Bursa ve Bilecik İlleri Şeftali Yetiştiriciliği Yapılan Alanlarda Prune dwarf virus (PDV) Yaygınlığı ve Genetik Çeşitliliği
Prune dwarf virus (PDV), sert çekirdekli meyve ağaçlarının önemli viral patojenleri arasında yer almaktadır. Bu çalışmada Türkiye’nin önemli şeftali üretiminin yapıldığı Bursa ve Bilecik illerinde ilk kapsamlı PDV enfeksiyonu araştırılmıştır. 460 viral simptom şüphesi ile toplanan şeftali yaprağı DA...
Main Authors: | , |
---|---|
Format: | Article |
Language: | English |
Published: |
Abant İzzet Baysal University
2020-04-01
|
Series: | Uluslararası Tarım ve Yaban Hayatı Bilimleri Dergisi |
Subjects: | |
Online Access: | https://dergipark.org.tr/tr/pub/ijaws/issue/53678/663272 |
id |
doaj-5d955f01221342b1890bacbc9cd784c9 |
---|---|
record_format |
Article |
spelling |
doaj-5d955f01221342b1890bacbc9cd784c92021-02-05T10:47:23ZengAbant İzzet Baysal UniversityUluslararası Tarım ve Yaban Hayatı Bilimleri Dergisi2149-82452020-04-0161667410.24180/ijaws.6632721746Bursa ve Bilecik İlleri Şeftali Yetiştiriciliği Yapılan Alanlarda Prune dwarf virus (PDV) Yaygınlığı ve Genetik ÇeşitliliğiAli Çelık0Filiz Ertunç1ABANT İZZET BAYSAL ÜNİVERSİTESİANKARA ÜNİVERSİTESİ, ZİRAAT FAKÜLTESİPrune dwarf virus (PDV), sert çekirdekli meyve ağaçlarının önemli viral patojenleri arasında yer almaktadır. Bu çalışmada Türkiye’nin önemli şeftali üretiminin yapıldığı Bursa ve Bilecik illerinde ilk kapsamlı PDV enfeksiyonu araştırılmıştır. 460 viral simptom şüphesi ile toplanan şeftali yaprağı DAS-ELISA testine tabi tutulmuş ve 19 örneğin (%4.13) PDV ile enfekteli olduğu tespit edilmiştir. Yapılan RT-PCR çalışmaları sonucunda virüsün kılıf protein bölgesine ait 862 bp uzunluğunda nükleotid dizileri elde edilmiş, elde edilen diziler GenBank’ta kayıtlı Türkiye ve dünya PDV referans izolatları ile karşılaştırılmıştır. Yapılan BLASTn analizi sonucunda PDV şeftali Türkiye izolatları, referans PDV sekans verileri ile nükleotid düzeyinde %87.77-97.56 arasında benzerlik göstermiştir. Nükleotid dizi bilgisi elde edilen izolatların filogenetik analiz çalışmaları ile, dünya ve Türkiye izolatları ile ilişkisi belirlenmiştir. Araştırma bulguları coğrafik orijin ve farklı Prunus türlerinden izole edilen PDV izolatları arasında herhangi bir filogenetik ilişkinin olmadığını göstermiştir. Çalışma sonucunda ilk kez ülkemizde şeftali PDV izolatlarının kılıf protein bölgesine ait nükleotid dizileri elde edilmiştir.https://dergipark.org.tr/tr/pub/ijaws/issue/53678/663272bursabilecikşeftalipdvenfeksiyonbursabilecikpeachpdvinfection |
collection |
DOAJ |
language |
English |
format |
Article |
sources |
DOAJ |
author |
Ali Çelık Filiz Ertunç |
spellingShingle |
Ali Çelık Filiz Ertunç Bursa ve Bilecik İlleri Şeftali Yetiştiriciliği Yapılan Alanlarda Prune dwarf virus (PDV) Yaygınlığı ve Genetik Çeşitliliği Uluslararası Tarım ve Yaban Hayatı Bilimleri Dergisi bursa bilecik şeftali pdv enfeksiyon bursa bilecik peach pdv infection |
