Caracterização genética de espécies de Croton (Euphorbiaceae) ocorrentes no Nordeste brasileiro
Made available in DSpace on 2014-06-12T15:55:22Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo6476_1.pdf: 1582610 bytes, checksum: aa00383840fb284a301d9fddf9b8ce27 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2011 === Faculdade de Amparo à Ciência e Te...
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Euphorbiacea Croton Chamaesyce Citogenética CMA DAPI FISH DAF ISSR Inferência Bayesiana de Castro Lira Neto, Amaro Caracterização genética de espécies de Croton (Euphorbiaceae) ocorrentes no Nordeste brasileiro |
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Previous issue date: 2011 === Faculdade de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco === Croton L. é considerado um dos maiores e mais diversificados gêneros dentre as
angiospermas com cerca de 1300 espécies. Apesar de sua representação na composição da flora
nordestina, não há nenhum estudo que vise investigar a diversidade genética no grupo. O presente
estudo objetivou analisar características genéticas distintivas entre espécies do gênero com ênfase
naquelas do nordeste brasileiro, incluindo marcadores moleculares e citogenéticos. As informações
citogenéticas geradas sobre dez populações de seis espécies de Croton são inéditas. Estas pertencem
a cinco seções (Argyroglossum, Astraea, Barhamia, Podostachys e Velamea. Todas as espécies
apresentaram 2n=20, com exceção de C. lobatus com 2n=18, C. adenocalyx, com 2n=40. Foram
observados cariótipos simétricos com cromossomos meta-submetacêntricos de tamanho similar.
Constrições secundárias estão presentes em todas as espécies, com exceção de C. lundianus. A
coloração com nitrato de prata em C. adenocalyx, C. heliotropiifolius e C. blanchetianus apresentou
células com número máximo de quatro nucléolos ativos para a primeira espécie, enquanto nas
demais o maior número chegou a dois. O bandeamento com DAPI/CMA3 revelou baixo conteúdo
de heterocromatina na maioria das espécies estudadas, com apenas um par CMA3
+/DAPI-. Exceções
foram Croton adenocalyx (dois pares CMA3
+/DAPI-) e C. lobatus, com marcações CMA3
+/DAPI0
nas regiões pericentroméricas de todos os cromossomos do complemento. A hibridização in situ
fluorescente evidenciou quatro sítios de 45S em C. adenocalyx e dois em C. lundianus. Apesar de
pertencerem a seções distintas, cinco das seis espécies aqui estudadas mostraram relativa
conservação cariomorfológica, com exceção de C. lobatus. No presente trabalho também foi
averiguado a eficiência dos marcadores DAF (DNA Amplification Fingerprinting) e ISSR (Inter
Simple Sequence Repeat) no acesso à variabilidade genética dos gêneros Croton e Chamaesyce,
efetuando-se uma seleção de primers para aplicação em estudos filogenéticos e populacionais. Para
tal, foram utilizados quatro indivíduos de três espécies de Croton L. (C. heliotropiifolius, C.
blanchetianus e C. pedicellatus) e quatro de duas espécies de Chamaesyce (C. hirta e C.
thymifolia). Considerando os 29 primers DAF aplicados para Croton, foram gerados 374 loci, onde
359 foram polimórficos. Já para Chamaesyce, dos 42 primers testados, 581 loci foram amplificados,
sendo 494 polimórficos. A partir dos 17 primers ISSR testados para Croton, foram originados 327
loci, onde 317 apresentaram-se polimórficos. No que diz respeito ao gênero Chamaesyce, dos 15
oligonucleotídeos, 193 loci foram gerados, com 140 polimórficos. O elevado número de
polimorfismos acessados evidenciou a eficiência das metodologias em inferir índices de
variabilidade genética. Em todos os fenogramas gerados, os valores de bootstrap foram consistentes
(acima de 80). Dados preliminares da aplicação de cinco primers de DAF e seis de ISSR em 40
acessos de 27 espécies de Croton, comparadas a representantes de Jatropha (3 spp.), usados como
grupo-irmão, também são aqui disponibilizados. Foram gerados ao todo 394 marcadores
polimórficos (208 para DAF e 186 para ISSR) usados para gerar uma árvore filogenética baseada
em inferência Bayesiana onde muitas entidades taxonômicas apresentaram-se em posições
politômicas, indicando a necessidade de agregação de dados adicionais para melhor embasamento
da análise |
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Maria Benko Iseppon, Ana |
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Maria Benko Iseppon, Ana de Castro Lira Neto, Amaro |
