فیلوژنی و تنوع ژنتیکی گونه مرکب Fusarium graminearum مرتبط با سوختگی فوزاریومی خوشه گندم در دشت مغان
خصوصیات فیلوژنتیکی 37 جدایه متعلق به گونه مرکب <em>F. graminearum</em>، جدا شده از خوشه گندم با علایم بیماری سوختگی فوزاریومی از مناطق مختلف کشت گندم در دشت مغان، استان اردبیل تعیین شد. بخشی از ژنهای translation elongation factor 1-alpha (<em>TEF</em>)،reductase (<em>...
Main Authors: | , , , , |
---|---|
Format: | Article |
Language: | English |
Published: |
Agricultural Research, Education and Extension Organization
2017-09-01
|
Series: | رستنیها |
Subjects: | |
Online Access: | http://rostaniha.areo.ir/article_113230_62c87a33dae65523cf4bd40c5361106a.pdf |
id |
doaj-1de4ac8976ab49dab91ed2d0c504dca0 |
---|---|
record_format |
Article |
spelling |
doaj-1de4ac8976ab49dab91ed2d0c504dca02020-11-25T02:32:28ZengAgricultural Research, Education and Extension Organizationرستنیها1608-43062423-66082017-09-01181334910.22092/botany.2017.113230113230فیلوژنی و تنوع ژنتیکی گونه مرکب Fusarium graminearum مرتبط با سوختگی فوزاریومی خوشه گندم در دشت مغانکسری شریفی0رسول زارع1حمیدرضا زمانیزاده2منصوره میرابوالفتحی3سعید رضائی4گروه بیماری شناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد علوم و تحقیقات، تهران، ایراناستاد پژوهش، بخش تحقیقات رستنیها، مؤسسه تحقیقات گیاهپزشکی کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، تهران، ایراناستاد گروه بیماریشناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد علوم و تحقیقات، تهران، ایران (hzamani@srbiau.ac.ir)استاد پژوهش، بخش تحقیقات بیماریهای گیاهان، مؤسسه تحقیقات گیاهپزشکی کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، تهران، ایراناستادیار گروه بیماریشناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد علوم و تحقیقات، تهران، ایرانخصوصیات فیلوژنتیکی 37 جدایه متعلق به گونه مرکب <em>F. graminearum</em>، جدا شده از خوشه گندم با علایم بیماری سوختگی فوزاریومی از مناطق مختلف کشت گندم در دشت مغان، استان اردبیل تعیین شد. بخشی از ژنهای translation elongation factor 1-alpha (<em>TEF</em>)،reductase (<em>RED</em>) و UTP-ammonia ligase (<em>URA</em>) با استفاده از آغازگرهای اختصاصی تکثیر، تعیین توالی و با الگوریتم تحلیل امساکی تجزیه شد. همه سویههای گونه مرکب <em>F. graminearum</em> متعلق به <em>F. graminearum</em> sensu stricto بودند. نتایج فیلوژنی نشاندهنده وجود همگنی ژنتیکی در بین جدایههای گونه مرکب <em>F. graminearum</em> بود. به منظور ارزیابی ساختار ژنتیکی جمعیت قارچ <em>F. graminearum</em> s.s. از نشانگر ISSR استفاده شد. پنج آغازگر واجد چندشکلی زیاد و تکرارپذیری بالا برای تکثیر DNA جدایهها استفاده شد. تجزیه خوشهای دادهها، با استفاده از روش UPGMA و ضریب تشابه جاکارد انجام و ژنوتیپها را در سطح تشابه 82% به چهار گروه مجزا تفکیک کرد. نتایج تجزیه واریانس مولکولی نشاندهنده، بیشترین تنوع ژنتیکی در داخل جمعیت <em>F. graminearum</em> s.s. (%97) و کمترین در بین جمعیتها (3%) بود. شناسایی فیلوژنتیکی و آگاهی از تنوع ژنتیکی عامل اصلی بیماری FHB، در تعیین روند تکامل بیمارگر و استراتژیهای مدیریت بیماری مفید خواهد بود.http://rostaniha.areo.ir/article_113230_62c87a33dae65523cf4bd40c5361106a.pdfآغازگرهای ریزماهوارهسوختگی خوشهREDTEFURAISSR |
collection |
DOAJ |
language |
English |
format |
Article |
sources |
DOAJ |
author |
کسری شریفی رسول زارع حمیدرضا زمانیزاده منصوره میرابوالفتحی سعید رضائی |
