Polimorfismos do gene TP53 no linfoma de Hodgkin

• Main Author: Daniel de AraÃjo Viana
• Other Authors: Francisco DÃrio Rocha Filho
• Format: Others
• Language: Portuguese
• Published: Universidade Federal do Cearà 2007
• Subjects: Linfoma de Hodgkin; TP53; Polimorfismos; Hodgkin Lymphoma; Polymorphisms; HEMATOLOGIA
• Online Access: http://www.teses.ufc.br/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=3202

FundaÃÃo Cearense de Apoio ao Desenvolvimento Cientifico e TecnolÃgico === FundaÃÃo de Amparo à Pesquisa do Estado do Cearà === O Linfoma de Hodgkin à uma hemopatia linfÃide pode ocorrer em qualquer faixa etÃria; no entanto, à mais comum na idade adulta jovem, dos 15 aos 40 anos. O TP53 à um gene de 20kb de comprimento que possui 11 Ãxons situado no cromossomo 17 e codifica a proteÃna p53, uma proteÃna cuja principal funÃÃo està relacionada à preservaÃÃo da integridade do cÃdigo genÃtico, e, durante o ciclo celular faz verificaÃÃo quanto à eventual ocorrÃncia de uma mutaÃÃo na seqÃÃncia do cÃdigo genÃtico. Na presenÃa dessas mutaÃÃes, impede que esta cÃlula entre em processo de mitose e complete a divisÃo celular. A maioria dos cÃnceres apresenta mutaÃÃes pontuais na seqÃÃncia do TP53. A anÃlise dos padrÃes dessas mutaÃÃes à de grande valia uma vez que o conhecimento dessas mutaÃÃes leva a um melhor entendimento das funÃÃes dos vÃrios domÃnios da proteÃna p53 e seu envolvimento com o mecanismo de supressÃo tumoral, alÃm de permitir que essas mutaÃÃes sejam utilizadas como biomarcadores para desvendar a oncogÃnese humana. Na literatura vigente, poucos trabalhos abordam a identificaÃÃo dessas mutaÃÃes em relaÃÃo ao linfoma de Hodgkin â forma clÃssica. Dessa forma, este trabalho se propÃe a investigar quantitativa e qualitativamente os padrÃes de polimorfismos existentes nesta forma do linfoma de Hodgkin. A primeira etapa do nosso experimento constou da seleÃÃo de 42 casos de linfonodos diagnosticados como linfoma de Hodgkin entre os anos de 2000 e 2006, arquivados em blocos de parafina. Os casos foram selecionados de pacientes com diagnÃstico de linfoma de Hodgkin, sem predileÃÃo por idade, sexo ou raÃa. Em seguida, o DNA foi extraÃdo das amostras selecionadas para reaÃÃo de PCR, realizada para isolar e amplificar, o fragmento de 137pb correspondente ao Ãxon 8 do gene TP53, atravÃs de primers exclusivos desenhados para o experimento: PFw8 e PRv8. ApÃs a reaÃÃo, os produtos de PCR foram purificados para reaÃÃo de SeqÃenciamento de DNA, utilizando o seqÃenciador automÃtico de DNA da marca ABI Prism 3100 de 16 capilares (Applied Biosystems). A Ãltima etapa aconteceu em laboratÃrio de bioinformÃtica â dry lab, onde as seqÃÃncias de DNA obtidas foram analisadas qualitativa- e quantitativamente. Os processos de extraÃÃo do DNA genÃmico, amplificaÃÃo do Ãxon 8, purificaÃÃo do produto de PCR foram realizadas com sucesso em todas as amostras obtidas de material parafinizado. No seqÃenciamento do DNA parafinizado foi possÃvel determinar, com seguranÃa e confiabilidades previstas em parÃmetros convencionais, a seqÃÃncia de pelo menos 32 amostras; contudo, nÃo se obteve distinÃÃo suficiente dos picos de eletroferogramas para a determinaÃÃo de eventuais polimorfismos na regiÃo analisada. NÃo foi possÃvel portanto, verificar com margem de seguranÃa razoÃvel, a presenÃa ou ausÃncia de SNPs nas amostras seqÃenciadas. Houve, contudo, uma qualificaÃÃo e competÃncia laboratorial instalada localmente (em Fortaleza), a partir da experiÃncia desenvolvida com o esforÃo deste trabalho, para continuar a investigaÃÃo molecular em prol da determinaÃÃo, em futuro breve, da ocorrÃncia ou nÃo de SNPs no exon 8 do TP53 em linfoma de Hodgkin. === Hodgkin lymphoma is a hematololgic B neoplasm occurring at patients within any age, however more likely to affect those from 15 to 40 years-old. The TP53 gene is 20kb length gene with 11 exons that encodes the p53 protein, which main function is related to the conservation and integrity of the genetic code. Most cancers show point mutations in the TP53 sequence. The analysis of these mutations allows a better understanding of the function of the diverse domains of the protein and its relationship to tumor suppression. There is only a few data about TP53 polymorphisms and Hodgkin lymphoma. In this manner, in our study we try to detect polymorphisms within the codons 272, 273, 278, 282, 306 of the exon 8 of the TP53 gene in Hodgkin lymphoma. In our survey we analyzed 42 paraffin-embedded tissues from 2000 to 2006. These samples were prepared for DNA extraction and PCR isolation and amplification of the 137bp fragment of the exon 8 of the TP53 gene, using exclusive primers specially designed to our experiment: PFw8 e PRv8. After PCR amplification, the products of the reaction were purified to the Sequencing reaction. The last part of the experiment encoded the bioinformatics analysis of sequences. DNA extraction and PCR amplification were successfully obtained in our study in all the samples. However, the DNA sequencing was only obtained in 32 samples, but there was no characteristic electropherogram of the analyzed region of the gene. Therefore, it was not possible to determine the presence or absence of SNPs in the TP53 exon 8.