طراحی نرمافزار پیشبینی ارزش ارثی حیوانات با استفاده از اطلاعات کمی و مولکولی
در تحقیق حاضر اقدام به تولید نرمافزار MAS شد. این نرمافزار برای پیشبینی ارزش ارثی از تلفیق اطلاعات کمی و مولکولی استفاده مینماید. بعضی از ژنهایی که یک صفت را کنترل میکنند، میتوانند نسبت به بقیه دارای اثرات بزرگی باشند. این قبیل ژنها، ژنهای با اثر بزرگ نامیده میشوند که در QTL هامکان<stro...
Main Authors: | , , , , |
---|---|
Format: | Article |
Language: | fas |
Published: |
University of Guilan
2012-05-01
|
Series: | تحقیقات تولیدات دامی |
Subjects: | |
Online Access: | https://ar.guilan.ac.ir/article_268_995dcf27c1a9b5a0ed653ed8fc03e9bf.pdf |
id |
doaj-a0aed111cc754ee28ac49c0d32178c32 |
---|---|
record_format |
Article |
spelling |
doaj-a0aed111cc754ee28ac49c0d32178c322020-11-25T01:57:46ZfasUniversity of Guilanتحقیقات تولیدات دامی2252-08722538-61072012-05-01112936268طراحی نرمافزار پیشبینی ارزش ارثی حیوانات با استفاده از اطلاعات کمی و مولکولیثریا رفیعی0مرادپاشا اسکندری نسب1داریوش سلیمی2طاهر هرکی نژاد3روناک خرمتایی4دانشآموخته کارشناسی ارشد دانشکده کشاورزی دانشگاه زنجاندانشیار دانشکده کشاورزی دانشگاه زنجانپژوهشکدة فیزیولوژی و بیوتکنولوژی دانشگاه زنجانپژوهشکدة فیزیولوژی و بیوتکنولوژی دانشگاه زنجانپژوهشکدة فیزیولوژی و بیوتکنولوژی دانشگاه زنجاندر تحقیق حاضر اقدام به تولید نرمافزار MAS شد. این نرمافزار برای پیشبینی ارزش ارثی از تلفیق اطلاعات کمی و مولکولی استفاده مینماید. بعضی از ژنهایی که یک صفت را کنترل میکنند، میتوانند نسبت به بقیه دارای اثرات بزرگی باشند. این قبیل ژنها، ژنهای با اثر بزرگ نامیده میشوند که در QTL هامکان<strong></strong>یابی میشوند. دنبال کردن الگوی توارث این قبیل QTLها میتواند برای کمک به انتخاب مورد استفاده قرار بگیرد. این موضوع مجالی برای افزایش برنامههای پیشرفت ژنتیکی حیوانات اهلی به وسیله انتخاب به کمک نشانگرها (MAS) را فراهم میسازد. کارایی انتخاب به کمک نشانگرها بر شاخصی متشکل از اطلاعات فنوتیپی و مولکولی پایه گذاری شده است. نرم افزار MAS براساس روشهای مدل مختلط (MMM) با زبان برنامهنویسی C<strong>#</strong> تهیه شد. در این نرم افزار از مدل دام برای پیشبینی ارزش ارثی به فرم ماتریسی استفاده شد. با تعیین پلیمورفیسم ناحیه پروموتور ژن DGAT1، پس از استخراج DNA از نمونههای خون، مراحل PCR روی نمونههای DNAانجام گرفت. فراوانیهای آللی و ژنوتیپی حیوانات مشخص شد. از نرم افزار MAS برای پیش بینی ارزش ارثی تعداد 80 رأس از برههای نر گله اصلاح نژادی طرح ملی اصلاح نژاد گوسفند افشاری مزرعه آموزشی دانشگاه زنجان استفاده شد. جهت مقایسه نتایج پیش بینی ارزش ارثی با روش مذکور، از نرم افزار SAS استفاده شد. مقایسه نتایج پیشبینی ارزش ارثی با نرمافزار MAS و SAS، نشاندهنده اثر ورود نشانگرهای مولکولی در انتخاب براساس تلفیق اطلاعات کمی و مولکولی است.https://ar.guilan.ac.ir/article_268_995dcf27c1a9b5a0ed653ed8fc03e9bf.pdfارزش ارثیجایگاه صفت کمیگوسفند افشارینشانگر مولکولی |
collection |
DOAJ |
language |
fas |
format |
Article |
sources |
DOAJ |
author |
ثریا رفیعی مرادپاشا اسکندری نسب داریوش سلیمی طاهر هرکی نژاد روناک خرمتایی |
spellingShingle |