spellingShingle |
کسری شریفی رسول زارع حمیدرضا زمانیزاده منصوره میرابوالفتحی سعید رضائی فیلوژنی و تنوع ژنتیکی گونه مرکب Fusarium graminearum مرتبط با سوختگی فوزاریومی خوشه گندم در دشت مغان رستنیها آغازگرهای ریزماهواره سوختگی خوشه RED TEF URA ISSR |
author_facet |
کسری شریفی رسول زارع حمیدرضا زمانیزاده منصوره میرابوالفتحی سعید رضائی |
author_sort |
کسری شریفی |
title |
فیلوژنی و تنوع ژنتیکی گونه مرکب Fusarium graminearum مرتبط با سوختگی فوزاریومی خوشه گندم در دشت مغان |
title_short |
فیلوژنی و تنوع ژنتیکی گونه مرکب Fusarium graminearum مرتبط با سوختگی فوزاریومی خوشه گندم در دشت مغان |
title_full |
فیلوژنی و تنوع ژنتیکی گونه مرکب Fusarium graminearum مرتبط با سوختگی فوزاریومی خوشه گندم در دشت مغان |
title_fullStr |
فیلوژنی و تنوع ژنتیکی گونه مرکب Fusarium graminearum مرتبط با سوختگی فوزاریومی خوشه گندم در دشت مغان |
title_full_unstemmed |
فیلوژنی و تنوع ژنتیکی گونه مرکب Fusarium graminearum مرتبط با سوختگی فوزاریومی خوشه گندم در دشت مغان |
title_sort |
فیلوژنی و تنوع ژنتیکی گونه مرکب fusarium graminearum مرتبط با سوختگی فوزاریومی خوشه گندم در دشت مغان |
publisher |
Agricultural Research, Education and Extension Organization |
series |
رستنیها |
issn |
1608-4306 2423-6608 |
publishDate |
2017-09-01 |
description |
خصوصیات فیلوژنتیکی 37 جدایه متعلق به گونه مرکب <em>F. graminearum</em>، جدا شده از خوشه گندم با علایم بیماری سوختگی فوزاریومی از مناطق مختلف کشت گندم در دشت مغان، استان اردبیل تعیین شد. بخشی از ژنهای translation elongation factor 1-alpha (<em>TEF</em>)،reductase (<em>RED</em>) و UTP-ammonia ligase (<em>URA</em>) با استفاده از آغازگرهای اختصاصی تکثیر، تعیین توالی و با الگوریتم تحلیل امساکی تجزیه شد. همه سویههای گونه مرکب <em>F. graminearum</em> متعلق به <em>F. graminearum</em> sensu stricto بودند. نتایج فیلوژنی نشاندهنده وجود همگنی ژنتیکی در بین جدایههای گونه مرکب <em>F. graminearum</em> بود. به منظور ارزیابی ساختار ژنتیکی جمعیت قارچ <em>F. graminearum</em> s.s. از نشانگر ISSR استفاده شد. پنج آغازگر واجد چندشکلی زیاد و تکرارپذیری بالا برای تکثیر DNA جدایهها استفاده شد. تجزیه خوشهای دادهها، با استفاده از روش UPGMA و ضریب تشابه جاکارد انجام و ژنوتیپها را در سطح تشابه 82% به چهار گروه مجزا تفکیک کرد. نتایج تجزیه واریانس مولکولی نشاندهنده، بیشترین تنوع ژنتیکی در داخل جمعیت <em>F. graminearum</em> s.s. (%97) و کمترین در بین جمعیتها (3%) بود. شناسایی فیلوژنتیکی و آگاهی از تنوع ژنتیکی عامل اصلی بیماری FHB، در تعیین روند تکامل بیمارگر و استراتژیهای مدیریت بیماری مفید خواهد بود. |
topic |
آغازگرهای ریزماهواره سوختگی خوشه RED TEF URA ISSR |
url |
http://rostaniha.areo.ir/article_113230_62c87a33dae65523cf4bd40c5361106a.pdf |
work_keys_str_mv |
AT ḵsrysẖryfy fylwzẖnywtnwʿzẖntyḵygwnhmrḵbfusariumgraminearummrtbṭbạswkẖtgyfwzạrywmykẖwsẖhgndmdrdsẖtmgẖạn AT rswlzạrʿ fylwzẖnywtnwʿzẖntyḵygwnhmrḵbfusariumgraminearummrtbṭbạswkẖtgyfwzạrywmykẖwsẖhgndmdrdsẖtmgẖạn AT ḥmydrḍạzmạnyzạdh fylwzẖnywtnwʿzẖntyḵygwnhmrḵbfusariumgraminearummrtbṭbạswkẖtgyfwzạrywmykẖwsẖhgndmdrdsẖtmgẖạn AT mnṣwrhmyrạbwạlftḥy fylwzẖnywtnwʿzẖntyḵygwnhmrḵbfusariumgraminearummrtbṭbạswkẖtgyfwzạrywmykẖwsẖhgndmdrdsẖtmgẖạn AT sʿydrḍạỷy fylwzẖnywtnwʿzẖntyḵygwnhmrḵbfusariumgraminearummrtbṭbạswkẖtgyfwzạrywmykẖwsẖhgndmdrdsẖtmgẖạn |
_version_ |
1724818998102589440 |