فیلوژنی و تنوع ژنتیکی گونه ‌مرکب Fusarium graminearum مرتبط با سوختگی فوزاریومی خوشه گندم در دشت مغان

خصوصیات فیلوژنتیکی 37 جدایه متعلق به گونه مرکب <em>F. graminearum</em>، جدا شده از خوشه گندم با علایم بیماری سوختگی فوزاریومی از مناطق مختلف کشت گندم در دشت مغان، استان‌ اردبیل تعیین شد. بخشی از ژن‌های translation elongation factor 1-alpha (<em>TEF</em>)،reductase (<em>...

Full description

Bibliographic Details
Main Authors: کسری شریفی, رسول زارع, حمیدرضا زمانی‌زاده, منصوره میرابوالفتحی, سعید رضائی
Format: Article
Language:English
Published: Agricultural Research, Education and Extension Organization 2017-09-01
Series:رستنی‌ها
Subjects:
RED
TEF
URA
Online Access:http://rostaniha.areo.ir/article_113230_62c87a33dae65523cf4bd40c5361106a.pdf
id doaj-1de4ac8976ab49dab91ed2d0c504dca0
record_format Article
spelling doaj-1de4ac8976ab49dab91ed2d0c504dca02020-11-25T02:32:28ZengAgricultural Research, Education and Extension Organizationرستنی‌ها1608-43062423-66082017-09-01181334910.22092/botany.2017.113230113230فیلوژنی و تنوع ژنتیکی گونه ‌مرکب Fusarium graminearum مرتبط با سوختگی فوزاریومی خوشه گندم در دشت مغانکسری شریفی0رسول زارع1حمیدرضا زمانی‌زاده2منصوره میرابوالفتحی3سعید رضائی4گروه بیماری شناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد علوم و تحقیقات، تهران، ایراناستاد پژوهش، بخش تحقیقات رستنی‌ها، مؤسسه تحقیقات گیاه‌پزشکی کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، تهران، ایراناستاد گروه بیماری‌شناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد علوم و تحقیقات، تهران، ایران (hzamani@srbiau.ac.ir)استاد پژوهش، بخش تحقیقات بیماری‌های گیاهان، مؤسسه تحقیقات گیاه‌پزشکی کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، تهران، ایراناستادیار گروه بیماری‌شناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد علوم و تحقیقات، تهران، ایرانخصوصیات فیلوژنتیکی 37 جدایه متعلق به گونه مرکب <em>F. graminearum</em>، جدا شده از خوشه گندم با علایم بیماری سوختگی فوزاریومی از مناطق مختلف کشت گندم در دشت مغان، استان‌ اردبیل تعیین شد. بخشی از ژن‌های translation elongation factor 1-alpha (<em>TEF</em>)،reductase (<em>RED</em>)  و UTP-ammonia ligase (<em>URA</em>) با استفاده از آغازگرهای اختصاصی تکثیر، تعیین توالی و با الگوریتم تحلیل امساکی تجزیه شد. همه سویه‌های گونه مرکب <em>F. graminearum</em> متعلق به <em>F. graminearum</em> sensu stricto بودند. نتایج فیلوژنی نشان‌دهنده وجود همگنی ژنتیکی در بین جدایه‌های گونه‌ مرکب <em>F. graminearum</em> بود. به منظور ارزیابی ساختار ژنتیکی جمعیت قارچ <em>F. graminearum</em> s.s. از نشانگر ISSR استفاده شد. پنج آغازگر واجد چندشکلی زیاد و تکرارپذیری بالا برای تکثیر DNA جدایه‌ها استفاده شد. تجزیه خوشه‌ای داده‌ها، با استفاده از روش UPGMA و ضریب تشابه جاکارد انجام و ژنوتیپ‌ها را در سطح تشابه 82% به چهار گروه مجزا تفکیک کرد. نتایج تجزیه واریانس مولکولی نشان‌دهنده، بیشترین تنوع ژنتیکی در داخل جمعیت <em>F. graminearum</em> s.s. (%97) و کمترین در بین جمعیت‌ها (3%) بود. شناسایی فیلوژنتیکی و آگاهی از تنوع ژنتیکی عامل اصلی بیماری FHB‏، در تعیین روند تکامل بیمارگر و استراتژی‌های مدیریت بیماری مفید خواهد بود.http://rostaniha.areo.ir/article_113230_62c87a33dae65523cf4bd40c5361106a.pdfآغازگرهای ریزماهوارهسوختگی خوشهREDTEFURAISSR
collection DOAJ
language English
format Article
sources DOAJ
author کسری شریفی
