Pangenome modeling for analyzing the evolution of Mycobacterium tuberculosis.
泛基因组的概念来源于比较分析同一微生物物种的多个基因组。泛基因组分析已经被用于研究病原微生物基因组的变化，并且揭示了与菌株进化和宿主适应相关的特异基因。目前泛基因组研究主要集中在估计不同物种的泛基因组大小。但是对泛基因组的结构进行进化分析的生物信息方法还有待开发，以便研究不同基因在不同菌株的进化，比如基因的获得或者丢失，或者共同进化的基因簇。这样的分析方法可以把基因和菌株之间的表型关联起来，为进一步的生物学实验提供线索。 === 为了研究结核分枝杆菌种和分枝杆菌属泛基因组进化的规律并揭示其生物学意义，本论文开发了两种泛基因组数据分析的生物信息学方法。第一个是基于局部最大简约计算的祖先状态重构算...
| Other Authors: | |
|---|---|
| Format: | Others |
| Language: | English Chinese |
| Published: |
2014
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| Subjects: | |
| Online Access: | http://library.cuhk.edu.hk/record=b6116137 http://repository.lib.cuhk.edu.hk/en/item/cuhk-1077698 |