USO DE MÉTODOS MULTIVARIANTES PARA LA AGRUPACIÓN DE AISLAMIENTOS DE Colletotrichum spp. CON BASE EN CARACTERÍSTICAS MORFOLÓGICAS Y CULTURALES USE OF MULTIVARIATE METHODS FOR GROUPING STRAINS OF Colletotrichum spp. BASED ON CULTURAL AND MORPHOLOGICAL CHARACTERS

• Main Authors: Guillermo Correa Londoño, Lelia Leonor Lavalett Oñate, María Purificación Galindo Villardón, Lucía Afanador Kafuri
• Format: Article
• Language: English
• Published: Universidad Nacional de Colombia, Sede Medellín 2007-06-01
• Series: Revista Facultad Nacional de Agronomía Medellín
• Subjects: Colletotrichum; análisis de coordenadas principales; coeficiente de similitud de Gower; Biplot; Principal coordinates analysis; Gower’s similarity coefficient
• Online Access: http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0304-28472007000100004

Se evaluaron 15 variables morfológicas y culturales, con mezcla de variables cuantitativas y cualitativas, a 58 aislamientos de Colletotrichum spp. con cuatro repeticiones. Se generó una agrupación guiada por el Análisis de Coordenadas Principales (ACOP), basado en el coeficiente de similitud de Gower. Las dos primeras dimensiones del ACOP permitieron la perfecta discriminación de tres grandes grupos: la primera dimensión separaba a Colletotrichum gloeosporioides y su teleomorfo Glomerella cingulata de C. dematium; la segunda dimensión permitía separar a C. gloeosporioides de su teleomorfo G. cingulata. Mediante el análisis simultáneo de los tres primeros ejes factoriales, se detectaron 21 grupos menores. Para la caracterización de los grupos se usó la representación Biplot de la tabla de contingencia de los grupos y las variables. Se trabajó con las frecuencias relativas al tamaño de los grupos para evitar la alta influencia que de otra forma tendrían los grupos más numerosos sobre las configuraciones Biplot.<br>Fifteen cultural and morphological characteristics, with a mix of quantitative and qualitative variables, were evaluated on 58 strains of Colletotrichum spp. repeated four times. Using Principal Coordinates Analysis (PCOA), based on Gower’s similarity coefficient, a grouping was obtained. The two first dimensions of PCOA allowed the perfect discrimination of three big groups: the first dimension separated Colletotrichum gloeosporioides and its teleomorph Glomerella cingulata from C. dematium; the second dimension discriminated between C. gloeosporioides and its teleomorph G. cingulata. By analyzing simultaneously the first three factorial axis, 21 minor groups were detected. In order to characterize the groups, a Biplot representation of the groups and variables contingency table was used. Relative frequencies to the size of the groups were used to avoid the high influence that otherwise the more numerous groups would have exerted on the Biplot configurations.