Hapl?tipos de diferentes SNPs no interior do gene EWS em indiv?duos afetados e n?o-afetados pelo sarcoma de Ewing

• Main Author: Silva, D?borah Soares Bispo Santos
• Other Authors: Alho, Clarice Sampaio
• Format: Others
• Language: Portuguese
• Published: Pontif?cia Universidade Cat?lica do Rio Grande do Sul 2015
• Subjects: BIOLOGIA CELULAR; BIOLOGIA MOLECULAR; GEN?TICA; SARCOMA DE EWING; NEOPLASIAS ?SSEAS; GENES; POLIMORFISMO GEN?TICO HUMANO; CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::BIOLOGIA GERAL
• Online Access: http://tede2.pucrs.br/tede2/handle/tede/5433

Made available in DSpace on 2015-04-14T14:51:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 438120.pdf: 2337312 bytes, checksum: 3bcbd6b2d333489c6e0cefb866d0b73c (MD5) Previous issue date: 2012-03-30 === Ewing s sarcoma was first described by James Ewing in 1921 and it is the second most common bone tumor in children and young adults. Both chromosomal breakage and translocation occur in this sarcoma. The EWS gene is localized in chromosome 22 and is involved in this translocation. However, little is known about this gene breaking region and what sequences could be involved in higher chromosomal break susceptibility. In this study we aimed to investigate three SNPs in the EWS gene breaking region in a healthy subjects population and in Ewing s sarcoma patients. Genotyping was performed by TaqMan? assay for allelic discrimination using Real-Time PCR System. We conducted analysis of allelic and genotypic frequencies, as well as association and transmission disequilibrium tests. According to our results, the control group showed similar and different genotypes distribution of all SNPs when compared to other populations studied by different projects, which shows how important it is to know the frequencies of our population. To test the hypothesis that some SNP, SNParrangement or haplotype could influence in the susceptibility to develop Ewing s sarcoma, we compared affected with non-affected individuals using association studies. The results showed one significant difference: a higher presence of homozygote T-rs4820804 in Ewing s Sarcoma patients. Transmission Disequilibrium Test (TDT) was performed to compare data from Ewing s Sarcoma patients and from their families but no statistically significant result was found. In conclusion, we find that the TT-rs4820804 EWS genotype can be associate with Ewing s sarcoma and that the rs4820804 SNP can be a candidate to understand the EWS breakage susceptibility. === O sarcoma de Ewing foi primeiramente descrito por James Ewing em 1921 e ? o segundo tumor ?sseo mais frequente em crian?as, adolescente e adultos jovens. Neste sarcoma, ? comum ocorrer a quebra e a transloca??o cromoss?mica. Dentre os genes envolvidos nesta transloca??o est? o gene EWS, localizado no cromossomo 22. Entretanto, pouco se sabe a respeito da regi?o de quebra deste gene e quais sequ?ncias poderiam levar a uma maior susceptibilidade a quebra cromoss?mica. Sendo assim, o objetivo deste trabalho foi investigar tr?s polimorfismos de base ?nica (SNPs) presentes na regi?o de quebra do gene EWS, em uma popula??o de indiv?duos saud?veis e em pacientes afetados pelo Sarcoma de Ewing. A genotipagem para os SNPs selecionados foi realizada usando TaqMan SNP Genotyping Assay pelo sistema de PCR em tempo real. N?s realizamos an?lises de frequ?ncias al?licas e genot?picas, assim como um estudo de associa??o e de desequil?brio de transmiss?o. A compara??o das frequ?ncias al?licas e genot?picas entre as popula??es deste estudo e entre popula??es de projetos j? publicados mostrou particularidades entre as popula??es, revelando a import?ncia de se conhecer tais frequ?ncias na popula??o de estudo. Para testar a hip?tese de que algum SNP, hapl?tipo ou combina??o espec?fica de SNPs poderia influenciar na susceptibilidade ao Sarcoma de Ewing, comparamos afetados com n?o-afetados realizando estudos de associa??o cujos resultados mostraram uma ?nica diferen?a significativa: a maior incid?ncia no gen?tipo TT-rs4820804 entre os afetados pelo Sarcoma de Ewing. O Teste de Desequil?brio de Transmiss?o (TDT) comparou os dados dos pacientes afetados e os dados de seus familiares, mas nenhum resultado significativo foi encontrado. Em conclus?o, o gen?tipo TT-rs4820804 pode estar associado ao Sarcoma de Ewing e o SNP rs4820804 pode ser candidato para aux?lio do entendimento da susceptibilidade de quebra do gene EWS.