Arquiteturas em hardware para o alinhamento local de sequências biológicas

Arquiteturas em hardware para o alinhamento local de sequências biológicas

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Bancos de dados biológicos utilizados para comparação e alinhamento local de sequências tem crescido de forma exponencial. Isso popularizou programas que realizam buscas nesses bancos. As implementações dos algoritmos de alinhamento de sequências Smith- Waterman e distância Levenshtein demonstraram...

Full description

Bibliographic Details
Main Author: Mallmann, Rafael Mendes
Other Authors: Wirth, Gilson Inacio
Format: Others
Language:Portuguese
Published: 2012
Subjects:
Microeletrônica
Aplicação dos computadores
DNA sequence scanning
Smith-Waterman
Edit distanve
Levenshtein distance
Dynamic programming
Systolic array
FPGA
ASIC
VLSI
Protein sequences
Query sequence
Subject sequence
Online Access:http://hdl.handle.net/10183/56841

Internet

http://hdl.handle.net/10183/56841

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