Ultra-Deep Sequencing Characterization of HCV Samples with Equivocal Typing Results Determined with a Commercial Assay

by Claudia Minosse, Emanuela Giombini, Barbara Bartolini, Maria R. Capobianchi, Anna R. Garbuglia
Published 2016-10-01

Metagenomic approach for discovering new pathogens in infection disease outbreaks

by Emanuela Giombini, Barbara Bartolini, Gabriella Rozera, Marina Selleri, Paola Zaccaro, Maria Rosaria Capobianchi, Isabella Abbate
Published 2011-09-01

In-Depth Analysis of HA and NS1 Genes in A(H1N1)pdm09 Infected Patients.

by Claudia Caglioti, Marina Selleri, Gabriella Rozera, Emanuela Giombini, Paola Zaccaro, Maria Beatrice Valli, Maria Rosaria Capobianchi
Published 2016-01-01

Enterovirus D68–Associated Acute Flaccid Myelitis in Immunocompromised Woman, Italy

by Emanuela Giombini, Martina Rueca, Walter Barberi, Anna Paola Iori, Concetta Castilletti, Paola Scognamiglio, Francesco Vairo, Giuseppe Ippolito, Maria Rosaria Capobianchi, Maria Beatrice Valli
Published 2017-10-01

Characterization of Naturally Occurring NS5A and NS5B Polymorphisms in Patients Infected with HCV Genotype 3a Treated with Direct-Acting Antiviral Agents

by Barbara Bartolini, Emanuela Giombini, Chiara Taibi, Raffaella Lionetti, Marzia Montalbano, Ubaldo Visco-Comandini, Gianpiero D’Offizi, Maria Rosaria Capobianchi, Fiona McPhee, Anna Rosa Garbuglia
Published 2017-08-01

Compartmentalized Replication of SARS-Cov-2 in Upper vs. Lower Respiratory Tract Assessed by Whole Genome Quasispecies Analysis

by Martina Rueca, Barbara Bartolini, Cesare Ernesto Maria Gruber, Antonio Piralla, Fausto Baldanti, Emanuela Giombini, Francesco Messina, Luisa Marchioni, Giuseppe Ippolito, Antonino Di Caro, Maria Rosaria Capobianchi
Published 2020-08-01

SARS-CoV-2 Early Screening at the Point of Entry: Travelers From Bangladesh to Italy–July 2020

by Martina Rueca, Antonino Di Caro, Cesare Ernesto Maria Gruber, Francesco Messina, Emanuela Giombini, Maria Beatrice Valli, Eleonora Lalle, Simone Lanini, Francesco Vairo, Maria Rosaria Capobianchi, Barbara Bartolini
Published 2021-02-01

Looking for pathways related to COVID-19: confirmation of pathogenic mechanisms by SARS-CoV-2–host interactome

by Francesco Messina, Emanuela Giombini, Chiara Montaldo, Ashish Arunkumar Sharma, Antonio Zoccoli, Rafick-Pierre Sekaly, Franco Locatelli, Alimuddin Zumla, Markus Maeurer, Maria R. Capobianchi, Francesco Nicola Lauria, Giuseppe Ippolito
Published 2021-08-01

SARS-CoV-2 Phylogenetic Analysis, Lazio Region, Italy, February–March 2020

by Barbara Bartolini, Martina Rueca, Cesare Ernesto Maria Gruber, Francesco Messina, Fabrizio Carletti, Emanuela Giombini, Eleonora Lalle, Licia Bordi, Giulia Matusali, Francesca Colavita, Concetta Castilletti, Francesco Vairo, Giuseppe Ippolito, Maria Rosaria Capobianchi, Antonino Di Caro
Published 2020-08-01

Molecular Transmission Dynamics of Primary HIV Infections in Lazio Region, Years 2013–2020

by Lavinia Fabeni, Gabriella Rozera, Giulia Berno, Emanuela Giombini, Caterina Gori, Nicoletta Orchi, Gabriella De Carli, Silvia Pittalis, Vincenzo Puro, Carmela Pinnetti, Annalisa Mondi, Marta Camici, Maria Maddalena Plazzi, Andrea Antinori, Maria Rosaria Capobianchi, Isabella Abbate
Published 2021-01-01

Rationale and Criteria for a COVID-19 Model Framework

by Francesco Messina, Chiara Montaldo, Isabella Abbate, Manuela Antonioli, Veronica Bordoni, Giulia Matusali, Alessandra Sacchi, Emanuela Giombini, Gian Maria Fimia, Mauro Piacentini, Maria Rosaria Capobianchi, Francesco Nicola Lauria, Giuseppe Ippolito, on behalf of COVID-19 Scoping Review Working Group
Published 2021-07-01