رسول زارع
حمیدرضا زمانی‌زاده
منصوره میرابوالفتحی
سعید رضائی
spellingShingle کسری شریفی
رسول زارع
حمیدرضا زمانی‌زاده
منصوره میرابوالفتحی
سعید رضائی
فیلوژنی و تنوع ژنتیکی گونه ‌مرکب Fusarium graminearum مرتبط با سوختگی فوزاریومی خوشه گندم در دشت مغان
رستنی‌ها
آغازگرهای ریزماهواره
سوختگی خوشه
RED
TEF
URA
ISSR
author_facet کسری شریفی
رسول زارع
حمیدرضا زمانی‌زاده
منصوره میرابوالفتحی
سعید رضائی
author_sort کسری شریفی
title فیلوژنی و تنوع ژنتیکی گونه ‌مرکب Fusarium graminearum مرتبط با سوختگی فوزاریومی خوشه گندم در دشت مغان
title_short فیلوژنی و تنوع ژنتیکی گونه ‌مرکب Fusarium graminearum مرتبط با سوختگی فوزاریومی خوشه گندم در دشت مغان
title_full فیلوژنی و تنوع ژنتیکی گونه ‌مرکب Fusarium graminearum مرتبط با سوختگی فوزاریومی خوشه گندم در دشت مغان
title_fullStr فیلوژنی و تنوع ژنتیکی گونه ‌مرکب Fusarium graminearum مرتبط با سوختگی فوزاریومی خوشه گندم در دشت مغان
title_full_unstemmed فیلوژنی و تنوع ژنتیکی گونه ‌مرکب Fusarium graminearum مرتبط با سوختگی فوزاریومی خوشه گندم در دشت مغان
title_sort فیلوژنی و تنوع ژنتیکی گونه ‌مرکب fusarium graminearum مرتبط با سوختگی فوزاریومی خوشه گندم در دشت مغان
publisher Agricultural Research, Education and Extension Organization
series رستنی‌ها
issn 1608-4306
2423-6608
publishDate 2017-09-01
description خصوصیات فیلوژنتیکی 37 جدایه متعلق به گونه مرکب <em>F. graminearum</em>، جدا شده از خوشه گندم با علایم بیماری سوختگی فوزاریومی از مناطق مختلف کشت گندم در دشت مغان، استان‌ اردبیل تعیین شد. بخشی از ژن‌های translation elongation factor 1-alpha (<em>TEF</em>)،reductase (<em>RED</em>)  و UTP-ammonia ligase (<em>URA</em>) با استفاده از آغازگرهای اختصاصی تکثیر، تعیین توالی و با الگوریتم تحلیل امساکی تجزیه شد. همه سویه‌های گونه مرکب <em>F. graminearum</em> متعلق به <em>F. graminearum</em> sensu stricto بودند. نتایج فیلوژنی نشان‌دهنده وجود همگنی ژنتیکی در بین جدایه‌های گونه‌ مرکب <em>F. graminearum</em> بود. به منظور ارزیابی ساختار ژنتیکی جمعیت قارچ <em>F. graminearum</em> s.s. از نشانگر ISSR استفاده شد. پنج آغازگر واجد چندشکلی زیاد و تکرارپذیری بالا برای تکثیر DNA جدایه‌ها استفاده شد. تجزیه خوشه‌ای داده‌ها، با استفاده از روش UPGMA و ضریب تشابه جاکارد انجام و ژنوتیپ‌ها را در سطح تشابه 82% به چهار گروه مجزا تفکیک کرد. نتایج تجزیه واریانس مولکولی نشان‌دهنده، بیشترین تنوع ژنتیکی در داخل جمعیت <em>F. graminearum</em> s.s. (%97) و کمترین در بین جمعیت‌ها (3%) بود. شناسایی فیلوژنتیکی و آگاهی از تنوع ژنتیکی عامل اصلی بیماری FHB‏، در تعیین روند تکامل بیمارگر و استراتژی‌های مدیریت بیماری مفید خواهد بود.
topic آغازگرهای ریزماهواره
سوختگی خوشه
RED
TEF
URA
ISSR
url http://rostaniha.areo.ir/article_113230_62c87a33dae65523cf4bd40c5361106a.pdf
work_keys_str_mv AT ḵsrysẖryfy fylwzẖnywtnwʿzẖntyḵygwnhmrḵbfusariumgraminearummrtbṭbạswkẖtgyfwzạrywmykẖwsẖhgndmdrdsẖtmgẖạn
AT rswlzạrʿ fylwzẖnywtnwʿzẖntyḵygwnhmrḵbfusariumgraminearummrtbṭbạswkẖtgyfwzạrywmykẖwsẖhgndmdrdsẖtmgẖạn
AT ḥmydrḍạzmạnyzạdh fylwzẖnywtnwʿzẖntyḵygwnhmrḵbfusariumgraminearummrtbṭbạswkẖtgyfwzạrywmykẖwsẖhgndmdrdsẖtmgẖạn
AT mnṣwrhmyrạbwạlftḥy fylwzẖnywtnwʿzẖntyḵygwnhmrḵbfusariumgraminearummrtbṭbạswkẖtgyfwzạrywmykẖwsẖhgndmdrdsẖtmgẖạn
AT sʿydrḍạỷy fylwzẖnywtnwʿzẖntyḵygwnhmrḵbfusariumgraminearummrtbṭbạswkẖtgyfwzạrywmykẖwsẖhgndmdrdsẖtmgẖạn
_version_ 1724818998102589440