ENKI-DB: sistema de información taxonómica y molecular de especies propias de la biodiversidad colombiana

• Main Authors: Emiliano Barreto, Andrés M. Pinzón, María Teresa Reguero
• Format: Article
• Language: Spanish
• Published: Universidad Nacional de Colombia 2006-01-01
• Series: Revista Colombiana de Biotecnología
• Subjects: ENKI; molecular; taxonomía; biodiversidad colombiana; bioinformática; molecular integration system
• Online Access: https://revistas.unal.edu.co/index.php/biotecnologia/article/view/506

ENKI-DB, es un sistema de información taxonómica y molecular de especies propias de la biodiversidad colombiana, accesible vía Internet. Mediante ENKI-DB se tiene acceso inmediato a toda la información taxonómica y molecular presente en las bases de datos SPICA®, SIB, EMBL y UNIPROT para especies propias de la biodiversidad colombiana exclusivamente. Hasta la fecha el sistema ha logrado enlazar 10 808 registros de especies propias de la biodiversidad colombiana (presentes en las bases de datos SIB y SPICA®), para las que han encontrado 1 976 751 registros molecula­res, 96 337 provenientes de las bases de datos de información proteica (UniprotKb, Uniref y Uniparc) y 1 880 414 de la base de datos EMBL de DNA. Aunque esta información se encuentra presente también, de manera independiente, en cada una de estas bases de datos, a través de ENKI- DB los datos son accesibles desde una sola interfase y de manera integrada y depurada. El sistema permite además realizar alineamientos locales utilizando la implementación del algoritmo BLAST del NCBI. ENKI- DB ha sido desarrollado en su totalidad en PHP y PERL, haciendo uso de las librerías Bio-PHP, Bio-PERL y utilizando la base de datos MySQL como repositorio central de información. ENKI-DB es accesible vía Internet, de manera completamente gratuita y pública en la siguiente dirección: http://bioinf.ibun.unal.edu.co/enkidb/ Contacto: [e-mail] Palabras clave: ENKI, molecular, taxonomía, biodiversidad colombiana, bioinformática.