Diversidad genética intra e inter-específica de ñame (Dioscorea spp.) de la región Caribe de Colombia mediante marcadores AFLP Genetic diversity intra and inter-specific yam (Dioscorea spp.) from the colombian caribbean region by AFLP markers

Conocer la variabilidad genética del ñame, Dioscorea spp., permite apoyar estrategias de mejoramiento y conservación de este recurso fitogenético. El objetivo de este estudio fue la caracterización molecular de 20 accesiones de Dioscorea spp. mediante la técnica molecular de AFLP para determinar cóm...

Full description

Bibliographic Details
Main Authors: Hernando Javier Rivera-Jiménez, Andrés Álvarez-Soto, Juan Diego Palacio-Mejía, Dora Yovana Barrios-Leal, Diana López-Álvarez
Format: Article
Language:English
Published: Universidad Nacional de Colombia 2011-12-01
Series:Acta Agronómica
Subjects:
Online Access:http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0120-28122011000400005
id doaj-6d222684839640d58b1a682511dce1dc
record_format Article
spelling doaj-6d222684839640d58b1a682511dce1dc2020-11-24T22:39:01ZengUniversidad Nacional de ColombiaActa Agronómica0120-28122011-12-01604328338Diversidad genética intra e inter-específica de ñame (Dioscorea spp.) de la región Caribe de Colombia mediante marcadores AFLP Genetic diversity intra and inter-specific yam (Dioscorea spp.) from the colombian caribbean region by AFLP markersHernando Javier Rivera-JiménezAndrés Álvarez-SotoJuan Diego Palacio-MejíaDora Yovana Barrios-LealDiana López-ÁlvarezConocer la variabilidad genética del ñame, Dioscorea spp., permite apoyar estrategias de mejoramiento y conservación de este recurso fitogenético. El objetivo de este estudio fue la caracterización molecular de 20 accesiones de Dioscorea spp. mediante la técnica molecular de AFLP para determinar cómo se distribuye la variabilidad genética de manera intra e inter-específica. Los datos fueron analizados mediante los métodos de agrupación de correspondencia múltiple y análisis de similaridad de Dice, estableciendo los niveles de confiabilidad de los grupos genéticos mediante remuestreos. En términos de diversidad interespecífica, los valores promedios de similitud variaron entre 41.81% entre D. alata L. y D. rotundata Poir., y 33.51% entre D. trifida L.f. y D. esculenta (Lour.) Burkill, lo que sugiere alta diversidad genética entre las accesiones estudiadas, que formaron cuatro grupos genéticos: D. alata, D. rotundata, D. esculenta y D. trifida, confirmando correspondencia entre la caracterización morfológica, clasificación botánica y la caracterización molecular. En términos de diversidad intraespecífica para la especie D. alata, el análisis también reveló una composición heterogénea en la región Caribe colombiana. Estos estudios ayudarán a definir una estrategia adecuada para fines de conservación y apoyar los esfuerzos futuros en los programas de mejoramiento genético.<br>Knowing the genetic variability of yams, Dioscorea spp., is a good tool to support development and conservation strategies of this plant as genetic resource. The aim of this study was to carried out the molecular characterization of 20 accessions of Dioscorea spp. using the AFLP molecular technique to determine how genetic variation is distributed intra-and inter-specifically. Using multiple correspondence analysis and level of reliability of the genetic groups by resampling, the results showed high genetic variability among the accessions studied giving as a result four genetic groups: D. alata L., D. rotundata Poir., D. esculenta (Lour.) Burkill and D. trifida L.f., which confirmed a correspondence between the morphological and molecular characterization. The average values of similarity ranged from 41.81% in D. alata and D. rotundata, and 33.51% in D. trifida and D. esculenta. These data are consistent with previous morphological characterizations and systematics of the species in relation to their botanical sections. The analysis also revealed the heterogeneous composition of D. alata in the colombian Caribbean region; these studies will help to define an appropriate strategy for conservation to support future efforts in breeding programs.http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0120-28122011000400005Características agronómicascaracterización molecularDioscorea sppmarcadores genéticosrecursos fitogenéticosregión Caribe de ColombiaAgronomy characterscolombian Caribbean regionDioscorea sppgenetic markermolecular characterizationplant genetic resources
collection DOAJ
language English
format Article
sources DOAJ
author Hernando Javier Rivera-Jiménez
Andrés Álvarez-Soto
Juan Diego Palacio-Mejía
Dora Yovana Barrios-Leal
Diana López-Álvarez
spellingShingle Hernando Javier Rivera-Jiménez
Andrés Álvarez-Soto
Juan Diego Palacio-Mejía
Dora Yovana Barrios-Leal
Diana López-Álvarez
Diversidad genética intra e inter-específica de ñame (Dioscorea spp.) de la región Caribe de Colombia mediante marcadores AFLP Genetic diversity intra and inter-specific yam (Dioscorea spp.) from the colombian caribbean region by AFLP markers
Acta Agronómica
Características agronómicas
caracterización molecular
Dioscorea spp
marcadores genéticos
recursos fitogenéticos
región Caribe de Colombia
Agronomy characters
colombian Caribbean region
Dioscorea spp
genetic marker
molecular characterization
plant genetic resources
author_facet Hernando Javier Rivera-Jiménez
Andrés Álvarez-Soto
Juan Diego Palacio-Mejía
Dora Yovana Barrios-Leal
Diana López-Álvarez
author_sort Hernando Javier Rivera-Jiménez
title Diversidad genética intra e inter-específica de ñame (Dioscorea spp.) de la región Caribe de Colombia mediante marcadores AFLP Genetic diversity intra and inter-specific yam (Dioscorea spp.) from the colombian caribbean region by AFLP markers
