بررسی اثر ژن‌های مرتبط با میتوپروتئوم بر رشد ماهیچه سینه مرغ بومی اصفهان به‌وسیله داده RNA-seq
این آزمایش به منظور بررسی و شناسایی تفاوت‌های ژنتیکی و مسیرهای متابولیکی مرتبط با میتوکندری بین توده مرغ بومی اصفهان و یک سویه جوجه تجاری راس 708 با سرعت رشدهای متفاوت، انجام شد. بدین منظور از روش توالی‌یابی RNA-seq با استفاده از چهار نمونه ماهیچه سینه 28 روزگی استفاده شد. مقایسه آماری بیان ژن‌های ت...
| Main Authors: | , , , , |
|---|---|
| Format: | Article |
| Language: | fas |
| Published: |
Ferdowsi University of Mashhad
2018-12-01
|
| Series: | پژوهشهای علوم دامی ایران |
| Subjects: | |
| Online Access: | https://ijasr.um.ac.ir/article_36298_f1254f3fac579fb83cbab0bf10a9d1ba.pdf |
| id |
doaj-1cc93deaa7d84679b797004de71974bb |
|---|---|
| record_format |
Article |
| spelling |
doaj-1cc93deaa7d84679b797004de71974bb2021-04-07T03:55:22ZfasFerdowsi University of Mashhadپژوهشهای علوم دامی ایران2008-31062423-40012018-12-0110340341610.22067/ijasr.v10i3.6617636298بررسی اثر ژن‌های مرتبط با میتوپروتئوم بر رشد ماهیچه سینه مرغ بومی اصفهان به‌وسیله داده RNA-seqسید نادر آلبوشوکه0مجتبی طهمورث پور1محمد رضا بختیاری زاده2محمد رضا نصیری3سعید اسماعیل خانیان4فردوسی مشهدفردوسی مشهددانشگاه تهراندانشگاه فردوسی مشهدمرکز تحقیقات علوم دامی کشوراین آزمایش به منظور بررسی و شناسایی تفاوت‌های ژنتیکی و مسیرهای متابولیکی مرتبط با میتوکندری بین توده مرغ بومی اصفهان و یک سویه جوجه تجاری راس 708 با سرعت رشدهای متفاوت، انجام شد. بدین منظور از روش توالی‌یابی RNA-seq با استفاده از چهار نمونه ماهیچه سینه 28 روزگی استفاده شد. مقایسه آماری بیان ژن‌های توالی‌یابی شده در مرغ بومی و جوجه تجاری، 606 ژن با تفاوت معنی‌دار را مشخص نمود و از این تعداد 249 ژن در مرغ بومی و 357 ژن در جوجه تجاری افزایش بیان داشتند. بر اساس نتایج بیان ژن‌ها در مرغ بومی، فاکتور رونویسی FoxO3 موجب فعال شدن مسیر آتروفی لیگازهای یوبیکویتینی E3 و افزایش شکست پروتئین و در نتیجه کاهش حجم ماهیچه اسکلتی در مقایسه با جوجه تجاری شده است. هیپوکسی و تنظیم فرآیند متابولیکی گونه‌های اکسیژن فعال (ROS) از مهم‌ترین فرآیندهای بیولوژیکی فعال در مرغ بومی بودند. بررسی و مقایسه ژن‌های مرتبط با پروتئوم میتوکندریایی نشان داد در این مرغ تغییرات معنی‌داری در بیان بسیاری از پروتئین‌های وابسته به رشد و تنظیم‌کننده رونویسی وجود دارد. این تغییرات نشان‌دهنده برنامه سازگاری پیچیده‌ای است که شکست پروتئین را تسهیل نموده و سوخت گلوکز در ماهیچه را کاهش می‌دهد. این مسیرهای متابولیسمی در جهت کاستن سطح نیازمندی‌های مرغ بومی به گونه‌ای تکامل یافته‌اند تا توان این مرغ را در غلبه بر شرایط و تنش‌های محیطی و تحمل کمبودهای غذایی تقویت نمایند.https://ijasr.um.ac.ir/article_36298_f1254f3fac579fb83cbab0bf10a9d1ba.pdfماهیچه سینهمرغ بومیمیتوپروتئومrna-seq |
| collection |
DOAJ |
| language |
fas |
| format |
Article |
| sources |
DOAJ |
| author |
سید نادر آلبوشوکه مجتبی طهمورث پور محمد رضا بختیاری زاده محمد رضا نصیری سعید اسماعیل خانیان |
| spellingShingle |
سید نادر آلبوشوکه مجتبی طهمورث پور محمد رضا بختیاری زاده محمد رضا نصیری سعید اسماعیل خانیان بررسی اثر ژن‌های مرتبط با میتوپروتئوم بر رشد ماهیچه سینه مرغ بومی اصفهان به‌وسیله داده RNA-seq پژوهشهای علوم دامی ایران ماهیچه سینه مرغ بومی میتوپروتئوم rna-seq |