Whole Genome Characterization of Orthopoxvirus (OPV) Abatino, a Zoonotic Virus Representing a Putative Novel Clade of Old World Orthopoxviruses

by Cesare E. M. Gruber, Emanuela Giombini, Marina Selleri, Simon H. Tausch, Andreas Andrusch, Alona Tyshaieva, Giusy Cardeti, Raniero Lorenzetti, Lorenzo De Marco, Fabrizio Carletti, Andreas Nitsche, Maria R. Capobianchi, Giuseppe Ippolito, Gian Luca Autorino, Concetta Castilletti
Published 2018-10-01

COVID-19: viral–host interactome analyzed by network based-approach model to study pathogenesis of SARS-CoV-2 infection

by Francesco Messina, Emanuela Giombini, Chiara Agrati, Francesco Vairo, Tommaso Ascoli Bartoli, Samir Al Moghazi, Mauro Piacentini, Franco Locatelli, Gary Kobinger, Markus Maeurer, Alimuddin Zumla, Maria R. Capobianchi, Francesco Nicola Lauria, Giuseppe Ippolito, COVID 19 INMI Network Medicine for IDs Study Group
Published 2020-06-01

Fatal Outbreak in Tonkean Macaques Caused by Possibly Novel Orthopoxvirus, Italy, January 2015

by Giusy Cardeti, Cesare Ernesto Maria Gruber, Claudia Eleni, Fabrizio Carletti, Concetta Castilletti, Giuseppe Manna, Francesca Rosone, Emanuela Giombini, Marina Selleri, Daniele Lapa, Vincenzo Puro, Antonino Di Caro, Raniero Lorenzetti, Maria Teresa Scicluna, Goffredo Grifoni, Annapaola Rizzoli, Valentina Tagliapietra, Lorenzo De Marco, Maria Rosaria Capobianchi, Gian Luca Autorino
Published 2017-12-01

Chikungunya Outbreak in the Republic of the Congo, 2019—Epidemiological, Virological and Entomological Findings of a South-North Multidisciplinary Taskforce Investigation

by Francesco Vairo, Martin Parfait Aimè Coussoud-Mavoungou, Francine Ntoumi, Concetta Castilletti, Lambert Kitembo, Najmul Haider, Fabrizio Carletti, Francesca Colavita, Cesare E.M. Gruber, Marco Iannetta, Francesco Messina, Simone Lanini, Biez Ulrich Judicaël, Emanuela Giombini, Chiara Montaldo, Chantal Portella, Steve Diafouka-Diatela, Martina Rueca, Richard Kock, Barbara Bartolini, Leonard Mboera, Vincent Munster, Robert Fischer, Stephanie Seifert, César Muñoz-Fontela, Beatriz Escudero-Pérez, Sergio Gomez-Medina, Emily V. Nelson, Patrick Kjia Tungu, Emanuele Nicastri, Vincenzo Puro, Antonino Di Caro, Maria Rosaria Capobianchi, Jacqueline Lydia Mikolo, Alimuddin Zumla, Giuseppe Ippolito, the Pandora-ID-NET consortium Chikungunya Outbreak Group Taskforce
Published 2020-09-01

Down Syndrome patients with COVID-19 pneumonia: A high-risk category for unfavourable outcome

by Serena Vita, Virginia Di Bari, Angela Corpolongo, Delia Goletti, Joaquin Espinosa, Sebastiano Petracca, Fabrizio Palmieri, Emanuele Nicastri, Abbonizio, Chiara Agrati, Fabrizio Albarello, Gioia Amadei, Alessandra Amendola, Mario Antonini, Raffaella Barbaro, Barbara Bartolini, Martina Benigni, Nazario Bevilacqua, Licia Bordi, Veronica Bordoni, Marta Branca, Paolo Campioni, Maria Rosaria Capobianchi, Cinzia Caporale, Ilaria Caravella, Fabrizio Carletti, Concetta Castilletti, Roberta Chiappini, Carmine Ciaralli, Francesca Colavita, Angela Corpolongo, Massimo Cristofaro, Salvatore Curiale, Alessandra D’Abramo, Cristina Dantimi, Alessia De Angelis, Giada De Angelis, Rachele Di Lorenzo, Federica Di Stefano, Federica Ferraro, Lorena Fiorentini, Andrea Frustaci, Paola Gallì, Gabriele Garotto, Maria Letizia Giancola, Filippo Giansante, Emanuela Giombini, Maria Cristina Greci, Giuseppe Ippolito, Eleonora Lalle, Simone Lanini, Daniele Lapa, Luciana Lepore, Andrea Lucia, Franco Lufrani, Manuela Macchione, Alessandra Marani, Luisa Marchioni, Andrea Mariano, Maria Cristina Marini, Micaela Maritti, Giulia Matusali, Silvia Meschi, Francesco Messina Chiara Montaldo, Silvia Murachelli, Emanuele Nicastri, Roberto Noto, Claudia Palazzolo, Emanuele Pallini, Virgilio Passeri, Federico Pelliccioni, Antonella Petrecchia, Ada Petrone, Nicola Petrosillo, Elisa Pianura, Maria Pisciotta, Silvia Pittalis, Costanza Proietti, Vincenzo Puro, Gabriele Rinonapoli, Martina Rueca, Alessandra Sacchi, Francesco Sanasi, Carmen Santagata, Silvana Scarcia, Vincenzo Schininà, Paola Scognamiglio, Laura Scorzolini, Giulia Stazi, Francesco Vaia, Francesco Vairo, Maria Beatrice Valli
Published 2021-02-01

