Verifiering av procalcitonin på instrumentet ADVIA Centaur XPT
Bakgrund och syfte Procalcitonin (PCT) används i sjukvården vid uppföljning av patienter med bakterieinfektion. Under rådande corona-pandemi har studier visat att förhöjt PCT är associerat med utvecklingen av en svår form av Sars-Cov2-infektion. Genom att mäta PCT kan tecken till sekundär bakteriein...
Main Author: | |
---|---|
Format: | Others |
Language: | Swedish |
Published: |
Örebro universitet, Institutionen för hälsovetenskaper
2020
|
Subjects: | |
Online Access: | http://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:oru:diva-85291 |
id |
ndltd-UPSALLA1-oai-DiVA.org-oru-85291 |
---|---|
record_format |
oai_dc |
spelling |
ndltd-UPSALLA1-oai-DiVA.org-oru-852912020-09-02T05:31:36ZVerifiering av procalcitonin på instrumentet ADVIA Centaur XPTsweVerification of procalcitonin on the instrument ADVIA Centaur XPTMalm, BeatriceÖrebro universitet, Institutionen för hälsovetenskaper2020procalcitonincovid-19method verificationmethod comparisonProcalcitoninCovid-19metodverifieringmetodjämförelseBiomedical Laboratory Science/TechnologyBiomedicinsk laboratorievetenskap/teknologiBakgrund och syfte Procalcitonin (PCT) används i sjukvården vid uppföljning av patienter med bakterieinfektion. Under rådande corona-pandemi har studier visat att förhöjt PCT är associerat med utvecklingen av en svår form av Sars-Cov2-infektion. Genom att mäta PCT kan tecken till sekundär bakterieinfektion identifieras och utvecklingen av svår sjukdomsbild förutspås.På Universitetssjukhuset Örebro (USÖ) sker analysen av PCT på instrumentet Cobas e411. Under den pågående pandemin pågår det nu diskussion kring att överföra PCT-analysen till instrumenten ADVIA Centaur XPT på USÖ istället eftersom detta instrument även finns i Lindesberg och Karlskoga. Analysen skulle därmed kunna ske på alla tre laboratorier. Metod Venöst blod med olika koncentrationer av PCT samlades in från 21 patienter. Proverna användes till patientjämförelse. Till inomserieprecision användes patientprover som poolats till en hög och en låg nivå. Till totalprecisionen användes hög och låg kontroll. Datan från patientjämförelsen bearbetades i Excel och presenterades i linjära regressioner och Bland altman-plot. Som sensitivitetsanalys upprepades den statistiska bearbetningen med de sju högsta värdena exkluderade. Resultat och slutsats Patientjämförelsen mellan Cobas e411 och ADVIA Centaur XPT 1070 samt mellan ADVIA Centaur XPT 1070 och 1071 visade en bra korrelation. ADVIA Centaur XPT mäter dock lägre än Cobas e411, vilket ses i Bland altman-plotten som en metodbias på 30%. Detta ses även efter sensitivitetsanalys med högre värden exkluderade och datan bearbetats på nytt. Precisionsmätningarna visade bra precision med låga CV% för både ADVIA Centaur XPT 1070 och 1071.Med hänsyn till resultatet betraktas bytet till ADVIA Centaur XPT som en risk, varför beslutet fattas att fortsättningsvis analysera PCT på Cobas e411. Background and purpose The PCT-value is used for observing the development of illness in patients with bacterial infection. During the Covid 19-pandemic, studies have shown that an increased PCT predicts a severe Covid-19.At the University hospital of Örebro, USÖ, the PCT assay is analyzed on the Cobas e411 instrument. The hospitals of Lindesberg and Karlskoga cannot perform the analysis due to a lack of this instrumentation.Since Centaur instruments are available at all three hospitals, performing the analysis on these instruments instead of the Cobas would enable all three hospital laboratories in the county to offer PCT analysis. Method Venous blood with different PCT values where collected from 21 patients and analysed with Siemens ADVIA Centaur XPT and Roche Cobas e411. Within-run precision was tested using pooled samples of low and high PCT concentrations. Between-run precision was tested using controls of low and high PCT concentrations. The data was examined by linear regression and Bland altman-plots using Excel. As a sensitivity analysis, the seven highest values were excluded, and the statistical analysis was repeated. Results and conclusion Despite the values correlating well in the linear regression and the assay had a high precision with a low CV% for both ADVIA Centaur XPT 1070 and 1071, the ADVIA Centaur XPT-instrument systematically measures 30% lower compared to Cobas e411. This method bias could lead to a misclassification of Covid 19-patients. With respect to our results, we consider analysis on ADVIA Centaur XPT to be risky and thus choose to continue analysing on Cobas e411. Student thesisinfo:eu-repo/semantics/bachelorThesistexthttp://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:oru:diva-85291application/pdfinfo:eu-repo/semantics/openAccess |
collection |
NDLTD |
language |
Swedish |
format |
Others
|
sources |
NDLTD |
topic |