| author_facet |
سید نادر آلبوشوکه مجتبی طهمورث پور محمد رضا بختیاری زاده محمد رضا نصیری سعید اسماعیل خانیان |
| author_sort |
سید نادر آلبوشوکه |
| title |
بررسی اثر ژن‌های مرتبط با میتوپروتئوم بر رشد ماهیچه سینه مرغ بومی اصفهان به‌وسیله داده RNA-seq |
| title_short |
بررسی اثر ژن‌های مرتبط با میتوپروتئوم بر رشد ماهیچه سینه مرغ بومی اصفهان به‌وسیله داده RNA-seq |
| title_full |
بررسی اثر ژن‌های مرتبط با میتوپروتئوم بر رشد ماهیچه سینه مرغ بومی اصفهان به‌وسیله داده RNA-seq |
| title_fullStr |
بررسی اثر ژن‌های مرتبط با میتوپروتئوم بر رشد ماهیچه سینه مرغ بومی اصفهان به‌وسیله داده RNA-seq |
| title_full_unstemmed |
بررسی اثر ژن‌های مرتبط با میتوپروتئوم بر رشد ماهیچه سینه مرغ بومی اصفهان به‌وسیله داده RNA-seq |
| title_sort |
بررسی اثر ژن‌های مرتبط با میتوپروتئوم بر رشد ماهیچه سینه مرغ بومی اصفهان به‌وسیله داده rna-seq |
| publisher |
Ferdowsi University of Mashhad |
| series |
پژوهشهای علوم دامی ایران |
| issn |
2008-3106 2423-4001 |
| publishDate |
2018-12-01 |
| description |
این آزمایش به منظور بررسی و شناسایی تفاوت‌های ژنتیکی و مسیرهای متابولیکی مرتبط با میتوکندری بین توده مرغ بومی اصفهان و یک سویه جوجه تجاری راس 708 با سرعت رشدهای متفاوت، انجام شد. بدین منظور از روش توالی‌یابی RNA-seq با استفاده از چهار نمونه ماهیچه سینه 28 روزگی استفاده شد. مقایسه آماری بیان ژن‌های توالی‌یابی شده در مرغ بومی و جوجه تجاری، 606 ژن با تفاوت معنی‌دار را مشخص نمود و از این تعداد 249 ژن در مرغ بومی و 357 ژن در جوجه تجاری افزایش بیان داشتند. بر اساس نتایج بیان ژن‌ها در مرغ بومی، فاکتور رونویسی FoxO3 موجب فعال شدن مسیر آتروفی لیگازهای یوبیکویتینی E3 و افزایش شکست پروتئین و در نتیجه کاهش حجم ماهیچه اسکلتی در مقایسه با جوجه تجاری شده است. هیپوکسی و تنظیم فرآیند متابولیکی گونه‌های اکسیژن فعال (ROS) از مهم‌ترین فرآیندهای بیولوژیکی فعال در مرغ بومی بودند. بررسی و مقایسه ژن‌های مرتبط با پروتئوم میتوکندریایی نشان داد در این مرغ تغییرات معنی‌داری در بیان بسیاری از پروتئین‌های وابسته به رشد و تنظیم‌کننده رونویسی وجود دارد. این تغییرات نشان‌دهنده برنامه سازگاری پیچیده‌ای است که شکست پروتئین را تسهیل نموده و سوخت گلوکز در ماهیچه را کاهش می‌دهد. این مسیرهای متابولیسمی در جهت کاستن سطح نیازمندی‌های مرغ بومی به گونه‌ای تکامل یافته‌اند تا توان این مرغ را در غلبه بر شرایط و تنش‌های محیطی و تحمل کمبودهای غذایی تقویت نمایند. |
| topic |
ماهیچه سینه مرغ بومی میتوپروتئوم rna-seq |
| url |
https://ijasr.um.ac.ir/article_36298_f1254f3fac579fb83cbab0bf10a9d1ba.pdf |
| work_keys_str_mv |
AT sydnạdrậlbwsẖwḵh brrsyạtẖrzẖnhạymrtbṭbạmytwprwtỷwmbrrsẖdmạhycẖhsynhmrgẖbwmyạṣfhạnbhwsylhdạdhrnaseq AT mjtbyṭhmwrtẖpwr brrsyạtẖrzẖnhạymrtbṭbạmytwprwtỷwmbrrsẖdmạhycẖhsynhmrgẖbwmyạṣfhạnbhwsylhdạdhrnaseq AT mḥmdrḍạbkẖtyạryzạdh brrsyạtẖrzẖnhạymrtbṭbạmytwprwtỷwmbrrsẖdmạhycẖhsynhmrgẖbwmyạṣfhạnbhwsylhdạdhrnaseq AT mḥmdrḍạnṣyry brrsyạtẖrzẖnhạymrtbṭbạmytwprwtỷwmbrrsẖdmạhycẖhsynhmrgẖbwmyạṣfhạnbhwsylhdạdhrnaseq AT sʿydạsmạʿylkẖạnyạn brrsyạtẖrzẖnhạymrtbṭbạmytwprwtỷwmbrrsẖdmạhycẖhsynhmrgẖbwmyạṣfhạnbhwsylhdạdhrnaseq |
| _version_ |
1721536737908359168 |