torres Filho, Antonia Kécya França Moita
• Format: Article
• Language: English
• Published: Sociedade Brasileira de Zootecnia 2004-12-01
• Series: Revista Brasileira de Zootecnia
• Subjects: endogamia; população base; seleção; tamanho efetivo da população; inbreeding; base population; selection; population effective sizes
• Online Access: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982004000800013

Objetivou-se, com este trabalho, avaliar o comportamento do coeficiente de endogamia e do limite de seleção considerando população-base selecionada. Utilizou-se o programa GENESYS para a simulação do genoma constituído de uma única característica quantitativa com valor de herdabilidade igual a 0,40, população-base, população inicial e populações sob seleção. Foram consideradas três gerações distintas como gerações bases, gerações zero (G0PB), três (G3PB) e sete (G7PB). As populações foram selecionadas a partir dos valores genéticos obtidos pelo melhor preditor linear não-viesado (BLUP) e com base no desempenho individual, sendo considerados: a) dois tamanhos efetivos de população (Ne1 = 38,09 e Ne2 = 88,88) e b) dois sistemas de acasalamentos dos reprodutores selecionados (reprodutores acasalados aleatoriamente - RAA e exclusão de irmãos completos - EIC). Os parâmetros avaliados foram: coeficiente médio de endogamia, percentagem de locos fixados favoravelmente e limite de seleção. A não-utilização da população-base verdadeira (G0PB) subestimou os coeficientes de endogamia. As populações que utilizaram as gerações três e sete como base apresentaram as mesmas taxas de fixação de alelos favoráveis e os mesmos valores do limite de seleção das populações que consideraram a G0PB.<br>Objective was to evaluate the behavior average inbreeding coefficient associated to the selection limit considering selected population as base population. GENESYS program was used for simulation of the genome (one trait of h² = 0.40), base population, initial population and populations under selection. Three different generations were considered as base generations, zero (G0PB), three (G3PB) and seven (G7PB). Populations were selected based on best linear unbiased predictor (BLUP) and on individual phenotype in which were considered: a) two effective population sizes (Ne1 = 38.09 and Ne2 = 88.88) and b) two mating systems (random mating - RAA and exclusion of full sibs - EIC). Evaluated parameters were: average inbreeding coefficient, fixation of favorable alleles and selection limit. Selected populations considered as true base population resulted in underestimated inbreeding coefficient. Populations that used generations three and seven as true base population presented the same rates of fixation of favorable alleles and the same values for selection limit as those of populations that considered G0PB.