Uso de modelos lineares mistos na avaliação genética de escores visuais: estudo de simulação
Objetivou-se avaliar a aplicação da metodologia de modelos lineares mistos em características de escores visuais por meio de simulação, considerando-se duas estruturas populacionais (com e sem seleção), dois níveis de herdabilidade (0,1 e 0,4) e quatro níveis de conectabilidade (8, 20, 38 e 60%). As...
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Universidade Federal de Minas Gerais
2014-08-01
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Series: | Arquivo Brasileiro de Medicina Veterinária e Zootecnia |
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doaj-c11bc129c5104bb3bd990476715713792020-11-24T22:27:10ZengUniversidade Federal de Minas GeraisArquivo Brasileiro de Medicina Veterinária e Zootecnia1678-41622014-08-016641139114610.1590/1678-6351S0102-09352014000401139Uso de modelos lineares mistos na avaliação genética de escores visuais: estudo de simulaçãoL.O. DuitamaM.M. FarahA.T.H. UtsunomiyaR.K. OnoM.P. PiresR. FonsecaObjetivou-se avaliar a aplicação da metodologia de modelos lineares mistos em características de escores visuais por meio de simulação, considerando-se duas estruturas populacionais (com e sem seleção), dois níveis de herdabilidade (0,1 e 0,4) e quatro níveis de conectabilidade (8, 20, 38 e 60%). As populações com e sem seleção estavam constituídas por 6660 e 3360 animais, respectivamente, dos quais os últimos 2460 animais tinham fenótipo para o escore visual. Assumiu-se uma variável contínua adjacente ao escore visual, a partir da qual foram definidos os intervalos correspondentes a cada categoria de escore visual. O processo de simulação foi feito por meio do software R, e a estimação de parâmetros e predição de valores genéticos pelo software Wombat, sob modelo animal, considerando-se modelos com e sem efeitos fixos. Os critérios de avaliação foram: o erro quadrático médio (EQM) para a herdabilidade e as correlações de Spearman entre os valores genéticos verdadeiros e preditos. As estimativas da herdabilidade apresentaram-se próximas do valor verdadeiro nos cenários sem seleção (0,084-0,101 e 0,367-0,389), no entanto este resultado não ocorreu quando houve seleção, pois a herdabilidade apresentou-se subestimada (0,032 e 0,278). As correlações apresentaram-se maiores nos cenários sem seleção e com herdabilidade de 0,4 (0,86-0,89). Em todos os cenários simulados, a inclusão do efeito fixo no modelo melhorou as estimativas de herdabilidade e as correlações entre os valores genéticos verdadeiros e preditos. O nível de conectabilidade afetou a correção dos efeitos fixos feita pela atribuição dos escores. Em conclusão, a metodologia dos modelos lineares mistos pode ser utilizada na estimação de parâmetros e predição de valores genéticos de escores visuais em populações sem seleção, entretanto não se apresenta adequada em populações sob seleção.http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-09352014000401139&lng=en&tlng=engado de corteparâmetros genéticossoftware R |
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L.O. Duitama M.M. Farah A.T.H. Utsunomiya R.K. Ono M.P. Pires R. Fonseca Uso de modelos lineares mistos na avaliação genética de escores visuais: estudo de simulação Arquivo Brasileiro de Medicina Veterinária e Zootecnia gado de corte parâmetros genéticos software R |
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Objetivou-se avaliar a aplicação da metodologia de modelos lineares mistos em características de escores visuais por meio de simulação, considerando-se duas estruturas populacionais (com e sem seleção), dois níveis de herdabilidade (0,1 e 0,4) e quatro níveis de conectabilidade (8, 20, 38 e 60%). As populações com e sem seleção estavam constituídas por 6660 e 3360 animais, respectivamente, dos quais os últimos 2460 animais tinham fenótipo para o escore visual. Assumiu-se uma variável contínua adjacente ao escore visual, a partir da qual foram definidos os intervalos correspondentes a cada categoria de escore visual. O processo de simulação foi feito por meio do software R, e a estimação de parâmetros e predição de valores genéticos pelo software Wombat, sob modelo animal, considerando-se modelos com e sem efeitos fixos. Os critérios de avaliação foram: o erro quadrático médio (EQM) para a herdabilidade e as correlações de Spearman entre os valores genéticos verdadeiros e preditos. As estimativas da herdabilidade apresentaram-se próximas do valor verdadeiro nos cenários sem seleção (0,084-0,101 e 0,367-0,389), no entanto este resultado não ocorreu quando houve seleção, pois a herdabilidade apresentou-se subestimada (0,032 e 0,278). As correlações apresentaram-se maiores nos cenários sem seleção e com herdabilidade de 0,4 (0,86-0,89). Em todos os cenários simulados, a inclusão do efeito fixo no modelo melhorou as estimativas de herdabilidade e as correlações entre os valores genéticos verdadeiros e preditos. O nível de conectabilidade afetou a correção dos efeitos fixos feita pela atribuição dos escores. Em conclusão, a metodologia dos modelos lineares mistos pode ser utilizada na estimação de parâmetros e predição de valores genéticos de escores visuais em populações sem seleção, entretanto não se apresenta adequada em populações sob seleção. |
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