Expression of chloroplast psbD-psbC gene cluster in rice plants
碩士 === 國立海洋大學 === 水產食品科學研究所 === 80 === psbD及psbC分別為光合作用第二光系統反應中心之D2與CP43蛋白質的基因,兩者乃 ▔▔ ▔▔ 縱列於高等植物葉綠體DNA 之LSC 區域,其coding region 有一小段重疊。本論文 主要是探討水稻葉綠體在發育時間,psbD與psbC基因之表現,以及光照對此基因表 ▔...
Main Authors: | , |
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Language: | zh-TW |
Published: |
1992
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Online Access: | http://ndltd.ncl.edu.tw/handle/15780493010920298930 |
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ndltd-TW-080NTOU2084017 |
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ndltd-TW-080NTOU20840172015-10-13T14:20:27Z http://ndltd.ncl.edu.tw/handle/15780493010920298930 Expression of chloroplast psbD-psbC gene cluster in rice plants 水稻葉綠體psbD-psbC基因之表現 LU, ZHEN-HUA 呂貞華 碩士 國立海洋大學 水產食品科學研究所 80 psbD及psbC分別為光合作用第二光系統反應中心之D2與CP43蛋白質的基因,兩者乃 ▔▔ ▔▔ 縱列於高等植物葉綠體DNA 之LSC 區域,其coding region 有一小段重疊。本論文 主要是探討水稻葉綠體在發育時間,psbD與psbC基因之表現,以及光照對此基因表 ▔▔ ▔▔ 現之影響。首先,分別抽取在暗中與不同光照下生長的水稻幼苗之總RNA ,進行北 方墨點轉印分析,結果顯示,水稻葉綠體psbD-psbC 操縱子之表現,具有十分複雜 ▔▔ ▔▔ 的轉錄機制,至少產生五條主要轉錄產物,分別為:1.5Kb,1.6Kb,1.8Kb,3.0Kb ,3.2Kb 以及一些尚未確定的少量轉錄產物。暗中生長的水稻幼苗即有五條主要轉 錄產物累積(3.2Kb mRNA的含量極少,幾乎偵測不到),照光後,3.0Kb 與3.2Kb 二條RNA ,會隨光照時間加長,大量增加其累積量,其它數條RNA 的累積量則變化 較少。 在RNA 混雜交分析中,採用不同的DNA 探針或寡核酸探針進行雜交,會出現不同的 RNA 帶,顯示上述諸條psbD-psbC mRNA具有不同的5'端。為了要確定這些轉錄產物 ▔▔ ▔▔ 的5'端,於是以五條5'端標識之寡核酸探針與水稻葉總RNA 進行primer extension 分析,結果顯示3.2Kb mRNA具有heterogeneous 5'ends,主要的5'端點是位於psbD ▔▔ start codon 上游-565;3.0Kb 與 1.8Kb mRNA 的5'端,則分別位於 psbD start ▔▔ codon 下游+360及psbC start codon上游-196。分析比三條 mRNA 5'端上游的核酸 ▔▔ 序列都含有不同程度疑似原核的-35,-10之起動子序列。而在1.5Kb 與1.6Kb mRNA 5'端上游皆沒有找到疑似-35,-10之起動子序列。 在確定各個RNA 的5'端之後,依據RNA 的大小,選擇適當的DNA 片段,標識其下股 之3'端,與水稻總RNA 進行S1 nuclease protection分析,分別定出各RNA 的3'端 。結果顯示,1.6Kb,1.8Kb,3.2Kb mRNA的3'端位於psbC與trns之間;3.0Kb mRNA ▔▔ 的3'端則位於ORF62 與trnG之間,以巨型分子電腦軟體IG SUITE分析,此兩條mRNA ▔▔ 3'端上游都具有會形成"stem-loop" 構造之 inverted repeat (IR) 序列。1.5Kb mRNA具有heterogeneous 3'端,其上游核酸序列中,沒有找到明顯的 IR 序列,此 mRNA之生理功能可能為轉譯ORF100之蛋白質。 綜合以上結果,顯示水稻葉綠體psbD-psbC 操縱子轉錄時,可能利用不同的起動子 ▔▔ ▔▔ 區域。轉錄後,可能又經過5'processing以及3'processing,造成多條轉錄產物。 CHEN, SHU-ZHEN 陳淑真 1992 學位論文 ; thesis 87 zh-TW |
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碩士 === 國立海洋大學 === 水產食品科學研究所 === 80 === psbD及psbC分別為光合作用第二光系統反應中心之D2與CP43蛋白質的基因,兩者乃
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縱列於高等植物葉綠體DNA 之LSC 區域,其coding region 有一小段重疊。本論文
主要是探討水稻葉綠體在發育時間,psbD與psbC基因之表現,以及光照對此基因表
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現之影響。首先,分別抽取在暗中與不同光照下生長的水稻幼苗之總RNA ,進行北
方墨點轉印分析,結果顯示,水稻葉綠體psbD-psbC 操縱子之表現,具有十分複雜
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的轉錄機制,至少產生五條主要轉錄產物,分別為:1.5Kb,1.6Kb,1.8Kb,3.0Kb
,3.2Kb 以及一些尚未確定的少量轉錄產物。暗中生長的水稻幼苗即有五條主要轉
錄產物累積(3.2Kb mRNA的含量極少,幾乎偵測不到),照光後,3.0Kb 與3.2Kb
二條RNA ,會隨光照時間加長,大量增加其累積量,其它數條RNA 的累積量則變化
較少。
在RNA 混雜交分析中,採用不同的DNA 探針或寡核酸探針進行雜交,會出現不同的
RNA 帶,顯示上述諸條psbD-psbC mRNA具有不同的5'端。為了要確定這些轉錄產物
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的5'端,於是以五條5'端標識之寡核酸探針與水稻葉總RNA 進行primer extension
分析,結果顯示3.2Kb mRNA具有heterogeneous 5'ends,主要的5'端點是位於psbD
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start codon 上游-565;3.0Kb 與 1.8Kb mRNA 的5'端,則分別位於 psbD start
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codon 下游+360及psbC start codon上游-196。分析比三條 mRNA 5'端上游的核酸
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序列都含有不同程度疑似原核的-35,-10之起動子序列。而在1.5Kb 與1.6Kb mRNA
5'端上游皆沒有找到疑似-35,-10之起動子序列。
在確定各個RNA 的5'端之後,依據RNA 的大小,選擇適當的DNA 片段,標識其下股
之3'端,與水稻總RNA 進行S1 nuclease protection分析,分別定出各RNA 的3'端
。結果顯示,1.6Kb,1.8Kb,3.2Kb mRNA的3'端位於psbC與trns之間;3.0Kb mRNA
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的3'端則位於ORF62 與trnG之間,以巨型分子電腦軟體IG SUITE分析,此兩條mRNA
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3'端上游都具有會形成"stem-loop" 構造之 inverted repeat (IR) 序列。1.5Kb
mRNA具有heterogeneous 3'端,其上游核酸序列中,沒有找到明顯的 IR 序列,此
mRNA之生理功能可能為轉譯ORF100之蛋白質。
綜合以上結果,顯示水稻葉綠體psbD-psbC 操縱子轉錄時,可能利用不同的起動子
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區域。轉錄後,可能又經過5'processing以及3'processing,造成多條轉錄產物。
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