2019-novel Coronavirus severe adult respiratory distress syndrome in two cases in Italy: An uncommon radiological presentation

by Fabrizio Albarello, Elisa Pianura, Federica Di Stefano, Massimo Cristofaro, Ada Petrone, Luisa Marchioni, Claudia Palazzolo, Vincenzo Schininà, Emanuele Nicastri, Nicola Petrosillo, Paolo Campioni, Petersen Eskild, Alimuddin Zumla, Giuseppe Ippolito, Maria Alessandra Abbonizio, Chiara Agrati, Fabrizio Albarello, Gioia Amadei, Alessandra Amendola, Mario Antonini, Raffaella Barbaro, Barbara Bartolini, Martina Benigni, Nazario Bevilacqua, Licia Bordi, Veronica Bordoni, Marta Branca, Paolo Campioni, Maria Rosaria Capobianchi, Cinzia Caporale, Ilaria Caravella, Fabrizio Carletti, Concetta Castilletti, Roberta Chiappini, Carmine Ciaralli, Francesca Colavita, Angela Corpolongo, Massimo Cristofaro, Salvatore Curiale, Alessandra D’Abramo, Cristina Dantimi, Alessia De Angelis, Giada De Angelis, Rachele Di Lorenzo, Federica Di Stefano, Federica Ferraro, Lorena Fiorentini, Andrea Frustaci, Paola Gallì, Gabriele Garotto, Maria Letizia Giancola, Filippo Giansante, Emanuela Giombini, Maria Cristina Greci, Giuseppe Ippolito, Eleonora Lalle, Simone Lanini, Daniele Lapa, Luciana Lepore, Andrea Lucia, Franco Lufrani, Manuela Macchione, Alessandra Marani, Luisa Marchioni, Andrea Mariano, Maria Cristina Marini, Micaela Maritti, Giulia Matusali, Silvia Meschi, Francesco Messina Chiara Montaldo, Silvia Murachelli, Emanuele Nicastri, Roberto Noto, Claudia Palazzolo, Emanuele Pallini, Virgilio Passeri, Federico Pelliccioni, Antonella Petrecchia, Ada Petrone, Nicola Petrosillo, Elisa Pianura, Maria Pisciotta, Silvia Pittalis, Costanza Proietti, Vincenzo Puro, Gabriele Rinonapoli, Martina Rueca, Alessandra Sacchi, Francesco Sanasi, Carmen Santagata, Silvana Scarcia, Vincenzo Schininà, Paola Scognamiglio, Laura Scorzolini, Giulia Stazi, Francesco Vaia, Francesco Vairo, Maria Beatrice Valli
Published 2020-04-01

Risk and predictive factors of prolonged viral RNA shedding in upper respiratory specimens in a large cohort of COVID-19 patients admitted to an Italian reference hospital