procalcitonin covid-19 method verification method comparison Procalcitonin Covid-19 metodverifiering metodjämförelse Biomedical Laboratory Science/Technology Biomedicinsk laboratorievetenskap/teknologi |
spellingShingle |
procalcitonin covid-19 method verification method comparison Procalcitonin Covid-19 metodverifiering metodjämförelse Biomedical Laboratory Science/Technology Biomedicinsk laboratorievetenskap/teknologi Malm, Beatrice Verifiering av procalcitonin på instrumentet ADVIA Centaur XPT |
description |
Bakgrund och syfte Procalcitonin (PCT) används i sjukvården vid uppföljning av patienter med bakterieinfektion. Under rådande corona-pandemi har studier visat att förhöjt PCT är associerat med utvecklingen av en svår form av Sars-Cov2-infektion. Genom att mäta PCT kan tecken till sekundär bakterieinfektion identifieras och utvecklingen av svår sjukdomsbild förutspås.På Universitetssjukhuset Örebro (USÖ) sker analysen av PCT på instrumentet Cobas e411. Under den pågående pandemin pågår det nu diskussion kring att överföra PCT-analysen till instrumenten ADVIA Centaur XPT på USÖ istället eftersom detta instrument även finns i Lindesberg och Karlskoga. Analysen skulle därmed kunna ske på alla tre laboratorier. Metod Venöst blod med olika koncentrationer av PCT samlades in från 21 patienter. Proverna användes till patientjämförelse. Till inomserieprecision användes patientprover som poolats till en hög och en låg nivå. Till totalprecisionen användes hög och låg kontroll. Datan från patientjämförelsen bearbetades i Excel och presenterades i linjära regressioner och Bland altman-plot. Som sensitivitetsanalys upprepades den statistiska bearbetningen med de sju högsta värdena exkluderade. Resultat och slutsats Patientjämförelsen mellan Cobas e411 och ADVIA Centaur XPT 1070 samt mellan ADVIA Centaur XPT 1070 och 1071 visade en bra korrelation. ADVIA Centaur XPT mäter dock lägre än Cobas e411, vilket ses i Bland altman-plotten som en metodbias på 30%. Detta ses även efter sensitivitetsanalys med högre värden exkluderade och datan bearbetats på nytt. Precisionsmätningarna visade bra precision med låga CV% för både ADVIA Centaur XPT 1070 och 1071.Med hänsyn till resultatet betraktas bytet till ADVIA Centaur XPT som en risk, varför beslutet fattas att fortsättningsvis analysera PCT på Cobas e411. === Background and purpose The PCT-value is used for observing the development of illness in patients with bacterial infection. During the Covid 19-pandemic, studies have shown that an increased PCT predicts a severe Covid-19.At the University hospital of Örebro, USÖ, the PCT assay is analyzed on the Cobas e411 instrument. The hospitals of Lindesberg and Karlskoga cannot perform the analysis due to a lack of this instrumentation.Since Centaur instruments are available at all three hospitals, performing the analysis on these instruments instead of the Cobas would enable all three hospital laboratories in the county to offer PCT analysis. Method Venous blood with different PCT values where collected from 21 patients and analysed with Siemens ADVIA Centaur XPT and Roche Cobas e411. Within-run precision was tested using pooled samples of low and high PCT concentrations. Between-run precision was tested using controls of low and high PCT concentrations. The data was examined by linear regression and Bland altman-plots using Excel. As a sensitivity analysis, the seven highest values were excluded, and the statistical analysis was repeated. Results and conclusion Despite the values correlating well in the linear regression and the assay had a high precision with a low CV% for both ADVIA Centaur XPT 1070 and 1071, the ADVIA Centaur XPT-instrument systematically measures 30% lower compared to Cobas e411. This method bias could lead to a misclassification of Covid 19-patients. With respect to our results, we consider analysis on ADVIA Centaur XPT to be risky and thus choose to continue analysing on Cobas e411. |
author |
Malm, Beatrice |
author_facet |
Malm, Beatrice |
author_sort |
Malm, Beatrice |
title |
Verifiering av procalcitonin på instrumentet ADVIA Centaur XPT |
title_short |
Verifiering av procalcitonin på instrumentet ADVIA Centaur XPT |
title_full |
Verifiering av procalcitonin på instrumentet ADVIA Centaur XPT |
title_fullStr |
Verifiering av procalcitonin på instrumentet ADVIA Centaur XPT |
title_full_unstemmed |
Verifiering av procalcitonin på instrumentet ADVIA Centaur XPT |
title_sort |
verifiering av procalcitonin på instrumentet advia centaur xpt |
publisher |
Örebro universitet, Institutionen för hälsovetenskaper |
publishDate |
2020 |
url |
http://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:oru:diva-85291 |
work_keys_str_mv |
AT malmbeatrice verifieringavprocalcitoninpainstrumentetadviacentaurxpt AT malmbeatrice verificationofprocalcitoninontheinstrumentadviacentaurxpt |
_version_ |
1719339141293932544 |