Análise da diversidade genética por AFLP e identificação de marcadores associados à resistência a doenças em videira Genetic diversity and identification of AFLP markers associated with diseases resistance in grapevine

• Main Authors: Paulo Ricardo Dias de Oliveira, Danielle Camargo Scotton, Deborah Sanae Nishimura, Antonio Figueira
• Format: Article
• Language: English
• Published: Sociedade Brasileira de Fruticultura 2005-12-01
• Series: Revista Brasileira de Fruticultura
• Subjects: videira; marcadores AFLP; resistência a doenças; míldio; oídio; grapevine; AFLP markers; disease resistance; downy mildew; powdery mildew
• Online Access: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-29452005000300027

Com objetivo de estudar diversidade genética e identificar marcadores associados à resistência ao míldio (Plasmopara viticola) e ao oídio (Uncinula necator), foram analisadas as cultivares de videira A 1976, CG 87746, CNPUV 154-27, Crimson Seedless, Gota de Ouro, Itália, Seyve Villard 12327 e Seyve Villard 12375. As análises de polimorfismo de comprimento de fragmento amplificado (AFLP) seguiram as etapas de digestão, ligação, pré-amplificação e amplificação. Efetuou-se a separação dos fragmentos amplificados em gel de 7% de poliacrilamida desnaturante (uréia 7M) e coloração com nitrato de prata. A similaridade foi estimada com base no coeficiente de Jaccard, e a agregação, por UPGMA. Foi gerada uma matriz de similaridade com bom ajustamento da agregação (r = 0,84). Os agrupamentos obtidos corresponderam à origem e classificação botânica das cultivares. Foram identificadas 15 marcas dissimilares associadas à resistência, sendo oito para míldio e sete para oídio.<br>The grapevine cultivars A 1976, CG 87746, CNPUV 154-27, Crimson Seedless, Gota de Ouro, Itália, Seyve Villard 12327 and Seyve Villard 12375 were analyzed to establish the genetic relationship and to identify markers associated with resistance to downy mildew (Plasmopara viticola) and powdery mildew (Uncinula necator). The amplified fragment lenght polymorphism (AFLP) analysis comprise the steps of digestion, ligation, preamplification and amplification. The amplified fragments were separeted on a 7% denaturing polyacrylamide gel (7M urea) and silver stained. The similarity was estimated using Jaccard's coefficient and the clustering was estimated by UPGMA. A similarity matrix was generated with a good fit for aggregation (r = 0,84). The clusters corresponded to origin and botany classification of the cultivars. Fifteen markers were associated with resistance, eight for downy mildew and seven for powdery mildew.