Genetic similarity of Brazilian hull-less and malting barley varieties evaluated by RAPD markers Similaridade genética de variedades brasileiras de cevada nua e cevada cervejeira avaliada por marcadores RAPD

• Main Authors: Mariela Aparecida Kroth, Micheline Sandra Ramella, Caroline Tagliari, Alicia de Francisco, Ana Carolina Maisonnave Arisi
• Format: Article
• Language: English
• Published: Universidade de São Paulo 2005-01-01
• Series: Scientia Agricola
• Subjects: Hordeum vulgare; polimorfismo; caracterização molecular; polymorphism; molecular characterization
• Online Access: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-90162005000100007
• ISSN: 0103-9016; 1678-992X

Barley (Hordeum vulgare L.) is widely used for brewing and animal feed. Recently, it has become desirable for human consumption due to its high nutritional significance, specially hull-less or naked barley. There are differences in nutritional and malting characteristics among barley varieties. RAPD procedure is able to separate barley varieties at various similarity levels. The aim of this work was the RAPD analysis of six Brazilian hull-less varieties and seven malting varieties. PCR reactions were performed with eleven random primers. A total of 34 RAPD fragments was obtained with five primers. A dendrogram was constructed based on the Jaccard similarity coefficient. Barley varieties displayed an average similarity coefficient of 0.53. Intravarietal monomorphic fragments allowed differentiation among varieties. The averages of intravarietal similarity coefficients ranged from 0.53 to 0.85. RAPD markers, detected in this work, were suitable for differentiation among Brazilian barley varieties.<br>A cevada (Hordeum vulgare L.) é amplamente empregada na produção de cerveja e na ração animal. Recentemente, este cereal tornou-se desejável na alimentação humana devido ao seu alto valor nutricional, principalmente da cevada nua ou sem casca. Existem diferenças nas características nutricionais e para malteação entre as diversas variedades de cevada. O procedimento RAPD é capaz de separar as variedades de cevada em vários níveis de similaridade. O objetivo desse trabalho foi analisar por RAPD seis variedades brasileiras de cevada nua e sete variedades de cevada cervejeira. Reações de PCR foram realizadas com onze iniciadores aleatórios. Um total de 34 fragmentos de amplificação foi obtido com cinco destes iniciadores. Baseado no coeficiente de similaridade de Jaccard, um dendrograma foi construído. As variedades de cevada apresentaram índice médio de similaridade de 0,53. Fragmentos monomórficos intravariedades permitiram a diferenciação entre as variedades. Os coeficientes médios de similaridade intravariedades encontram-se entre 0,53 e 0,85. Os marcadores RAPD detectados neste trabalho foram adequados para a diferenciação entre as variedades brasileiras de cevada.