ثریا رفیعی مرادپاشا اسکندری نسب داریوش سلیمی طاهر هرکی نژاد روناک خرمتایی طراحی نرمافزار پیشبینی ارزش ارثی حیوانات با استفاده از اطلاعات کمی و مولکولی تحقیقات تولیدات دامی ارزش ارثی جایگاه صفت کمی گوسفند افشاری نشانگر مولکولی |
author_facet |
ثریا رفیعی مرادپاشا اسکندری نسب داریوش سلیمی طاهر هرکی نژاد روناک خرمتایی |
author_sort |
ثریا رفیعی |
title |
طراحی نرمافزار پیشبینی ارزش ارثی حیوانات با استفاده از اطلاعات کمی و مولکولی |
title_short |
طراحی نرمافزار پیشبینی ارزش ارثی حیوانات با استفاده از اطلاعات کمی و مولکولی |
title_full |
طراحی نرمافزار پیشبینی ارزش ارثی حیوانات با استفاده از اطلاعات کمی و مولکولی |
title_fullStr |
طراحی نرمافزار پیشبینی ارزش ارثی حیوانات با استفاده از اطلاعات کمی و مولکولی |
title_full_unstemmed |
طراحی نرمافزار پیشبینی ارزش ارثی حیوانات با استفاده از اطلاعات کمی و مولکولی |
title_sort |
طراحی نرمافزار پیشبینی ارزش ارثی حیوانات با استفاده از اطلاعات کمی و مولکولی |
publisher |
University of Guilan |
series |
تحقیقات تولیدات دامی |
issn |
2252-0872 2538-6107 |
publishDate |
2012-05-01 |
description |
در تحقیق حاضر اقدام به تولید نرمافزار MAS شد. این نرمافزار برای پیشبینی ارزش ارثی از تلفیق اطلاعات کمی و مولکولی استفاده مینماید. بعضی از ژنهایی که یک صفت را کنترل میکنند، میتوانند نسبت به بقیه دارای اثرات بزرگی باشند. این قبیل ژنها، ژنهای با اثر بزرگ نامیده میشوند که در QTL هامکان<strong></strong>یابی میشوند. دنبال کردن الگوی توارث این قبیل QTLها میتواند برای کمک به انتخاب مورد استفاده قرار بگیرد. این موضوع مجالی برای افزایش برنامههای پیشرفت ژنتیکی حیوانات اهلی به وسیله انتخاب به کمک نشانگرها (MAS) را فراهم میسازد. کارایی انتخاب به کمک نشانگرها بر شاخصی متشکل از اطلاعات فنوتیپی و مولکولی پایه گذاری شده است. نرم افزار MAS براساس روشهای مدل مختلط (MMM) با زبان برنامهنویسی C<strong>#</strong> تهیه شد. در این نرم افزار از مدل دام برای پیشبینی ارزش ارثی به فرم ماتریسی استفاده شد. با تعیین پلیمورفیسم ناحیه پروموتور ژن DGAT1، پس از استخراج DNA از نمونههای خون، مراحل PCR روی نمونههای DNAانجام گرفت. فراوانیهای آللی و ژنوتیپی حیوانات مشخص شد. از نرم افزار MAS برای پیش بینی ارزش ارثی تعداد 80 رأس از برههای نر گله اصلاح نژادی طرح ملی اصلاح نژاد گوسفند افشاری مزرعه آموزشی دانشگاه زنجان استفاده شد. جهت مقایسه نتایج پیش بینی ارزش ارثی با روش مذکور، از نرم افزار SAS استفاده شد. مقایسه نتایج پیشبینی ارزش ارثی با نرمافزار MAS و SAS، نشاندهنده اثر ورود نشانگرهای مولکولی در انتخاب براساس تلفیق اطلاعات کمی و مولکولی است. |
topic |
ارزش ارثی جایگاه صفت کمی گوسفند افشاری نشانگر مولکولی |
url |
https://ar.guilan.ac.ir/article_268_995dcf27c1a9b5a0ed653ed8fc03e9bf.pdf |
work_keys_str_mv |
AT tẖryạrfyʿy ṭrạḥynrmạfzạrpysẖbynyạrzsẖạrtẖyḥywạnạtbạạstfạdhạzạṭlạʿạtḵmywmwlḵwly AT mrạdpạsẖạạsḵndrynsb ṭrạḥynrmạfzạrpysẖbynyạrzsẖạrtẖyḥywạnạtbạạstfạdhạzạṭlạʿạtḵmywmwlḵwly AT dạrywsẖslymy ṭrạḥynrmạfzạrpysẖbynyạrzsẖạrtẖyḥywạnạtbạạstfạdhạzạṭlạʿạtḵmywmwlḵwly AT ṭạhrhrḵynzẖạd ṭrạḥynrmạfzạrpysẖbynyạrzsẖạrtẖyḥywạnạtbạạstfạdhạzạṭlạʿạtḵmywmwlḵwly AT rwnạḵkẖrmtạyy ṭrạḥynrmạfzạrpysẖbynyạrzsẖạrtẖyḥywạnạtbạạstfạdhạzạṭlạʿạtḵmywmwlḵwly |
_version_ |
1724972670512005120 |