Genetic variability of Harton del Valle by RAM Variabilidad genética de Hartón del Valle mediante RAM

<span style="font-size: 10pt; font-family: Arial">Harton del Valle (HV) breed belong to the seven Creole breeds of the Colombian bovine livestock, according to FAO criteria it is considered as vulnerable. To study its genetical variability, 33 HV animals and three and 3 anima...

Full description

Bibliographic Details
Main Authors: Alvarez Franco Luz Angela, Muñoz Jaime Eduardo, Posso Terranova Andrés Mauricio, Piedrahita Ana María
Format: Article
Language:English
Published: Universidad Nacional de Colombia 2008-03-01
Series:Acta Agronómica
Subjects:
Online Access:http://revistas.unal.edu.co/index.php/acta_agronomica/article/view/1058
Description
Summary:&lt;span style="font-size: 10pt; font-family: Arial"&gt;Harton del Valle (HV) breed belong to the seven Creole breeds of the Colombian bovine livestock, according to FAO criteria it is considered as vulnerable. To study its genetical variability, 33 HV animals and three and 3 animals of Holstein breed as a external control were sampled. Simples of DNA were isolated using the Salting Out method and RAM (Random amplified microsatellites) technique was used. CGA, CCA, TG and CT primers were used. The mean value of expected heterocigozity was 0.26 and F&lt;sub&gt;ST&lt;/sub&gt; fue 0.39 ± 0.03. Using Dice–Nei Li index and UPGMA clustering method, two groups were distinguished: the first one integrated for two conservation herds and other one by tour faros that have been sharing breeding bulls.&lt;/span&gt;&lt;span style="font-size: 10pt; font-family: Arial"&gt;&lt;/span&gt;<br>&lt;span style="font-size: 10pt; font-family: Arial"&gt;El Hartón del Valle (HV) hace parte de las siete razas criollas de ganado bovino colombiano y de acuerdo con los criterios de la FAO está considerado como vulnerable. Para estudiar su variabilidad genética fueron muestreados 33 individuos HV y tres animales de la raza Holstein, como control externo. Se extrajo ADN utilizando el método de &lt;em&gt;Salting Out&lt;/em&gt; y las muestras fueron analizadas mediante la técnica molecular RAM (&lt;em&gt;Randon amplified microsatellites&lt;/em&gt;). Se utilizaron los cebadores CGA, CCA, TG, y CT. El valor promedio de heterocigosidad esperada fue de 0.26 y el F&lt;sub&gt;ST&lt;/sub&gt; fue 0.39 ± 0.03. Con el índice de Dice–Nei Li y agrupando con el método UPGMA se distinguieron dos grupos: uno integrado por dos hatos de conservación y el otro por cuatro fincas que han compartido reproductores.&lt;/span&gt;
ISSN:0120-2812