Bursa ve Bilecik İlleri Şeftali Yetiştiriciliği Yapılan Alanlarda Prune dwarf virus (PDV) Yaygınlığı ve Genetik Çeşitliliği

Prune dwarf virus (PDV), sert çekirdekli meyve ağaçlarının önemli viral patojenleri arasında yer almaktadır. Bu çalışmada Türkiye’nin önemli şeftali üretiminin yapıldığı Bursa ve Bilecik illerinde ilk kapsamlı PDV enfeksiyonu araştırılmıştır. 460 viral simptom şüphesi ile toplanan şeftali yaprağı DA...

Full description

Bibliographic Details
Main Authors: Ali Çelık, Filiz Ertunç
Format: Article
Language:English
Published: Abant İzzet Baysal University 2020-04-01
Series:Uluslararası Tarım ve Yaban Hayatı Bilimleri Dergisi
Subjects:
pdv
Online Access:https://dergipark.org.tr/tr/pub/ijaws/issue/53678/663272
id doaj-5d955f01221342b1890bacbc9cd784c9
record_format Article
spelling doaj-5d955f01221342b1890bacbc9cd784c92021-02-05T10:47:23ZengAbant İzzet Baysal UniversityUluslararası Tarım ve Yaban Hayatı Bilimleri Dergisi2149-82452020-04-0161667410.24180/ijaws.6632721746Bursa ve Bilecik İlleri Şeftali Yetiştiriciliği Yapılan Alanlarda Prune dwarf virus (PDV) Yaygınlığı ve Genetik ÇeşitliliğiAli Çelık0Filiz Ertunç1ABANT İZZET BAYSAL ÜNİVERSİTESİANKARA ÜNİVERSİTESİ, ZİRAAT FAKÜLTESİPrune dwarf virus (PDV), sert çekirdekli meyve ağaçlarının önemli viral patojenleri arasında yer almaktadır. Bu çalışmada Türkiye’nin önemli şeftali üretiminin yapıldığı Bursa ve Bilecik illerinde ilk kapsamlı PDV enfeksiyonu araştırılmıştır. 460 viral simptom şüphesi ile toplanan şeftali yaprağı DAS-ELISA testine tabi tutulmuş ve 19 örneğin (%4.13) PDV ile enfekteli olduğu tespit edilmiştir. Yapılan RT-PCR çalışmaları sonucunda virüsün kılıf protein bölgesine ait 862 bp uzunluğunda nükleotid dizileri elde edilmiş, elde edilen diziler GenBank’ta kayıtlı Türkiye ve dünya PDV referans izolatları ile karşılaştırılmıştır. Yapılan BLASTn analizi sonucunda PDV şeftali Türkiye izolatları, referans PDV sekans verileri ile nükleotid düzeyinde %87.77-97.56 arasında benzerlik göstermiştir. Nükleotid dizi bilgisi elde edilen izolatların filogenetik analiz çalışmaları ile, dünya ve Türkiye izolatları ile ilişkisi belirlenmiştir. Araştırma bulguları coğrafik orijin ve farklı Prunus türlerinden izole edilen PDV izolatları arasında herhangi bir filogenetik ilişkinin olmadığını göstermiştir. Çalışma sonucunda ilk kez ülkemizde şeftali PDV izolatlarının kılıf protein bölgesine ait nükleotid dizileri elde edilmiştir.https://dergipark.org.tr/tr/pub/ijaws/issue/53678/663272bursabilecikşeftalipdvenfeksiyonbursabilecikpeachpdvinfection
collection DOAJ
language English
format Article
sources DOAJ
author Ali Çelık
Filiz Ertunç
spellingShingle Ali Çelık
Filiz Ertunç
Bursa ve Bilecik İlleri Şeftali Yetiştiriciliği Yapılan Alanlarda Prune dwarf virus (PDV) Yaygınlığı ve Genetik Çeşitliliği