author_facet |
Ali Çelık Filiz Ertunç |
author_sort |
Ali Çelık |
title |
Bursa ve Bilecik İlleri Şeftali Yetiştiriciliği Yapılan Alanlarda Prune dwarf virus (PDV) Yaygınlığı ve Genetik Çeşitliliği |
title_short |
Bursa ve Bilecik İlleri Şeftali Yetiştiriciliği Yapılan Alanlarda Prune dwarf virus (PDV) Yaygınlığı ve Genetik Çeşitliliği |
title_full |
Bursa ve Bilecik İlleri Şeftali Yetiştiriciliği Yapılan Alanlarda Prune dwarf virus (PDV) Yaygınlığı ve Genetik Çeşitliliği |
title_fullStr |
Bursa ve Bilecik İlleri Şeftali Yetiştiriciliği Yapılan Alanlarda Prune dwarf virus (PDV) Yaygınlığı ve Genetik Çeşitliliği |
title_full_unstemmed |
Bursa ve Bilecik İlleri Şeftali Yetiştiriciliği Yapılan Alanlarda Prune dwarf virus (PDV) Yaygınlığı ve Genetik Çeşitliliği |
title_sort |
bursa ve bilecik i̇lleri şeftali yetiştiriciliği yapılan alanlarda prune dwarf virus (pdv) yaygınlığı ve genetik çeşitliliği |
publisher |
Abant İzzet Baysal University |
series |
Uluslararası Tarım ve Yaban Hayatı Bilimleri Dergisi |
issn |
2149-8245 |
publishDate |
2020-04-01 |
description |
Prune dwarf virus (PDV), sert çekirdekli meyve
ağaçlarının önemli viral patojenleri arasında yer almaktadır. Bu çalışmada Türkiye’nin önemli
şeftali üretiminin yapıldığı Bursa ve Bilecik illerinde ilk kapsamlı PDV enfeksiyonu
araştırılmıştır. 460 viral simptom şüphesi ile toplanan şeftali yaprağı
DAS-ELISA testine tabi tutulmuş ve 19 örneğin (%4.13) PDV ile enfekteli olduğu
tespit edilmiştir. Yapılan RT-PCR çalışmaları sonucunda virüsün kılıf protein
bölgesine ait 862 bp uzunluğunda nükleotid dizileri elde edilmiş, elde edilen
diziler GenBank’ta kayıtlı Türkiye ve dünya PDV referans izolatları ile
karşılaştırılmıştır. Yapılan BLASTn analizi sonucunda PDV şeftali Türkiye
izolatları, referans PDV sekans verileri ile nükleotid düzeyinde %87.77-97.56
arasında benzerlik göstermiştir. Nükleotid dizi bilgisi elde edilen izolatların
filogenetik analiz çalışmaları ile, dünya ve Türkiye izolatları ile ilişkisi
belirlenmiştir. Araştırma bulguları coğrafik orijin ve farklı Prunus türlerinden izole edilen PDV
izolatları arasında herhangi bir filogenetik ilişkinin olmadığını göstermiştir.
Çalışma sonucunda ilk kez ülkemizde şeftali PDV izolatlarının kılıf protein
bölgesine ait nükleotid dizileri elde edilmiştir. |
topic |
bursa bilecik şeftali pdv enfeksiyon bursa bilecik peach pdv infection |
url |
https://dergipark.org.tr/tr/pub/ijaws/issue/53678/663272 |
work_keys_str_mv |
AT alicelık bursavebilecikilleriseftaliyetistiriciligiyapılanalanlardaprunedwarfviruspdvyaygınlıgıvegenetikcesitliligi AT filizertunc bursavebilecikilleriseftaliyetistiriciligiyapılanalanlardaprunedwarfviruspdvyaygınlıgıvegenetikcesitliligi |
_version_ |
1724283719344193536 |