Molecular cloning of chitinase 33 (chit33) gene from Trichoderma atroviride Clonagem molecular do gene quitinase 33 (chit33) em Trichoderma atroviride
In this study Trichoderma atroviride was selected as over producer of chitinase enzyme among 30 different isolates of Trichoderma sp. on the basis of chitinase specific activity. From this isolate the genomic and cDNA clones encoding chit33 have been isolated and sequenced. Comparison of genomic and...
Main Authors: | , , |
---|---|
Format: | Article |
Language: | English |
Published: |
Sociedade Brasileira de Microbiologia
2008-09-01
|
Series: | Brazilian Journal of Microbiology |
Subjects: | |
Online Access: | http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1517-83822008000300005 |
id |
doaj-a7ad3a84aef3498691544ad5f65e17fb |
---|---|
record_format |
Article |
spelling |
doaj-a7ad3a84aef3498691544ad5f65e17fb2020-11-24T23:25:26ZengSociedade Brasileira de MicrobiologiaBrazilian Journal of Microbiology1517-83821678-44052008-09-0139343343710.1590/S1517-83822008000300005Molecular cloning of chitinase 33 (chit33) gene from Trichoderma atroviride Clonagem molecular do gene quitinase 33 (chit33) em Trichoderma atrovirideS. MatroudiM.R. ZamaniM. MotallebiIn this study Trichoderma atroviride was selected as over producer of chitinase enzyme among 30 different isolates of Trichoderma sp. on the basis of chitinase specific activity. From this isolate the genomic and cDNA clones encoding chit33 have been isolated and sequenced. Comparison of genomic and cDNA sequences for defining gene structure indicates that this gene contains three short introns and also an open reading frame coding for a protein of 321 amino acids. The deduced amino acid sequence includes a 19 aa putative signal peptide. Homology between this sequence and other reported Trichoderma Chit33 proteins are discussed. The coding sequence of chit33 gene was cloned in pEt26b(+) expression vector and expressed in E. coli.<br>Neste estudo Trichoderma atroviride foi escolhido como superprodutor da enzima quitinase dentre 30 isolados de Trichoderma sp. com base na atividade específica de quitinase. Clones de cDNA e genômico codificando chit33 foram obtidos deste isolado e seqüenciados. A comparação das seqüências genômica e de cDNA para definir a estrutura do gene indicou que este contém três pequenos introns e uma fase aberta de leitura codificando uma proteína de 321 aminoácidos. A seqüência de aminoácidos deduzida inclui um possível peptídio sinal de 19 aminoácidos. Homologia entre esta seqüência e outras proteínas Chit33 descritas de Trichoderma é discutida. A seqüência codificadora do gene chit33 foi clonada no vetor de expressão pET26b(+) e expressa em E. coli.http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1517-83822008000300005Trichoderma atroviridechit33atividade de quitinaseestrutura gênicaTrichoderma atroviridechit33chitinase activitygene structure |
collection |
DOAJ |
language |
English |
format |
Article |
sources |
DOAJ |
author |
S. Matroudi M.R. Zamani M. Motallebi |
spellingShingle |
S. Matroudi M.R. Zamani M. Motallebi Molecular cloning of chitinase 33 (chit33) gene from Trichoderma atroviride Clonagem molecular do gene quitinase 33 (chit33) em Trichoderma atroviride Brazilian Journal of Microbiology Trichoderma atroviride chit33 atividade de quitinase estrutura gênica Trichoderma atroviride chit33 chitinase activity gene structure |
author_facet |
S. Matroudi M.R. Zamani M. Motallebi |
author_sort |
S. Matroudi |
title |
Molecular cloning of chitinase 33 (chit33) gene from Trichoderma atroviride Clonagem molecular do gene quitinase 33 (chit33) em Trichoderma atroviride |
title_short |
Molecular cloning of chitinase 33 (chit33) gene from Trichoderma atroviride Clonagem molecular do gene quitinase 33 (chit33) em Trichoderma atroviride |
title_full |
Molecular cloning of chitinase 33 (chit33) gene from Trichoderma atroviride Clonagem molecular do gene quitinase 33 (chit33) em Trichoderma atroviride |
title_fullStr |
Molecular cloning of chitinase 33 (chit33) gene from Trichoderma atroviride Clonagem molecular do gene quitinase 33 (chit33) em Trichoderma atroviride |
title_full_unstemmed |
Molecular cloning of chitinase 33 (chit33) gene from Trichoderma atroviride Clonagem molecular do gene quitinase 33 (chit33) em Trichoderma atroviride |
title_sort |
molecular cloning of chitinase 33 (chit33) gene from trichoderma atroviride clonagem molecular do gene quitinase 33 (chit33) em trichoderma atroviride |
publisher |
Sociedade Brasileira de Microbiologia |
series |
Brazilian Journal of Microbiology |
issn |
1517-8382 1678-4405 |
publishDate |
2008-09-01 |
description |
In this study Trichoderma atroviride was selected as over producer of chitinase enzyme among 30 different isolates of Trichoderma sp. on the basis of chitinase specific activity. From this isolate the genomic and cDNA clones encoding chit33 have been isolated and sequenced. Comparison of genomic and cDNA sequences for defining gene structure indicates that this gene contains three short introns and also an open reading frame coding for a protein of 321 amino acids. The deduced amino acid sequence includes a 19 aa putative signal peptide. Homology between this sequence and other reported Trichoderma Chit33 proteins are discussed. The coding sequence of chit33 gene was cloned in pEt26b(+) expression vector and expressed in E. coli.<br>Neste estudo Trichoderma atroviride foi escolhido como superprodutor da enzima quitinase dentre 30 isolados de Trichoderma sp. com base na atividade específica de quitinase. Clones de cDNA e genômico codificando chit33 foram obtidos deste isolado e seqüenciados. A comparação das seqüências genômica e de cDNA para definir a estrutura do gene indicou que este contém três pequenos introns e uma fase aberta de leitura codificando uma proteína de 321 aminoácidos. A seqüência de aminoácidos deduzida inclui um possível peptídio sinal de 19 aminoácidos. Homologia entre esta seqüência e outras proteínas Chit33 descritas de Trichoderma é discutida. A seqüência codificadora do gene chit33 foi clonada no vetor de expressão pET26b(+) e expressa em E. coli. |
topic |
Trichoderma atroviride chit33 atividade de quitinase estrutura gênica Trichoderma atroviride chit33 chitinase activity gene structure |
url |
http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1517-83822008000300005 |
work_keys_str_mv |
AT smatroudi molecularcloningofchitinase33chit33genefromtrichodermaatrovirideclonagemmoleculardogenequitinase33chit33emtrichodermaatroviride AT mrzamani molecularcloningofchitinase33chit33genefromtrichodermaatrovirideclonagemmoleculardogenequitinase33chit33emtrichodermaatroviride AT mmotallebi molecularcloningofchitinase33chit33genefromtrichodermaatrovirideclonagemmoleculardogenequitinase33chit33emtrichodermaatroviride |
_version_ |
1725557550457290752 |