Phosphorylation du CTD de l'ARN polymérase II et impact de l'histone H2A.Z sur le positionnement des nucléosomes chez S. cerevisiae
La phosphorylation du domaine C-terminal de l’ARN polymérase II permet à ce complexe protéique d’exécuter la transcription des gènes, en plus de coupler à la transcription des événements moléculaires comme la maturation des ARNm. Mes résultats montrent que même si cette phosphorylation suit un pa...
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2009
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ndltd-umontreal.ca-oai-papyrus.bib.umontreal.ca-1866-27812017-03-17T08:11:53Z Phosphorylation du CTD de l'ARN polymérase II et impact de l'histone H2A.Z sur le positionnement des nucléosomes chez S. cerevisiae Bergeron, Maxime Robert, François génome génomique transcription expression chromatine puce à ADN microarray levure HTZ1 genome genomics chromatin DNA chip microarray yeast Biology - Molecular / Biologie - Biologie moléculaire (UMI : 0307) La phosphorylation du domaine C-terminal de l’ARN polymérase II permet à ce complexe protéique d’exécuter la transcription des gènes, en plus de coupler à la transcription des événements moléculaires comme la maturation des ARNm. Mes résultats montrent que même si cette phosphorylation suit un patron similaire à l’ensemble des gènes, il existe des exceptions pouvant être dues à des mécanismes alternatifs de phosphorylation du CTD. Le présent ouvrage s’intéresse également au rôle qu’occupe la variante d’histone H2A.Z dans l’organisation de la chromatine. Des études précédentes on montré que le positionnement de certains nucléosomes le long de l’ADN serait influencé par H2A.Z et aurait une influence sur la capacité de transcrire les gènes. Par une approche génomique utilisant les puces à ADN, j’ai cartographié l’impact de la délétion de H2A.Z sur la structure des nucléosomes. Enfin, des résultats intéressants sur la dynamique d’incorporation de H2A.Z à la chromatine ont été obtenus. RNA Polymerase II is the molecular complex responsible for the transcription of class II genes. Proper transcription and associated events such as mRNA processing are thought to require the phosphorylation of its C-terminal domain. Here I show that this phosphorylation follows a similar pattern for most of the genes, althought some exceptions exist. These exceptions could be explained by alternative phosphorylation mechanisms. Also, this work provides data on how the variant histone H2A.Z influences chromatin structure. Previous studies have shown a role for H2A.Z in the positioning of some nucleosomes along the DNA, which would impact the ability to transcribe genes. Here I used a microarray technology to profile nucleosome positions in a genome-wide manner. My data provide further evidence that H2A.Z influences nucleosome positioning. Interesting results regarding the dynamics of H2A.Z incorporation into chromatin are also shown. 2009-04-23T14:43:17Z NO_RESTRICTION 2009-04-23T14:43:17Z 2009-03-05 2008-10 Thèse ou Mémoire numérique / Electronic Thesis or Dissertation http://hdl.handle.net/1866/2781 fr |
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génome génomique transcription expression chromatine puce à ADN microarray levure HTZ1 genome genomics chromatin DNA chip microarray yeast Biology - Molecular / Biologie - Biologie moléculaire (UMI : 0307) Bergeron, Maxime Phosphorylation du CTD de l'ARN polymérase II et impact de l'histone H2A.Z sur le positionnement des nucléosomes chez S. cerevisiae |
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La phosphorylation du domaine C-terminal de l’ARN polymérase II permet à ce complexe
protéique d’exécuter la transcription des gènes, en plus de coupler à la transcription des
événements moléculaires comme la maturation des ARNm. Mes résultats montrent que
même si cette phosphorylation suit un patron similaire à l’ensemble des gènes, il existe des
exceptions pouvant être dues à des mécanismes alternatifs de phosphorylation du CTD. Le
présent ouvrage s’intéresse également au rôle qu’occupe la variante d’histone H2A.Z dans
l’organisation de la chromatine. Des études précédentes on montré que le positionnement
de certains nucléosomes le long de l’ADN serait influencé par H2A.Z et aurait une
influence sur la capacité de transcrire les gènes. Par une approche génomique utilisant les
puces à ADN, j’ai cartographié l’impact de la délétion de H2A.Z sur la structure des
nucléosomes. Enfin, des résultats intéressants sur la dynamique d’incorporation de H2A.Z à
la chromatine ont été obtenus. === RNA Polymerase II is the molecular complex responsible for the transcription of class II
genes. Proper transcription and associated events such as mRNA processing are thought to
require the phosphorylation of its C-terminal domain. Here I show that this phosphorylation
follows a similar pattern for most of the genes, althought some exceptions exist. These
exceptions could be explained by alternative phosphorylation mechanisms. Also, this work
provides data on how the variant histone H2A.Z influences chromatin structure. Previous
studies have shown a role for H2A.Z in the positioning of some nucleosomes along the
DNA, which would impact the ability to transcribe genes. Here I used a microarray
technology to profile nucleosome positions in a genome-wide manner. My data provide
further evidence that H2A.Z influences nucleosome positioning. Interesting results
regarding the dynamics of H2A.Z incorporation into chromatin are also shown. |
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