بررسی مولکولی cDNAی کد کننده‌ی سم مؤثر بر ایزوفرم دوم گیرنده‌ی ریانودین حاصل از کتابخانه‌ی cDNAی غده‌ی زهری عقرب زرد ایرانی Odontobuthus doriae
مقدمه: زهر عقرب‌ها، از پپتیدهای فعال زیستی تشکیل شده است که ارزش پزشکی در کشف دارو دارند. امروزه، بسیاری از مطالعات به آینده‌ی درمان با ترکیبات زهر عقرب‌ها بر اساس فعالیت طبیعی که در زهر دارند، اشاره می‌کنند. یکی از انواع پپتیدهای زهری، سموم مؤثر بر کانال‌های کلسیمی است که گیرنده‌های کلسیمی حساس به...
| Main Authors: | , , |
|---|---|
| Format: | Article |
| Language: | fas |
| Published: |
Vesnu Publications
2016-11-01
|
| Series: | مجله دانشکده پزشکی اصفهان |
| Subjects: | |
| Online Access: | http://jims.mui.ac.ir/index.php/jims/article/view/6638 |
| id |
doaj-7a5597258f5f410f9452db54f8e94b42 |
|---|---|
| record_format |
Article |
| spelling |
doaj-7a5597258f5f410f9452db54f8e94b422020-11-24T21:40:11ZfasVesnu Publications مجله دانشکده پزشکی اصفهان1027-75951735-854X2016-11-0134397103210372311بررسی مولکولی cDNAی کد کننده‌ی سم مؤثر بر ایزوفرم دوم گیرنده‌ی ریانودین حاصل از کتابخانه‌ی cDNAی غده‌ی زهری عقرب زرد ایرانی Odontobuthus doriaeMaryam Naderi-Soorki0Amir Jalali1Hamid Galehdari2Department of Genetics, School of Science, Shahaid Chamran University of Ahvaz, Ahvaz, IranAssociate Professor, Department of Pharmacology and Toxicology, School of Pharmacy AND Toxicology Research Center, Ahvaz Jundishapur University of Medical Sciences, Ahvaz, IranProfessor, Department of Genetics, School of Science, Shahaid Chamran University of Ahvaz, Ahvaz, Iranمقدمه: زهر عقرب‌ها، از پپتیدهای فعال زیستی تشکیل شده است که ارزش پزشکی در کشف دارو دارند. امروزه، بسیاری از مطالعات به آینده‌ی درمان با ترکیبات زهر عقرب‌ها بر اساس فعالیت طبیعی که در زهر دارند، اشاره می‌کنند. یکی از انواع پپتیدهای زهری، سموم مؤثر بر کانال‌های کلسیمی است که گیرنده‌های کلسیمی حساس به ریانودین (Ryanodine sensitive Ca+2-receptors یا RyRs) را مهار می‌کنند. فعالیت کنترل نشده‌ی ایزوفرم-2 این کانال‌ها (RyR2) در مشکلاتی مانند آریتمی قلبی مشاهده شده است. سموم کلسیمی مهار کننده‌ی این گیرنده‌ی یونی، می‌تواند به عنوان دارویی طبیعی در جهت درمان این عارضه باشد. روش‌ها: کتابخانه‌ی complementary DNA (cDNA) از غده‌ی زهری 6 عقرب Odontobuthus doriae ساخته شد. cDNAی مربوط به ODCaTx1 از این کتابخانه جدا و تعیین ترادف نوکلئوتیدی شد. توالی حاصل مورد ارزیابی‌های مولکولی به کمک برخی نرم‌افزارها نظیر ORF finder، BlastP، DISULFIND، signalP4.1، ProtParam و Phyre2 مورد بررسی قرار گرفت. یافته‌ها: پپتید احتمالی ODCaTx1 دارای وزن مولکولی بسیار کم (1/4440 دالتون) و 43 اسید آمینه بود که جزء مولکول‌های پایدار طبقه‌بندی شد. این پپتید، در بررسی‌های متعدد بیوانفورماتیک، شباهت بسیار زیادی به نوعی سم مهار کننده‌ی RyR2 از عقرب Hottentotta judaicus داشت. نیمه عمر تخمینی آن (در رتیکولوسیت‌های پستانداران، In vitro) 30 ساعت محاسبه شد. نتیجه‌گیری: در این مطالعه، cDNAی یکی از سموم کلسیمی