Uluslararası Tarım ve Yaban Hayatı Bilimleri Dergisi
bursa
bilecik
şeftali
pdv
enfeksiyon
bursa
bilecik
peach
pdv
infection
author_facet Ali Çelık
Filiz Ertunç
author_sort Ali Çelık
title Bursa ve Bilecik İlleri Şeftali Yetiştiriciliği Yapılan Alanlarda Prune dwarf virus (PDV) Yaygınlığı ve Genetik Çeşitliliği
title_short Bursa ve Bilecik İlleri Şeftali Yetiştiriciliği Yapılan Alanlarda Prune dwarf virus (PDV) Yaygınlığı ve Genetik Çeşitliliği
title_full Bursa ve Bilecik İlleri Şeftali Yetiştiriciliği Yapılan Alanlarda Prune dwarf virus (PDV) Yaygınlığı ve Genetik Çeşitliliği
title_fullStr Bursa ve Bilecik İlleri Şeftali Yetiştiriciliği Yapılan Alanlarda Prune dwarf virus (PDV) Yaygınlığı ve Genetik Çeşitliliği
title_full_unstemmed Bursa ve Bilecik İlleri Şeftali Yetiştiriciliği Yapılan Alanlarda Prune dwarf virus (PDV) Yaygınlığı ve Genetik Çeşitliliği
title_sort bursa ve bilecik i̇lleri şeftali yetiştiriciliği yapılan alanlarda prune dwarf virus (pdv) yaygınlığı ve genetik çeşitliliği
publisher Abant İzzet Baysal University
series Uluslararası Tarım ve Yaban Hayatı Bilimleri Dergisi
issn 2149-8245
publishDate 2020-04-01
description Prune dwarf virus (PDV), sert çekirdekli meyve ağaçlarının önemli viral patojenleri arasında yer almaktadır. Bu çalışmada Türkiye’nin önemli şeftali üretiminin yapıldığı Bursa ve Bilecik illerinde ilk kapsamlı PDV enfeksiyonu araştırılmıştır. 460 viral simptom şüphesi ile toplanan şeftali yaprağı DAS-ELISA testine tabi tutulmuş ve 19 örneğin (%4.13) PDV ile enfekteli olduğu tespit edilmiştir. Yapılan RT-PCR çalışmaları sonucunda virüsün kılıf protein bölgesine ait 862 bp uzunluğunda nükleotid dizileri elde edilmiş, elde edilen diziler GenBank’ta kayıtlı Türkiye ve dünya PDV referans izolatları ile karşılaştırılmıştır. Yapılan BLASTn analizi sonucunda PDV şeftali Türkiye izolatları, referans PDV sekans verileri ile nükleotid düzeyinde %87.77-97.56 arasında benzerlik göstermiştir. Nükleotid dizi bilgisi elde edilen izolatların filogenetik analiz çalışmaları ile, dünya ve Türkiye izolatları ile ilişkisi belirlenmiştir. Araştırma bulguları coğrafik orijin ve farklı Prunus türlerinden izole edilen PDV izolatları arasında herhangi bir filogenetik ilişkinin olmadığını göstermiştir. Çalışma sonucunda ilk kez ülkemizde şeftali PDV izolatlarının kılıf protein bölgesine ait nükleotid dizileri elde edilmiştir.
topic bursa
bilecik
şeftali
pdv
enfeksiyon
bursa
bilecik
peach
pdv
infection
url https://dergipark.org.tr/tr/pub/ijaws/issue/53678/663272
work_keys_str_mv AT alicelık bursavebilecikilleriseftaliyetistiriciligiyapılanalanlardaprunedwarfviruspdvyaygınlıgıvegenetikcesitliligi
AT filizertunc bursavebilecikilleriseftaliyetistiriciligiyapılanalanlardaprunedwarfviruspdvyaygınlıgıvegenetikcesitliligi
_version_ 1724283719344193536