title_short Diversidad genética intra e inter-específica de ñame (Dioscorea spp.) de la región Caribe de Colombia mediante marcadores AFLP Genetic diversity intra and inter-specific yam (Dioscorea spp.) from the colombian caribbean region by AFLP markers
title_full Diversidad genética intra e inter-específica de ñame (Dioscorea spp.) de la región Caribe de Colombia mediante marcadores AFLP Genetic diversity intra and inter-specific yam (Dioscorea spp.) from the colombian caribbean region by AFLP markers
title_fullStr Diversidad genética intra e inter-específica de ñame (Dioscorea spp.) de la región Caribe de Colombia mediante marcadores AFLP Genetic diversity intra and inter-specific yam (Dioscorea spp.) from the colombian caribbean region by AFLP markers
title_full_unstemmed Diversidad genética intra e inter-específica de ñame (Dioscorea spp.) de la región Caribe de Colombia mediante marcadores AFLP Genetic diversity intra and inter-specific yam (Dioscorea spp.) from the colombian caribbean region by AFLP markers
title_sort diversidad genética intra e inter-específica de ñame (dioscorea spp.) de la región caribe de colombia mediante marcadores aflp genetic diversity intra and inter-specific yam (dioscorea spp.) from the colombian caribbean region by aflp markers
publisher Universidad Nacional de Colombia
series Acta Agronómica
issn 0120-2812
publishDate 2011-12-01
description Conocer la variabilidad genética del ñame, Dioscorea spp., permite apoyar estrategias de mejoramiento y conservación de este recurso fitogenético. El objetivo de este estudio fue la caracterización molecular de 20 accesiones de Dioscorea spp. mediante la técnica molecular de AFLP para determinar cómo se distribuye la variabilidad genética de manera intra e inter-específica. Los datos fueron analizados mediante los métodos de agrupación de correspondencia múltiple y análisis de similaridad de Dice, estableciendo los niveles de confiabilidad de los grupos genéticos mediante remuestreos. En términos de diversidad interespecífica, los valores promedios de similitud variaron entre 41.81% entre D. alata L. y D. rotundata Poir., y 33.51% entre D. trifida L.f. y D. esculenta (Lour.) Burkill, lo que sugiere alta diversidad genética entre las accesiones estudiadas, que formaron cuatro grupos genéticos: D. alata, D. rotundata, D. esculenta y D. trifida, confirmando correspondencia entre la caracterización morfológica, clasificación botánica y la caracterización molecular. En términos de diversidad intraespecífica para la especie D. alata, el análisis también reveló una composición heterogénea en la región Caribe colombiana. Estos estudios ayudarán a definir una estrategia adecuada para fines de conservación y apoyar los esfuerzos futuros en los programas de mejoramiento genético.<br>Knowing the genetic variability of yams, Dioscorea spp., is a good tool to support development and conservation strategies of this plant as genetic resource. The aim of this study was to carried out the molecular characterization of 20 accessions of Dioscorea spp. using the AFLP molecular technique to determine how genetic variation is distributed intra-and inter-specifically. Using multiple correspondence analysis and level of reliability of the genetic groups by resampling, the results showed high genetic variability among the accessions studied giving as a result four genetic groups: D. alata L., D. rotundata Poir., D. esculenta (Lour.) Burkill and D. trifida L.f., which confirmed a correspondence between the morphological and molecular characterization. The average values of similarity ranged from 41.81% in D. alata and D. rotundata, and 33.51% in D. trifida and D. esculenta. These data are consistent with previous morphological characterizations and systematics of the species in relation to their botanical sections. The analysis also revealed the heterogeneous composition of D. alata in the colombian Caribbean region; these studies will help to define an appropriate strategy for conservation to support future efforts in breeding programs.
topic Características agronómicas
caracterización molecular
Dioscorea spp
marcadores genéticos
recursos fitogenéticos
región Caribe de Colombia
Agronomy characters
colombian Caribbean region
Dioscorea spp
genetic marker
molecular characterization
plant genetic resources
url http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0120-28122011000400005
work_keys_str_mv AT hernandojavierriverajimenez diversidadgeneticaintraeinterespecificadenamedioscoreasppdelaregioncaribedecolombiamediantemarcadoresaflpgeneticdiversityintraandinterspecificyamdioscoreasppfromthecolombiancaribbeanregionbyaflpmarkers
AT andresalvarezsoto diversidadgeneticaintraeinterespecificadenamedioscoreasppdelaregioncaribedecolombiamediantemarcadoresaflpgeneticdiversityintraandinterspecificyamdioscoreasppfromthecolombiancaribbeanregionbyaflpmarkers
AT juandiegopalaciomejia diversidadgeneticaintraeinterespecificadenamedioscoreasppdelaregioncaribedecolombiamediantemarcadoresaflpgeneticdiversityintraandinterspecificyamdioscoreasppfromthecolombiancaribbeanregionbyaflpmarkers
AT dorayovanabarriosleal diversidadgeneticaintraeinterespecificadenamedioscoreasppdelaregioncaribedecolombiamediantemarcadoresaflpgeneticdiversityintraandinterspecificyamdioscoreasppfromthecolombiancaribbeanregionbyaflpmarkers
AT dianalopezalvarez diversidadgeneticaintraeinterespecificadenamedioscoreasppdelaregioncaribedecolombiamediantemarcadoresaflpgeneticdiversityintraandinterspecificyamdioscoreasppfromthecolombiancaribbeanregionbyaflpmarkers
_version_ 1725710633395027968