Identification des staphylocoques, streptocoques et entérocoques par des méthodes génotypiques
Les infections causées par les staphylocoques, streptocoques et entérocoques sont en constante augmentation, en particulier dans les infections nosocomiales. Ainsi, une identification rapide et précise des bactéries responsables de ces infections est primordiale pour l'administration d'un...
Main Author: | |
---|---|
Other Authors: | |
Format: | Doctoral Thesis |
Language: | French |
Published: |
Université Laval
2010
|
Subjects: | |
Online Access: | http://hdl.handle.net/20.500.11794/22028 |
id |
ndltd-LAVAL-oai-corpus.ulaval.ca-20.500.11794-22028 |
---|---|
record_format |
oai_dc |
spelling |
ndltd-LAVAL-oai-corpus.ulaval.ca-20.500.11794-220282020-07-25T05:08:15Z Identification des staphylocoques, streptocoques et entérocoques par des méthodes génotypiques Sistek, Viridiana Bergeron, Michel G. Staphylocoques Streptococcus Enterococcus Maladies bactériennes -- Diagnostic Diagnostics moléculaires Puces à ADN Les infections causées par les staphylocoques, streptocoques et entérocoques sont en constante augmentation, en particulier dans les infections nosocomiales. Ainsi, une identification rapide et précise des bactéries responsables de ces infections est primordiale pour l'administration d'un traitement antimicrobien adapté. Cependant, dans les laboratoires de microbiologie clinique, les méthodes d'identification bactérienne actuelles requièrent plusieurs jours. Dans ce contexte, mon projet de doctorat a eu pour but de développer des outils de diagnostic moléculaire rapides pour identifier ces différentes espèces. Pour cela, nous avons mis au point, pour la première fois, un essai PCR en temps réel pour identifier spécifiquement l'espèce Streptococcus pseudopneumoniae. Nous avons, par la suite, élaboré une puce à ADN pour identifier, en moins d'lh30, 59 espèces bactériennes impliquées dans les septicémies, directement à partir d'hémocultures positives. Au cours de ce projet, nous avons en outre isolé et caractérisé deux nouvelles espèces d'entérocoques provenant d'échantillons d'eau. Les analyses phylogénétiques ont montré que ces bactéries font partie du groupe E. faecalis. La première espèce a été nommée Enterococcus quebecensis sp. nov. tandis que la deuxième a été désignée Enterococcus ureasum sp. nov.. Nos travaux ont ainsi permis de développer de nouveaux outils de diagnostic rapides pour identifier les espèces appartenant aux genres Staphylococcus, Streptococcus et Enterococcus et ont permis de décrire deux nouvelles espèces d'entérocoques retrouvées dans l'eau potable. 2010 info:eu-repo/semantics/openAccess https://corpus.ulaval.ca/jspui/conditions.jsp info:eu-repo/semantics/doctoralThesis http://hdl.handle.net/20.500.11794/22028 fre xi, 281 f. application/pdf Université Laval |
collection |
NDLTD |
language |
French |
format |
Doctoral Thesis |
sources |
NDLTD |
topic |
Staphylocoques Streptococcus Enterococcus Maladies bactériennes -- Diagnostic Diagnostics moléculaires Puces à ADN |
spellingShingle |
Staphylocoques Streptococcus Enterococcus Maladies bactériennes -- Diagnostic Diagnostics moléculaires Puces à ADN Sistek, Viridiana Identification des staphylocoques, streptocoques et entérocoques par des méthodes génotypiques |
description |
Les infections causées par les staphylocoques, streptocoques et entérocoques sont en constante augmentation, en particulier dans les infections nosocomiales. Ainsi, une identification rapide et précise des bactéries responsables de ces infections est primordiale pour l'administration d'un traitement antimicrobien adapté. Cependant, dans les laboratoires de microbiologie clinique, les méthodes d'identification bactérienne actuelles requièrent plusieurs jours. Dans ce contexte, mon projet de doctorat a eu pour but de développer des outils de diagnostic moléculaire rapides pour identifier ces différentes espèces. Pour cela, nous avons mis au point, pour la première fois, un essai PCR en temps réel pour identifier spécifiquement l'espèce Streptococcus pseudopneumoniae. Nous avons, par la suite, élaboré une puce à ADN pour identifier, en moins d'lh30, 59 espèces bactériennes impliquées dans les septicémies, directement à partir d'hémocultures positives. Au cours de ce projet, nous avons en outre isolé et caractérisé deux nouvelles espèces d'entérocoques provenant d'échantillons d'eau. Les analyses phylogénétiques ont montré que ces bactéries font partie du groupe E. faecalis. La première espèce a été nommée Enterococcus quebecensis sp. nov. tandis que la deuxième a été désignée Enterococcus ureasum sp. nov.. Nos travaux ont ainsi permis de développer de nouveaux outils de diagnostic rapides pour identifier les espèces appartenant aux genres Staphylococcus, Streptococcus et Enterococcus et ont permis de décrire deux nouvelles espèces d'entérocoques retrouvées dans l'eau potable. |
author2 |
Bergeron, Michel G. |
author_facet |
Bergeron, Michel G. Sistek, Viridiana |
author |
Sistek, Viridiana |
author_sort |
Sistek, Viridiana |
title |
Identification des staphylocoques, streptocoques et entérocoques par des méthodes génotypiques |
title_short |
Identification des staphylocoques, streptocoques et entérocoques par des méthodes génotypiques |
title_full |
Identification des staphylocoques, streptocoques et entérocoques par des méthodes génotypiques |
title_fullStr |
Identification des staphylocoques, streptocoques et entérocoques par des méthodes génotypiques |
title_full_unstemmed |
Identification des staphylocoques, streptocoques et entérocoques par des méthodes génotypiques |
title_sort |
identification des staphylocoques, streptocoques et entérocoques par des méthodes génotypiques |
publisher |
Université Laval |
publishDate |
2010 |
url |
http://hdl.handle.net/20.500.11794/22028 |
work_keys_str_mv |
AT sistekviridiana identificationdesstaphylocoquesstreptocoquesetenterocoquespardesmethodesgenotypiques |
_version_ |
1719331858004574208 |