by Annalisa Mondi, Patrizia Lorenzini, Concetta Castilletti, Roberta Gagliardini, Eleonora Lalle, Angela Corpolongo, Maria Beatrice Valli, Fabrizio Taglietti, Stefania Cicalini, Laura Loiacono, Francesco Di Gennaro, Gianpiero D’Offizi, Fabrizio Palmieri, Emanuele Nicastri, Chiara Agrati, Nicola Petrosillo, Giuseppe Ippolito, Francesco Vaia, Enrico Girardi, Maria Rosaria Capobianchi, Andrea Antinori, Sara Zito, Maria Alessandra Abbonizio, Amina Abdeddaim, Elisabetta Agostini, Chiara Agrati, Fabrizio Albarello, Gioia Amadei, Alessandra Amendola, Andrea Antinori, Maria Assunta Antonica, Mario Antonini, Tommaso Ascoli Bartoli, Francesco Baldini, Raffaella Barbaro, Barbara Bartolini, Rita Bellagamba, Martina Benigni, Nazario Bevilacqua, Gianluigi Biava, Michele Bibas, Licia Bordi, Veronica Bordoni, Evangelo Boumis, Marta Branca, Rosanna Buonomo, Donatella Busso, Marta Camici, Paolo Campioni, Flaminia Canichella, Maria Rosaria Capobianchi, Alessandro Capone, Cinzia Caporale, Emanuela Caraffa, Ilaria Caravella, Fabrizio Carletti, Concetta Castilletti, Adriana Cataldo, Stefano Cerilli, Carlotta Cerva, Roberta Chiappini, Pierangelo Chinello, Maria Assunta Cianfarani, Carmine Ciaralli, Claudia Cimaglia, Nicola Cinicola, Veronica Ciotti, Stefania Cicalini, Francesca Colavita, Angela Corpolongo, Massimo Cristofaro, Salvatore Curiale, Alessandra D’Abramo, Cristina Dantimi, Alessia De Angelis, Giada De Angelis, Maria Grazia De Palo, Federico De Zottis, Virginia Di Bari, Rachele Di Lorenzo, Federica Di Stefano, Gianpiero D’Offizi, Davide Donno, Francesca Evangelista, Francesca Faraglia, Anna Farina, Federica Ferraro, Lorena Fiorentini, Andrea Frustaci, Matteo Fusetti, Vincenzo Galati, Roberta Gagliardini, Paola Gallì, Gabriele Garotto, Ilaria Gaviano, Saba Gebremeskel Tekle, Maria Letizia Giancola, Filippo Giansante, Emanuela Giombini, Guido Granata, Maria Cristina Greci, Elisabetta Grilli, Susanna Grisetti, Gina Gualano, Fabio Iacomi, Marta Iaconi, Giuseppina Iannicelli, Carlo Inversi, Giuseppe Ippolito, Eleonora Lalle, Maria Elena Lamanna, Simone Lanini, Daniele Lapa, Luciana Lepore, Raffaella Libertone, Raffaella Lionetti, Giuseppina Liuzzi, Laura Loiacono, Andrea Lucia, Franco Lufrani, Manuela Macchione, Gaetano Maffongelli, Alessandra Marani, Luisa Marchioni, Andrea Mariano, Maria Cristina Marini, Micaela Maritti, Annelisa Mastrobattista, Ilaria Mastrorosa, Giulia Matusali, Valentina Mazzotta, Paola Mencarini, Silvia Meschi, Francesco Messina, Sibiana Micarelli, Giulia Mogavero, Annalisa Mondi, Marzia Montalbano, Chiara Montaldo, Silvia Mosti, Silvia Murachelli, Maria Musso, Michela Nardi, Assunta Navarra, Emanuele Nicastri, Martina Nocioni, Pasquale Noto, Roberto Noto, Alessandra Oliva, Ilaria Onnis, Sandrine Ottou, Claudia Palazzolo, Emanuele Pallini, Fabrizio Palmieri, Giulio Palombi, Carlo Pareo, Virgilio Passeri, Federico Pelliccioni, Giovanna Penna, Antonella Petrecchia, Ada Petrone, Nicola Petrosillo, Elisa Pianura, Carmela Pinnetti, Maria Pisciotta, Pierluca Piselli, Silvia Pittalis, Agostina Pontarelli, Costanza Proietti, Vincenzo Puro, Paolo Migliorisi Ramazzini, Alessia Rianda, Gabriele Rinonapoli, Silvia Rosati, Dorotea Rubino, Martina Rueca, Alberto Ruggeri, Alessandra Sacchi, Alessandro Sampaolesi, Francesco Sanasi, Carmen Santagata, Alessandra Scarabello, Silvana Scarcia, Vincenzo Schininà, Paola Scognamiglio, Laura Scorzolini, Giulia Stazi, Giacomo Strano, Fabrizio Taglietti, Chiara Taibi, Giorgia Taloni, Tetaj Nardi, Roberto Tonnarini, Simone Topino, Martina