مؤثر بر ایزوفرم-2 گیرنده‌های ریانودین و پپتید احتمالی آن (ODCaTx1) از غده‌ی زهری عقرب زرد ایرانی، مورد ارزیابی مولکولی قرار گرفت. همچنین، بستری مناسب جهت بیان مقادیر کافی از پپتید به وجود آمد. این سم به دلیل اندازه‌ی کوچک و پایداری زیاد، می‌تواند کاندیدای مناسبی در مطالعات دارویی مرتبط با درمان آریتمی قلبی و تشنج باشد.http://jims.mui.ac.ir/index.php/jims/article/view/6638Ryanodine receptor isoform-2Scorpion calcium toxinsHeart arrhythmiaTreatment, cDNA libraryOdontobuthus doriae |
| collection |
DOAJ |
| language |
fas |
| format |
Article |
| sources |
DOAJ |
| author |
Maryam Naderi-Soorki Amir Jalali Hamid Galehdari |
| spellingShingle |
Maryam Naderi-Soorki Amir Jalali Hamid Galehdari بررسی مولکولی cDNAی کد کننده‌ی سم مؤثر بر ایزوفرم دوم گیرنده‌ی ریانودین حاصل از کتابخانه‌ی cDNAی غده‌ی زهری عقرب زرد ایرانی Odontobuthus doriae مجله دانشکده پزشکی اصفهان Ryanodine receptor isoform-2 Scorpion calcium toxins Heart arrhythmia Treatment, cDNA library Odontobuthus doriae |
| author_facet |
Maryam Naderi-Soorki Amir Jalali Hamid Galehdari |
| author_sort |
Maryam Naderi-Soorki |
| title |
بررسی مولکولی cDNAی کد کننده‌ی سم مؤثر بر ایزوفرم دوم گیرنده‌ی ریانودین حاصل از کتابخانه‌ی cDNAی غده‌ی زهری عقرب زرد ایرانی Odontobuthus doriae |
| title_short |
بررسی مولکولی cDNAی کد کننده‌ی سم مؤثر بر ایزوفرم دوم گیرنده‌ی ریانودین حاصل از کتابخانه‌ی cDNAی غده‌ی زهری عقرب زرد ایرانی Odontobuthus doriae |
| title_full |
بررسی مولکولی cDNAی کد کننده‌ی سم مؤثر بر ایزوفرم دوم گیرنده‌ی ریانودین حاصل از کتابخانه‌ی cDNAی غده‌ی زهری عقرب زرد ایرانی Odontobuthus doriae |
| title_fullStr |
بررسی مولکولی cDNAی کد کننده‌ی سم مؤثر بر ایزوفرم دوم گیرنده‌ی ریانودین حاصل از کتابخانه‌ی cDNAی غده‌ی زهری عقرب زرد ایرانی Odontobuthus doriae |
| title_full_unstemmed |
بررسی مولکولی cDNAی کد کننده‌ی سم مؤثر بر ایزوفرم دوم گیرنده‌ی ریانودین حاصل از کتابخانه‌ی cDNAی غده‌ی زهری عقرب زرد ایرانی Odontobuthus doriae |
| title_sort |
بررسی مولکولی cdnaی کد کننده‌ی سم مؤثر بر ایزوفرم دوم گیرنده‌ی ریانودین حاصل از کتابخانه‌ی cdnaی غده‌ی زهری عقرب زرد ایرانی odontobuthus doriae |
| publisher |
Vesnu Publications |
| series |
مجله دانشکده پزشکی اصفهان |
| issn |
1027-7595 1735-854X |
| publishDate |
2016-11-01 |
| description |
مقدمه: زهر عقرب‌ها، از پپتیدهای فعال زیستی تشکیل شده است که ارزش پزشکی در کشف دارو دارند. امروزه، بسیاری از مطالعات به آینده‌ی درمان با ترکیبات زهر عقرب‌ها بر اساس فعالیت طبیعی که در زهر دارند، اشاره می‌کنند. یکی از انواع پپتیدهای زهری، سموم مؤثر بر کانال‌های کلسیمی است که گیرنده‌های کلسیمی حساس به ریانودین (Ryanodine sensitive Ca+2-receptors یا RyRs) را مهار می‌کنند. فعالیت کنترل نشده‌ی ایزوفرم-2 این کانال‌ها (RyR2) در مشکلاتی مانند آریتمی قلبی مشاهده شده است. سموم کلسیمی مهار کننده‌ی این گیرنده‌ی یونی، می‌تواند به عنوان دارویی طبیعی در جهت درمان این عارضه باشد.
