Emergence of Nelfinavir and Lopinavir resistance relative to a clinically relevant human immunodeficiency virus type-1 single nucleotide polymorphism at position 36 in protease enzyme «in vitro»

• Main Author: Lisovsky, Irene
• Other Authors: Mark Wainberg (Supervisor)
• Format: Others
• Language: en
• Published: McGill University 2010
• Subjects: Biology - Virology
• Online Access: http://digitool.Library.McGill.CA:80/R/?func=dbin-jump-full&object_id=86996

The genetic differences and polymorphisms between HIV-1 subtype B and non-B subtypes have been well documented. Classically, however, antiretrovirals (ARVs), including protease inhibitors (PIs), have been designed based on structural and functional information obtained utilizing subtype B HIV-1. With the advent of antiretroviral therapy (ART) in developing countries and the emergence of non-B infections in developed countries, the impact of these polymorphisms must be evaluated in terms of ART efficacy. === The 36th amino acid in the viral protease (PR) of B subtypes is Methionine (M), while non-B subtypes code for Isoleucine (I). I at position 36 is associated with PI resistance in subtype B HIV-1; therefore, we sought to investigate the effect of this single nucleotide polymorphism on emergence of resistance mutations and PI susceptibility in various HIV-1 subtypes in vitro. Our results indicate that the effect of this single nucleotide polymorphism appears to be subtype specific and PI specific. === Les différences génétiques (polymorphismes) entre les différents sous-types du VIH-1, soit B et non-B, sont bien documentées. Toutefois, les antirétroviraux incluant les inhibiteurs de la protéase, ont été conçus de façon structurelle et fonctionnelle en utilisant les informations obtenues à partir du sous-type B. L'impact des polymorphismes des différents sous-types du VIH-1 sur l'efficacité des antirétroviraux doit être évalué dû à l'émergence des infections de sous-types non-B dans les pays développés ainsi qu'avec l'arrivée de la thérapie antirétrovirale dans les pays en voie de développement. === Le 36e acide aminé de la protéase virale de sous-type B du VIH-1 est une méthionine. Cependant, cet acide aminé est remplacé par une isoleucine dans les sous-types non-B. La présence d'une isoleucine à la position 36 entraîne une résistance du VIH-1 sous-type B pour les inhibiteurs de la protéase. Nous avons examiné l'effet de ce polymorphisme sur les mutations de résistance dans les différents sous-types de VIH in vitro. Nos résultats indiquent que l'effet de ce polymorphisme serait différent selon le sous-type.