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ndltd-IBICT-oai-repositorio.ufpe.br-123456789-21982019-01-21T19:03:31Z Caracterização genética de espécies de Croton (Euphorbiaceae) ocorrentes no Nordeste brasileiro de Castro Lira Neto, Amaro Maria Benko Iseppon, Ana Euphorbiacea Croton Chamaesyce Citogenética CMA DAPI FISH DAF ISSR Inferência Bayesiana Made available in DSpace on 2014-06-12T15:55:22Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo6476_1.pdf: 1582610 bytes, checksum: aa00383840fb284a301d9fddf9b8ce27 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2011 Faculdade de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco Croton L. é considerado um dos maiores e mais diversificados gêneros dentre as angiospermas com cerca de 1300 espécies. Apesar de sua representação na composição da flora nordestina, não há nenhum estudo que vise investigar a diversidade genética no grupo. O presente estudo objetivou analisar características genéticas distintivas entre espécies do gênero com ênfase naquelas do nordeste brasileiro, incluindo marcadores moleculares e citogenéticos. As informações citogenéticas geradas sobre dez populações de seis espécies de Croton são inéditas. Estas pertencem a cinco seções (Argyroglossum, Astraea, Barhamia, Podostachys e Velamea. Todas as espécies apresentaram 2n=20, com exceção de C. lobatus com 2n=18, C. adenocalyx, com 2n=40. Foram observados cariótipos simétricos com cromossomos meta-submetacêntricos de tamanho similar. Constrições secundárias estão presentes em todas as espécies, com exceção de C. lundianus. A coloração com nitrato de prata em C. adenocalyx, C. heliotropiifolius e C. blanchetianus apresentou células com número máximo de quatro nucléolos ativos para a primeira espécie, enquanto nas demais o maior número chegou a dois. O bandeamento com DAPI/CMA3 revelou baixo conteúdo de heterocromatina na maioria das espécies estudadas, com apenas um par CMA3 +/DAPI-. Exceções foram Croton adenocalyx (dois pares CMA3 +/DAPI-) e C. lobatus, com marcações CMA3 +/DAPI0 nas regiões pericentroméricas de todos os cromossomos do complemento. A hibridização in situ fluorescente evidenciou quatro sítios de 45S em C. adenocalyx e dois em C. lundianus. Apesar de pertencerem a seções distintas, cinco das seis espécies aqui estudadas mostraram relativa conservação cariomorfológica, com exceção de C. lobatus. No presente trabalho também foi averiguado a eficiência dos marcadores DAF (DNA Amplification Fingerprinting) e ISSR (Inter Simple Sequence Repeat) no acesso à variabilidade genética dos gêneros Croton e Chamaesyce, efetuando-se uma seleção de primers para aplicação em estudos filogenéticos e populacionais. Para tal, foram utilizados quatro indivíduos de três espécies de Croton L. (C. heliotropiifolius, C. blanchetianus e C. pedicellatus) e quatro de duas espécies de Chamaesyce (C. hirta e C. thymifolia). Considerando os 29 primers DAF aplicados para Croton, foram gerados 374 loci, onde 359 foram polimórficos. Já para Chamaesyce, dos 42 primers testados, 581 loci foram amplificados, sendo 494 polimórficos. A partir dos 17 primers ISSR testados para Croton, foram originados 327 loci, onde 317 apresentaram-se polimórficos. No que diz respeito ao gênero Chamaesyce, dos 15 oligonucleotídeos, 193 loci foram gerados, com 140 polimórficos. O elevado número de polimorfismos acessados evidenciou a eficiência das metodologias em inferir índices de variabilidade genética. Em todos os fenogramas gerados, os valores de bootstrap foram consistentes (acima de 80). Dados preliminares da aplicação de cinco primers de DAF e seis de ISSR em 40 acessos de 27 espécies de Croton, comparadas a representantes de Jatropha (3 spp.), usados como grupo-irmão, também são aqui disponibilizados. Foram gerados ao todo 394 marcadores polimórficos (208 para DAF e 186 para ISSR) usados para gerar uma árvore filogenética baseada em inferência Bayesiana onde muitas entidades taxonômicas apresentaram-se em posições politômicas, indicando a necessidade de agregação de dados adicionais para melhor embasamento da análise 2014-06-12T15:55:22Z 2014-06-12T15:55:22Z 2011-01-31 info:eu-repo/semantics/publishedVersion info:eu-repo/semantics/doctoralThesis de Castro Lira Neto, Amaro; Maria Benko Iseppon, Ana. Caracterização genética de espécies de Croton (Euphorbiaceae) ocorrentes no Nordeste brasileiro. 2011. Tese (Doutorado). Programa de Pós-Graduação em Ciências Biológicas, Universidade Federal de Pernambuco, Recife, 2011. https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/2198 por info:eu-repo/semantics/openAccess Universidade Federal de Pernambuco reponame:Repositório Institucional da UFPE instname:Universidade Federal de Pernambuco instacron:UFPE |