روش‌ها: کتابخانه‌ی complementary DNA (cDNA) از غده‌ی زهری 6 عقرب Odontobuthus doriae ساخته شد. cDNAی مربوط به ODCaTx1 از این کتابخانه جدا و تعیین ترادف نوکلئوتیدی شد. توالی حاصل مورد ارزیابی‌های مولکولی به کمک برخی نرم‌افزارها نظیر ORF finder، BlastP، DISULFIND، signalP4.1، ProtParam و Phyre2 مورد بررسی قرار گرفت.
یافته‌ها: پپتید احتمالی ODCaTx1 دارای وزن مولکولی بسیار کم (1/4440 دالتون) و 43 اسید آمینه بود که جزء مولکول‌های پایدار طبقه‌بندی شد. این پپتید، در بررسی‌های متعدد بیوانفورماتیک، شباهت بسیار زیادی به نوعی سم مهار کننده‌ی RyR2 از عقرب Hottentotta judaicus داشت. نیمه عمر تخمینی آن (در رتیکولوسیت‌های پستانداران، In vitro) 30 ساعت محاسبه شد.
نتیجه‌گیری: در این مطالعه، cDNAی یکی از سموم کلسیمی مؤثر بر ایزوفرم-2 گیرنده‌های ریانودین و پپتید احتمالی آن (ODCaTx1) از غده‌ی زهری عقرب زرد ایرانی، مورد ارزیابی مولکولی قرار گرفت. همچنین، بستری مناسب جهت بیان مقادیر کافی از پپتید به وجود آمد. این سم به دلیل اندازه‌ی کوچک و پایداری زیاد، می‌تواند کاندیدای مناسبی در مطالعات دارویی مرتبط با درمان آریتمی قلبی و تشنج باشد. |
| topic |
Ryanodine receptor isoform-2 Scorpion calcium toxins Heart arrhythmia Treatment, cDNA library Odontobuthus doriae |
| url |
http://jims.mui.ac.ir/index.php/jims/article/view/6638 |
| work_keys_str_mv |
AT maryamnaderisoorki brrsymwlḵwlycdnayḵdḵnndhysmmwtẖrbrạyzwfrmdwmgyrndhyryạnwdynḥạṣlạzḵtạbkẖạnhycdnaygẖdhyzhryʿqrbzrdạyrạnyodontobuthusdoriae AT amirjalali brrsymwlḵwlycdnayḵdḵnndhysmmwtẖrbrạyzwfrmdwmgyrndhyryạnwdynḥạṣlạzḵtạbkẖạnhycdnaygẖdhyzhryʿqrbzrdạyrạnyodontobuthusdoriae AT hamidgalehdari brrsymwlḵwlycdnayḵdḵnndhysmmwtẖrbrạyzwfrmdwmgyrndhyryạnwdynḥạṣlạzḵtạbkẖạnhycdnaygẖdhyzhryʿqrbzrdạyrạnyodontobuthusdoriae |
| _version_ |
1725927513517981696 |