| Summary: | Bu çalışmada,
kışlık buğdaylarda kök ve kökboğazı çürüklüğüne sebep olan farklı Fusarium türlerine ait izolatlar arasındaki genetik çeşitlik,
retrotranspozon temelli olan primerler arası bağlanma bölgesi (iPBS) markörleri
kullanılarak incelenmiştir. Bu amaçla, 2017 ve 2018 yıllarında Türkiye ve
Azerbaycan buğday yetiştirme alanlarından 32 Fusarium türü izolat elde
edilmiştir. İzolatlar arasında en yaygın
bulunan tür 23 izolat ile F. culmorum
olarak belirlenmiş, bunu beş izolat ile F.
pseudograminearum ve dört izolat ile F.
graminearum takip etmiştir. Yedi iPBS retrotranspozon markörü izolatlar için
99 adeti polimorfik (%86.8) olmak üzere 114 bant üretmiş, primer başına
ortalama 14.14 polimorfik bant elde edilmiştir. Markörlerin polimorfik bilgi
içeriği (PIC) ortalama 0.17 olup, bu değer 0.10 ile 0.29 arasında değişmiştir. iPBS
markörleri ile elde edilen verilere dayalı ağırlıklı olmayan aritmetik ortalama
eş grup metodu (UPGMA) küme analizlerinin sonrasında elde edilen dendrogramda,
izolatlar tür seviyesinde ile üç gruba ayrılmıştır. Ayrıca grup içerisinde yer
alan izolatlar ise orijini olan ülkeye göre dağılım sergilemiştir. Popülasyon
yapısı, Bayesian modellemesine dayanılarak hesaplanmış ve sonuçlar
dendrogramdaki izolatların kümelenmesini destekleyecek şekilde üç popülasyona
ayrılmış (K = 3) ve Ln olasılığının
en yüksek ortalama değeri (-476.0) eşlik etmiştir. iPBS markörlerinin
kullanılması, türler arası seviyede oldukça yüksek düzeyde polimorfizm üretmiş
olup türlerin birbirinden ayrılmasını sağlamıştır. Çalışma, buğdaydan elde
edilmiş Fusarium spp. izolatlarının
genetik çeşitliliğini ve popülasyon yapısını iPBS markörleri analizi ile ortaya
koyan ilk çalışma olma özelliği taşımaktadır.
|
|---|