Tozzi, Francesco Vaia, Francesco Vairo, Maria Beatrice Valli, Alessandra Vergori, Laura Vincenzi, Ubaldo Visco-Comandini, Serena Vita, Pietro Vittozzi, Mauro Zaccarelli, Antonella Zanetti, Sara Zito, Maria Alessandra Abbonizio, Amina Abdeddaim, Elisabetta Agostini, Chiara Agrati, Fabrizio Albarello, Gioia Amadei, Alessandra Amendola, Andrea Antinori, Maria Assunta Antonica, Mario Antonini, Tommaso Ascoli Bartoli, Francesco Baldini, Raffaella Barbaro, Barbara Bartolini, Rita Bellagamba, Martina Benigni, Nazario Bevilacqua, Gianluigi Biava, Michele Bibas, Licia Bordi, Veronica Bordoni, Evangelo Boumis, Marta Branca, Rosanna Buonomo, Donatella Busso, Marta Camici, Paolo Campioni, Flaminia Canichella, Maria Rosaria Capobianchi, Alessandro Capone, Cinzia Caporale, Emanuela Caraffa, Ilaria Caravella, Fabrizio Carletti, Concetta Castilletti, Adriana Cataldo, Stefano Cerilli, Carlotta Cerva, Roberta Chiappini, Pierangelo Chinello, Maria Assunta Cianfarani, Carmine Ciaralli, Claudia Cimaglia, Nicola Cinicola, Veronica Ciotti, Stefania Cicalini, Francesca Colavita, Angela Corpolongo, Massimo Cristofaro, Salvatore Curiale, Alessandra D’Abramo, Cristina Dantimi, Alessia De Angelis, Giada De Angelis, Maria Grazia De Palo, Federico De Zottis, Virginia Di Bari, Rachele Di Lorenzo, Federica Di Stefano, Gianpiero D’Offizi, Davide Donno, Francesca Evangelista, Francesca Faraglia, Anna Farina, Federica Ferraro, Lorena Fiorentini, Andrea Frustaci, Matteo Fusetti, Vincenzo Galati, Roberta Gagliardini, Paola Gallì, Gabriele Garotto, Ilaria Gaviano, Saba Gebremeskel Tekle, Maria Letizia Giancola, Filippo Giansante, Emanuela Giombini, Guido Granata, Maria Cristina Greci, Elisabetta Grilli, Susanna Grisetti, Gina Gualano, Fabio Iacomi, Marta Iaconi, Giuseppina Iannicelli, Carlo Inversi, Giuseppe Ippolito, Eleonora Lalle, Maria Elena Lamanna, Simone Lanini, Daniele Lapa, Luciana Lepore, Raffaella Libertone, Raffaella Lionetti, Giuseppina Liuzzi, Laura Loiacono, Andrea Lucia, Franco Lufrani, Manuela Macchione, Gaetano Maffongelli, Alessandra Marani, Luisa Marchioni, Andrea Mariano, Maria Cristina Marini, Micaela Maritti, Annelisa Mastrobattista, Ilaria Mastrorosa, Giulia Matusali, Valentina Mazzotta, Paola Mencarini, Silvia Meschi, Francesco Messina, Sibiana Micarelli, Giulia Mogavero, Annalisa Mondi, Marzia Montalbano, Chiara Montaldo, Silvia Mosti, Silvia Murachelli, Maria Musso, Michela Nardi, Assunta Navarra, Emanuele Nicastri, Martina Nocioni, Pasquale Noto, Roberto Noto, Alessandra Oliva, Ilaria Onnis, Sandrine Ottou, Claudia Palazzolo, Emanuele Pallini, Fabrizio Palmieri, Giulio Palombi, Carlo Pareo, Virgilio Passeri, Federico Pelliccioni, Giovanna Penna, Antonella Petrecchia, Ada Petrone, Nicola Petrosillo, Elisa Pianura, Carmela Pinnetti, Maria Pisciotta, Pierluca Piselli, Silvia Pittalis, Agostina Pontarelli, Costanza Proietti, Vincenzo Puro, Paolo Migliorisi Ramazzini, Alessia Rianda, Gabriele Rinonapoli, Silvia Rosati, Dorotea Rubino, Martina Rueca, Alberto Ruggeri, Alessandra Sacchi, Alessandro Sampaolesi, Francesco Sanasi, Carmen Santagata, Alessandra Scarabello, Silvana Scarcia, Vincenzo Schininà, Paola Scognamiglio, Laura Scorzolini, Giulia Stazi, Giacomo Strano, Fabrizio Taglietti, Chiara Taibi, Giorgia Taloni, Tetaj Nardi, Roberto Tonnarini, Simone Topino, Martina Tozzi, Francesco Vaia, Francesco Vairo, Maria Beatrice Valli, Alessandra Vergori, Laura Vincenzi, Ubaldo Visco-Comandini, Serena Vita, Pietro Vittozzi, Mauro Zaccarelli, Antonella Zanetti, Sara Zito
Published 2021-04-01