The evolutionary relationships among IPNV by T1 fingerprint analysis

• Main Authors: CHEN,ZHI-CHENG, 陳志成
• Other Authors: CHU,YA-LI
• Format: Others
• Language: zh-TW
• Published: 1990
• Online Access: http://ndltd.ncl.edu.tw/handle/76966441845799200091

碩士 === 國立臺灣大學 === 動物學研究所 === 78 === RNA 病毒因具有高突變率 (約10-4) , 因此病毒族群會表現出很高的異質性, 及快速 演化特性; IPNV是偏佈臺灣魚貝類的重要病毒, 它屬兩段核醣核酸科病毒, 從快速RN A 及early viral polypeptide pattern之流行病學研究中,可知它正符合具高變率的 RNA 病毒, 最適合作分子演化關係研究之題材。RNA fingerprint 是一相當靈敏, 可 檢測到單一鹼基改變的 oligonucleotide方法。可分析具有90% 以上同源性的RNA 。 從對IPNV病毒T34G的RNA fingerprint 的分析中, 可看出IPNV病毒亦具有此快速演化 的異質性。在IPNV RNA fingerprint及其cluster 分析中, IPNV與其三血清型: AB , SP與VR-299的關係中, 發現了IPNV的樣以此三血清型分為三個 fingerprint groups, 而其中以VR-299與AB的RNA 相似度較高 (46.75%),而SP與AB的RNA 相似度較低 (42.7 7%) 由於SP於24℃環境下即無法增殖, 因而在臺灣高溫下, IPNV僅分離到AB與VR-299 型; 再配合cluster 分析結果, 說明了SP與AB/VR-299 是經不同的演化途徑。1984年 , 從三芝分離到的T24K, T34G及1987年從鹿谷分離到的T42G, 其RNA fingerprint 分 析中與VR-299的相似度均為88% 以上, 可歸在VR-299這一fingerprint group 中, 而 其中T24K, T34G與VR-299的RNA 相似度 (88.2%)又較T42G與VR-299 (92.5%)的為低 , 且T24K, T34G在相似度關係中, 又比VR-299更接近於AB(49.06%); T24K, T34G在其β 1 protein (capsid protein)上均已發生變化, 其大小介於AB與SP之間, 而明顯比VR -299的小; 而在EPC(epithelioma papillosum cyprini) 細胞對IPNV感受性實驗中 , 顯示了T34G已表現與VR-299不同的宿主範圍限制特性, 而與AB相同, 依這些實驗結果 , 可預測出VR-299在臺灣可能會往AB型演化。因此證明臺灣之AB為非單一起源 (pol- yphyletic)。